FuNGI

A0A4T0JGA5

Protein Details

Accession

A0A4T0JGA5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-105	DIPPIQQPSKHFKKKTKQVFMADES	Hydrophilic
469-490	SDLIQHFKKRFKAQPRNREVIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 26, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSKPYTDYKLISNNSNGFKYNVMKLNSNKQVDLSTLPQPLKLNRKDPNHLLTPVPKRDESGKIELDDNHNPILIDPITKQDIPPIQQPSKHFKKKTKQVFMADESTIELRKSERLPWIMESGDSIWQGQLDGKPQDQSYVMLIFNKNHDFKVEPTNKIYKFNPQPNYNTLSIDEADQIYSKGVDNPWFMRNKSSNDGGSVNDGAADNNNPSTSHQRLQSILNHAPDSSKPSTQKRMQVDRGEVKDETVDALFDEMEFDEEFQDDDEHVIQDNQDDDQLKELEDKIKKEMHQANIGHVEQTSNLDDVEEDIKPFQKSHTEKEMKRFLRRHDKSNAEAYDSDNSDDDQEEEEQRKKEQEEQEKRQLDAQENDKATSLTKSIKKEHTPASLAAQQVARRATSPYNKQRSSSPSSKRSRTDIDDRHDSKKIKVKRESMSPSASPSTPPSSADLQLLQEDEIIAFLRGKSLTTSDLIQHFKKRFKAQPRNREVIGSVLKKVASRTNDGKLQLKEGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.46
4	0.39
5	0.4
6	0.39
7	0.39
8	0.4
9	0.38
10	0.43
11	0.46
12	0.55
13	0.6
14	0.59
15	0.52
16	0.46
17	0.44
18	0.39
19	0.38
20	0.32
21	0.29
22	0.32
23	0.32
24	0.34
25	0.36
26	0.41
27	0.47
28	0.51
29	0.53
30	0.55
31	0.63
32	0.68
33	0.71
34	0.71
35	0.67
36	0.62
37	0.58
38	0.59
39	0.6
40	0.6
41	0.58
42	0.51
43	0.47
44	0.5
45	0.53
46	0.51
47	0.49
48	0.45
49	0.42
50	0.44
51	0.45
52	0.45
53	0.43
54	0.38
55	0.31
56	0.28
57	0.26
58	0.23
59	0.24
60	0.19
61	0.15
62	0.14
63	0.18
64	0.21
65	0.21
66	0.21
67	0.24
68	0.28
69	0.3
70	0.36
71	0.4
72	0.4
73	0.44
74	0.5
75	0.53
76	0.59
77	0.65
78	0.66
79	0.67
80	0.74
81	0.8
82	0.86
83	0.87
84	0.84
85	0.83
86	0.82
87	0.77
88	0.71
89	0.6
90	0.5
91	0.4
92	0.33
93	0.26
94	0.19
95	0.14
96	0.11
97	0.16
98	0.17
99	0.2
100	0.26
101	0.28
102	0.31
103	0.32
104	0.34
105	0.3
106	0.28
107	0.25
108	0.19
109	0.19
110	0.17
111	0.14
112	0.12
113	0.11
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.14
118	0.16
119	0.17
120	0.2
121	0.2
122	0.21
123	0.19
124	0.19
125	0.16
126	0.16
127	0.15
128	0.16
129	0.18
130	0.18
131	0.21
132	0.26
133	0.25
134	0.22
135	0.24
136	0.22
137	0.24
138	0.33
139	0.36
140	0.33
141	0.37
142	0.45
143	0.45
144	0.47
145	0.46
146	0.45
147	0.47
148	0.53
149	0.56
150	0.52
151	0.55
152	0.54
153	0.58
154	0.49
155	0.41
156	0.33
157	0.28
158	0.23
159	0.2
160	0.17
161	0.12
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.09
169	0.1
170	0.13
171	0.15
172	0.17
173	0.22
174	0.25
175	0.25
176	0.29
177	0.33
178	0.34
179	0.35
180	0.36
181	0.32
182	0.31
183	0.32
184	0.25
185	0.23
186	0.19
187	0.15
188	0.12
189	0.11
190	0.09
191	0.08
192	0.09
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.09
