Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IJ38

Protein Details
Accession A0A4T0IJ38    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-36GADIPERRTKPKNNQCIKCKTAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019407  CTU2  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF10288  CTU2  
Amino Acid Sequences MSCSNPQSEVKDPGADIPERRTKPKNNQCIKCKTAAPVIQIRHALYCRECFVYATSGKFLKWFLSNFKPNDVHPVFYVAVSGGPSSRYLLQLLHTQMSPRKGKGSFIRPGSAEKLVVIYVDQSKVVPGAENLRNHIEDMVKDFPSVEIIEADVSESWKGSQASISAYLSGQPGQPPSATASEPTADLFDSTLSTSSQESHLALLTHHIILREARKHADSLLGKDSTAPLFLGTSATRVTIKLLSSMSRGRGWSVGSGEVQPESTQYGLNVYQPLLNTSSKEIAYYNRFAIPAHSQAVVNRSFITFSPPKSSIDRLTEELVVSLERGFPSTVSTVARTGNKISFAGETKEGERLCTLCGWPARAKANEWKNGIAITKLAGEEDESNPLADMLCYGCYTNLTDSRARSHVNYALPGWTDEYAEKQKVTESEMRKEIEDCLIDDNDNDNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.33
4 0.35
5 0.42
6 0.43
7 0.5
8 0.54
9 0.59
10 0.67
11 0.75
12 0.78
13 0.79
14 0.85
15 0.88
16 0.89
17 0.84
18 0.79
19 0.72
20 0.66
21 0.65
22 0.59
23 0.56
24 0.54
25 0.52
26 0.51
27 0.5
28 0.46
29 0.42
30 0.39
31 0.37
32 0.32
33 0.33
34 0.31
35 0.31
36 0.3
37 0.26
38 0.27
39 0.29
40 0.29
41 0.27
42 0.28
43 0.26
44 0.26
45 0.26
46 0.25
47 0.21
48 0.23
49 0.24
50 0.27
51 0.36
52 0.44
53 0.44
54 0.51
55 0.5
56 0.46
57 0.53
58 0.47
59 0.4
60 0.32
61 0.35
62 0.28
63 0.25
64 0.25
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.15
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.23
83 0.26
84 0.33
85 0.35
86 0.31
87 0.35
88 0.33
89 0.4
90 0.45
91 0.49
92 0.49
93 0.48
94 0.51
95 0.45
96 0.48
97 0.45
98 0.38
99 0.3
100 0.23
101 0.2
102 0.16
103 0.15
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.15
116 0.2
117 0.21
118 0.24
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.2
124 0.16
125 0.19
126 0.2
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.1
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.1
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.19
203 0.18
204 0.23
205 0.2
206 0.2
207 0.22
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.13
213 0.12
214 0.09
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.14
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.16
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.2
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.17
282 0.18
283 0.22
284 0.2
285 0.17
286 0.15
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.2
291 0.19
292 0.19
293 0.25
294 0.26
295 0.28
296 0.3
297 0.34
298 0.32
299 0.34
300 0.35
301 0.31
302 0.32
303 0.3
304 0.27
305 0.24
306 0.19
307 0.14
308 0.11
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.22
325 0.22
326 0.23
327 0.22
328 0.21
329 0.2
330 0.2
331 0.22
332 0.21
333 0.21
334 0.2
335 0.25
336 0.24
337 0.22
338 0.21
339 0.18
340 0.17
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.2
345 0.23
346 0.25
347 0.3
348 0.35
349 0.34
350 0.38
351 0.42
352 0.49
353 0.52
354 0.52
355 0.48
356 0.42
357 0.42
358 0.39
359 0.3
360 0.22
361 0.16
362 0.15
363 0.13
364 0.13
365 0.1
366 0.11
367 0.14
368 0.15
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.14
375 0.1
376 0.1
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.17
385 0.2
386 0.23
387 0.27
388 0.29
389 0.34
390 0.36
391 0.37
392 0.34
393 0.35
394 0.37
395 0.37
396 0.38
397 0.34
398 0.33
399 0.32
400 0.3
401 0.27
402 0.21
403 0.2
404 0.17
405 0.23
406 0.27
407 0.28
408 0.28
409 0.26
410 0.29
411 0.29
412 0.35
413 0.37
414 0.36
415 0.41
416 0.47
417 0.48
418 0.45
419 0.45
420 0.41
421 0.39
422 0.34
423 0.27
424 0.26
425 0.26
426 0.24
427 0.24