Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IYP6

Protein Details
Accession A0A4T0IYP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-56RECGHRIMYKQRTKRSESNSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013961  RAI1  
IPR039039  RAI1-like_fam  
IPR006591  RNAP_P/RPABC4  
IPR029040  RPABC4/Spt4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF03604  DNA_RNApol_7kD  
PF08652  RAI1  
Amino Acid Sequences MNTINNPMEDKNMIMKYLCADCASPNEIKPREPIRCRECGHRIMYKQRTKRSESNSMLVNSFKLPNHAQQLPPIQVSYPTQLTTFSINKDRYILYNNSQLSYYNDARLSIGSDLNFGVEGMVFNENIEHLDNLLLAIDHYKLDWWSYNVITFRGILTKLTTALYNYDDNWCLNCMLIHNSIFISDNSPPAKPSSEWHKRAMYNGYAFEGLATGAPHTPTNNSAQWATINKLRFGKHKILTAGEVDCASTDQSHQQHLYTPHQDDYIELKTSIQIQSPAQQDRFDQKLLKFYFQSYLLGVPKIVVGFKNKSGILVDVKEYDTLSLPNLVRGSNYAWNHKTCTSLAEMLIEFVRETITSIGDESKMYKVFYSAADRTISIQVTHLDDISYPTPDPFPRYGFMPAHLHARMRECVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.24
4 0.26
5 0.25
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.24
10 0.27
11 0.26
12 0.27
13 0.35
14 0.36
15 0.37
16 0.43
17 0.47
18 0.53
19 0.57
20 0.63
21 0.61
22 0.68
23 0.69
24 0.71
25 0.69
26 0.67
27 0.66
28 0.65
29 0.65
30 0.67
31 0.74
32 0.74
33 0.75
34 0.77
35 0.78
36 0.78
37 0.8
38 0.78
39 0.78
40 0.73
41 0.69
42 0.65
43 0.6
44 0.53
45 0.45
46 0.38
47 0.3
48 0.28
49 0.24
50 0.23
51 0.24
52 0.29
53 0.35
54 0.37
55 0.35
56 0.37
57 0.43
58 0.42
59 0.39
60 0.34
61 0.28
62 0.26
63 0.28
64 0.26
65 0.22
66 0.19
67 0.18
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.28
74 0.29
75 0.29
76 0.31
77 0.3
78 0.27
79 0.31
80 0.31
81 0.27
82 0.33
83 0.34
84 0.32
85 0.31
86 0.3
87 0.27
88 0.3
89 0.28
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.23
94 0.23
95 0.2
96 0.15
97 0.15
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.07
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.14
179 0.17
180 0.23
181 0.32
182 0.36
183 0.39
184 0.43
185 0.42
186 0.45
187 0.46
188 0.39
189 0.31
190 0.28
191 0.24
192 0.19
193 0.18
194 0.15
195 0.11
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.3
221 0.37
222 0.36
223 0.39
224 0.38
225 0.35
226 0.34
227 0.32
228 0.27
229 0.19
230 0.16
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.11
238 0.13
239 0.15
240 0.16
241 0.16
242 0.21
243 0.25
244 0.3
245 0.29
246 0.3
247 0.28
248 0.28
249 0.28
250 0.24
251 0.25
252 0.22
253 0.18
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.19
258 0.18
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.2
263 0.24
264 0.28
265 0.26
266 0.26
267 0.27
268 0.3
269 0.33
270 0.29
271 0.29
272 0.26
273 0.34
274 0.35
275 0.36
276 0.32
277 0.3
278 0.31
279 0.28
280 0.27
281 0.19
282 0.22
283 0.2
284 0.19
285 0.17
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.1
291 0.14
292 0.17
293 0.2
294 0.24
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.25
299 0.23
300 0.21
301 0.21
302 0.19
303 0.2
304 0.19
305 0.18
306 0.16
307 0.13
308 0.12
309 0.11
310 0.15
311 0.14
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.18
317 0.21
318 0.23
319 0.25
320 0.31
321 0.34
322 0.36
323 0.39
324 0.39
325 0.38
326 0.3
327 0.3
328 0.27
329 0.25
330 0.23
331 0.22
332 0.21
333 0.19
334 0.19
335 0.17
336 0.12
337 0.09
338 0.1
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.17
353 0.16
354 0.18
355 0.21
356 0.27
357 0.24
358 0.26
359 0.27
360 0.27
361 0.29
362 0.31
363 0.28
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.22
368 0.23
369 0.2
370 0.16
371 0.15
372 0.2
373 0.19
374 0.19
375 0.16
376 0.16
377 0.2
378 0.22
379 0.27
380 0.27
381 0.29
382 0.28
383 0.31
384 0.37
385 0.34
386 0.37
387 0.38
388 0.36
389 0.39
390 0.39
391 0.39
392 0.36
393 0.4