198	0.15
199	0.18
200	0.2
201	0.22
202	0.23
203	0.25
204	0.28
205	0.3
206	0.31
207	0.31
208	0.3
209	0.28
210	0.26
211	0.26
212	0.23
213	0.25
214	0.2
215	0.21
216	0.24
217	0.28
218	0.37
219	0.4
220	0.47
221	0.48
222	0.54
223	0.57
224	0.57
225	0.58
226	0.56
227	0.53
228	0.49
229	0.41
230	0.33
231	0.26
232	0.22
233	0.16
234	0.09
235	0.07
236	0.04
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.07
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.16
269	0.18
270	0.2
271	0.2
272	0.24
273	0.24
274	0.32
275	0.37
276	0.34
277	0.38
278	0.37
279	0.37
280	0.39
281	0.38
282	0.3
283	0.24
284	0.21
285	0.14
286	0.15
287	0.13
288	0.08
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.1
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.19
302	0.22
303	0.28
304	0.38
305	0.44
306	0.46
307	0.54
308	0.63
309	0.59
310	0.65
311	0.64
312	0.62
313	0.65
314	0.66
315	0.64
316	0.63
317	0.64
318	0.59
319	0.62
320	0.54
321	0.46
322	0.43
323	0.38
324	0.34
325	0.29
326	0.26
327	0.17
328	0.17
329	0.14
330	0.14
331	0.12
332	0.1
333	0.11
334	0.13
335	0.16
336	0.2
337	0.21
338	0.22
339	0.25
340	0.25
341	0.31
342	0.38
343	0.45
344	0.51
345	0.58
346	0.67
347	0.66
348	0.65
349	0.62
350	0.56
351	0.51
352	0.46
353	0.42
354	0.4
355	0.38
356	0.38
357	0.34
358	0.3
359	0.26
360	0.22
361	0.19
362	0.19
363	0.24
364	0.29
365	0.35
366	0.43
367	0.46
368	0.51
369	0.55
370	0.54
371	0.51
372	0.48
373	0.46
374	0.42
375	0.38
376	0.34
377	0.3
378	0.25
379	0.26
380	0.26
381	0.21
382	0.18
383	0.21
384	0.25
385	0.31
386	0.41
387	0.47
388	0.56
389	0.58
390	0.58
391	0.62
392	0.62
393	0.62
394	0.62
395	0.6
396	0.61
397	0.68
398	0.73
399	0.71
400	0.7
401	0.68
402	0.66
403	0.67
404	0.65
405	0.64
406	0.67
407	0.67
408	0.66
409	0.66
410	0.61
411	0.57
412	0.58
413	0.59
414	0.59
415	0.64
416	0.67
417	0.66
418	0.74
419	0.75
420	0.71
421	0.69
422	0.6
423	0.56
424	0.52
425	0.46
426	0.37
427	0.34
428	0.34
429	0.28
430	0.28
431	0.27
432	0.27
433	0.28
434	0.29
435	0.26
436	0.22
437	0.22
438	0.22
439	0.18
440	0.14
441	0.13
442	0.1
443	0.09
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.13
452	0.14
453	0.16
454	0.17
455	0.19
456	0.21
457	0.27
458	0.32
459	0.34
460	0.4
461	0.44
462	0.5
463	0.56
464	0.61
465	0.64
466	0.7
467	0.77
468	0.8
469	0.85
470	0.87
471	0.86
472	0.78
473	0.71
474	0.61
475	0.59
476	0.57
477	0.49
478	0.42
479	0.38
480	0.37
481	0.36
482	0.38
483	0.36
484	0.32
485	0.37
486	0.41
487	0.45
488	0.5
489	0.53
490	0.58
491	0.53

A0A4T0JGA5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer