Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JH99

Protein Details
Accession A0A4T0JH99    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-83ADSRGGRRRSRSPRHRPTRAETSHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-78RRSDKDERHWRAERDIRDGRSRRDVRDADSRGGRRRSRSPRHRPTR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MVAGQRVISVTIMLDYGDGGDGRRYGRNSRDDRRSDKDERHWRAERDIRDGRSRRDVRDADSRGGRRRSRSPRHRPTRAETSHHKVGGLDLRDGSAADRERMLKQIQSKEAEEERKRVEEEHRAIEEGERKAKDAEQRKPEDQEEEDDDEVDQDTLAMQQMMGFGGFDSTKGKKVSGNEEGAAKVHQPRTYRQYMNRVGGFNRALDKPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.08
8 0.09
9 0.12
10 0.17
11 0.19
12 0.24
13 0.32
14 0.41
15 0.48
16 0.56
17 0.64
18 0.67
19 0.71
20 0.73
21 0.73
22 0.71
23 0.7
24 0.72
25 0.73
26 0.73
27 0.74
28 0.73
29 0.68
30 0.7
31 0.69
32 0.62
33 0.6
34 0.6
35 0.55
36 0.58
37 0.6
38 0.56
39 0.59
40 0.59
41 0.53
42 0.56
43 0.53
44 0.48
45 0.54
46 0.52
47 0.46
48 0.5
49 0.52
50 0.5
51 0.56
52 0.55
53 0.5
54 0.57
55 0.62
56 0.66
57 0.73
58 0.76
59 0.8
60 0.86
61 0.9
62 0.85
63 0.82
64 0.82
65 0.76
66 0.7
67 0.66
68 0.64
69 0.6
70 0.55
71 0.47
72 0.36
73 0.34
74 0.33
75 0.27
76 0.2
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.12
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.19
92 0.24
93 0.26
94 0.27
95 0.27
96 0.29
97 0.32
98 0.38
99 0.34
100 0.33
101 0.31
102 0.3
103 0.3
104 0.28
105 0.28
106 0.29
107 0.3
108 0.32
109 0.3
110 0.29
111 0.29
112 0.29
113 0.31
114 0.25
115 0.27
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.25
120 0.3
121 0.33
122 0.4
123 0.43
124 0.49
125 0.51
126 0.54
127 0.53
128 0.5
129 0.42
130 0.38
131 0.34
132 0.31
133 0.28
134 0.24
135 0.23
136 0.19
137 0.18
138 0.13
139 0.08
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.1
156 0.11
157 0.16
158 0.17
159 0.18
160 0.21
161 0.25
162 0.33
163 0.37
164 0.39
165 0.35
166 0.36
167 0.36
168 0.34
169 0.3
170 0.24
171 0.24
172 0.24
173 0.27
174 0.28
175 0.34
176 0.42
177 0.49
178 0.55
179 0.56
180 0.61
181 0.66
182 0.71
183 0.68
184 0.63
185 0.56
186 0.55
187 0.49
188 0.41
189 0.38