Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J6B3

Protein Details
Accession A0A4T0J6B3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
457-502NTKKGDTCYKCNKKGHWASNCPNEGKPPAKRKTYTKKSTQKKQRRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
482-502KPPAKRKTYTKKSTQKKQRRT
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000380  Topo_IA  
IPR013497  Topo_IA_cen  
IPR013824  Topo_IA_cen_sub1  
IPR013825  Topo_IA_cen_sub2  
IPR013826  Topo_IA_cen_sub3  
IPR023405  Topo_IA_core_domain  
IPR003602  Topo_IA_DNA-bd_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
IPR010666  Znf_GRF  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF01131  Topoisom_bac  
PF00098  zf-CCHC  
PF06839  zf-GRF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
PS51999  ZF_GRF  
Amino Acid Sequences NDKAHPPIHPTAHAPSLSGNEKRVYELITRRFLASCSKDAKGKNTTAELEMAGEIFKASGSVLIEKNYLEVYIYEKWSNQTIPNFEQGEVFQPSICELREGKTTPPTLLTEADLVSLMDKNGIGTDATIAEHIHKIIDREYVMEHKLGSTKYLVPSTLGVALVEGYNKMNFDKSFAKPQLRRENEEKMNMIGEGIAQKSDVLLESINQYRDIYNRSALQFTTLVNSVKHYLQNADAFDDNVIAENDKNARGEDEGGGGFGGFNNNNNNDNSDSDMDDATPPPRGRGRPRGTTSQRTTGASRTSRSNGNASEFRVTQMYEPPTKSNSNHKAQPPKEGQVRCKCDLSAKRFVTSQGANKGRAFWKCPNTSKTAQCGFWSWEDSMDSPNTSAQVVDDSEEDLLGDELIADDDGEIPYCDLCSRNGHWPARCTNPTTGPAPKSTSTVKSKKSSSSGVGVNNTKKGDTCYKCNKKGHWASNCPNEGKPPAKRKTYTKKSTQKKQRRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.34
4 0.37
5 0.36
6 0.34
7 0.32
8 0.32
9 0.35
10 0.34
11 0.31
12 0.32
13 0.38
14 0.42
15 0.45
16 0.46
17 0.45
18 0.44
19 0.42
20 0.44
21 0.4
22 0.4
23 0.38
24 0.4
25 0.44
26 0.46
27 0.53
28 0.51
29 0.5
30 0.48
31 0.48
32 0.48
33 0.44
34 0.42
35 0.34
36 0.28
37 0.23
38 0.18
39 0.13
40 0.1
41 0.08
42 0.06
43 0.06
44 0.04
45 0.04
46 0.06
47 0.08
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.17
52 0.16
53 0.17
54 0.15
55 0.14
56 0.1
57 0.09
58 0.12
59 0.16
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.25
65 0.27
66 0.28
67 0.29
68 0.32
69 0.34
70 0.39
71 0.39
72 0.36
73 0.35
74 0.31
75 0.3
76 0.27
77 0.24
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.15
84 0.13
85 0.15
86 0.21
87 0.23
88 0.25
89 0.3
90 0.31
91 0.29
92 0.31
93 0.3
94 0.26
95 0.25
96 0.23
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.07
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.15
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.16
132 0.14
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.17
138 0.19
139 0.21
140 0.2
141 0.17
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.1
157 0.1
158 0.14
159 0.19
160 0.21
161 0.3
162 0.35
163 0.43
164 0.44
165 0.54
166 0.61
167 0.6
168 0.63
169 0.59
170 0.63
171 0.59
172 0.59
173 0.5
174 0.4
175 0.36
176 0.3
177 0.25
178 0.15
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.08
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.14
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.18
202 0.19
203 0.19
204 0.18
205 0.19
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.06
250 0.08
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.16
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.09
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.18
270 0.22
271 0.29
272 0.39
273 0.45
274 0.49
275 0.53
276 0.61
277 0.64
278 0.68
279 0.65
280 0.62
281 0.58
282 0.51
283 0.48
284 0.42
285 0.42
286 0.35
287 0.32
288 0.29
289 0.3
290 0.31
291 0.32
292 0.32
293 0.27
294 0.29
295 0.3
296 0.28
297 0.28
298 0.25
299 0.23
300 0.2
301 0.19
302 0.15
303 0.19
304 0.21
305 0.22
306 0.23
307 0.25
308 0.27
309 0.3
310 0.32
311 0.36
312 0.4
313 0.42
314 0.47
315 0.53
316 0.59
317 0.57
318 0.64
319 0.59
320 0.58
321 0.6
322 0.59
323 0.61
324 0.6
325 0.66
326 0.59
327 0.56
328 0.49
329 0.5
330 0.53
331 0.51
332 0.51
333 0.46
334 0.45
335 0.44
336 0.45
337 0.41
338 0.37
339 0.36
340 0.35
341 0.38
342 0.39
343 0.38
344 0.42
345 0.41
346 0.41
347 0.41
348 0.39
349 0.44
350 0.5
351 0.56
352 0.55
353 0.57
354 0.6
355 0.6
356 0.6
357 0.56
358 0.49
359 0.43
360 0.42
361 0.38
362 0.34
363 0.32
364 0.24
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.18
370 0.16
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.1
405 0.15
406 0.18
407 0.27
408 0.36
409 0.42
410 0.46
411 0.51
412 0.54
413 0.58
414 0.58
415 0.53
416 0.5
417 0.5
418 0.5
419 0.49
420 0.51
421 0.44
422 0.45
423 0.45
424 0.41
425 0.38
426 0.39
427 0.43
428 0.45
429 0.5
430 0.54
431 0.56
432 0.6
433 0.63
434 0.63
435 0.61
436 0.55
437 0.53
438 0.51
439 0.49
440 0.51
441 0.51
442 0.5
443 0.5
444 0.47
445 0.41
446 0.37
447 0.37
448 0.41
449 0.4
450 0.45
451 0.52
452 0.61
453 0.7
454 0.76
455 0.76
456 0.77
457 0.82
458 0.82
459 0.81
460 0.81
461 0.8
462 0.83
463 0.84
464 0.76
465 0.67
466 0.63
467 0.6
468 0.58
469 0.59
470 0.6
471 0.62
472 0.68
473 0.72
474 0.77
475 0.81
476 0.84
477 0.84
478 0.84
479 0.86
480 0.87
481 0.92
482 0.93