FuNGI

A0A4T0IPF0

Protein Details

Accession

A0A4T0IPF0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
505-527	QDLLGRRRQKKVEHKTPEKHVAF	Basic
585-621	ARDRNETKEEKKARKQAAKSGKQSRRVEKKETKEAFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
321-324	RRKL
590-627	ETKEEKKARKQAAKSGKQSRRVEKKETKEAFAGERKSQ

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPVSIFKKPGAQKFQLVHRSQRDEGRDPSRDEGVLKRVEKGSEQASNSNNGNKNNKGKAGDAANFGIYYDDTQYDYTQHLRTIGGQDAYGDELDSVLIAAPANDAKSAKKGFMLKQQQEEEHQQAMLKAYESQTAIPLELQGFNPDMDPALRQTLEALEDDAYLEDDPGADELDELDDLNVAQESRNTQDADTLNSQWLDGLVSGGVRGSDEIVDFGPDEEEDPAITARKERERAEYERAKAAGEDLTPFHTSDWMERFKQFKLASKQEPQDGAASDDDELPSEVDTNEPSQMSDMSDYRSEGADTVGSLRSGIGAARTRRKLRKAGSDASGYSMSSSSMFRNDGLQSLDAQFDRIEEEYNSEDDDNPDDDDDDDEDFDPTSELNVTSREDFDTILDDFLDNYEVIGGKVKQKLEGETPLEKLNTMRLAMADLAPRGEQLKRHSDAASKRVTSAHRIAEGEEEEDDSALPLPFDVDAKEDRMDAETILSTYTNTENHPKQIRSQDLLGRRRQKKVEHKTPEKHVAFAEKEDVAPVKKVQIVVDPQTGFPMEVVEGEQGDHGQSESEGESYHSDTLATPKKTTIARDRNETKEEKKARKQAAKSGKQSRRVEKKETKEAFAGERKSQQSKSANEKKRVDVEASMRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.68
3	0.7
4	0.67
5	0.66
6	0.67
7	0.69
8	0.66
9	0.68
10	0.65
11	0.62
12	0.65
13	0.65
14	0.62
15	0.59
16	0.58
17	0.54
18	0.48
19	0.44
20	0.41
21	0.39
22	0.41
23	0.38
24	0.4
25	0.39
26	0.4
27	0.39
28	0.38
29	0.38
30	0.37
31	0.38
32	0.39
33	0.38
34	0.41
35	0.42
36	0.46
37	0.44
38	0.44
39	0.48
40	0.51
41	0.57
42	0.58
43	0.62
44	0.56
45	0.53
46	0.52
47	0.52
48	0.48
49	0.43
50	0.38
51	0.33
52	0.3
53	0.28
54	0.23
55	0.16
56	0.13
57	0.12
58	0.11
59	0.12
60	0.13
61	0.14
62	0.14
63	0.17
64	0.2
65	0.19
66	0.19
67	0.19
68	0.19
69	0.21
70	0.23
71	0.25
72	0.22
73	0.2
74	0.19
75	0.19
76	0.19
77	0.16
78	0.13
79	0.08
80	0.07
81	0.07
82	0.06
83	0.05
84	0.04
85	0.04
86	0.04
87	0.04
88	0.05
89	0.07
90	0.07
91	0.09
92	0.1
93	0.11
94	0.18
95	0.19
96	0.19
97	0.23
98	0.29
99	0.32
100	0.42
101	0.51
102	0.5
103	0.57
104	0.6
105	0.58
106	0.57
107	0.58
108	0.52
109	0.43
110	0.38
111	0.3
112	0.27
113	0.27
114	0.23
115	0.17
116	0.15
117	0.14
118	0.17
119	0.17
120	0.17
121	0.17
122	0.17
123	0.16
124	0.14
125	0.14
126	0.12
127	0.13
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.1
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.13
143	0.14
144	0.13
145	0.12
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.07
152	0.07
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.04
170	0.05
171	0.06
172	0.08
173	0.1
174	0.14
175	0.14
176	0.14
177	0.19
178	0.2
179	0.23
180	0.24
181	0.23
182	0.22
183	0.21
184	0.21
185	0.15
186	0.14
187	0.1
188	0.07
189	0.06
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.07
215	0.09
216	0.13
217	0.19
218	0.24
219	0.25
220	0.33
221	0.37
222	0.42
223	0.49
224	0.51
225	0.47
226	0.47
227	0.45
228	0.38
229	0.32
230	0.28
231	0.2
232	0.14
233	0.13
234	0.09
235	0.12
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.14
242	0.19
243	0.2
244	0.21
245	0.24
246	0.26
247	0.25
248	0.32
249	0.3
250	0.33
251	0.37
252	0.43
253	0.46
254	0.51
255	0.53
256	0.49
257	0.48
258	0.41
259	0.35
260	0.28
261	0.23
262	0.17
263	0.14
264	0.12
265	0.11
266	0.1
267	0.08
268	0.08
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.08
291	0.08
292	0.06
293	0.05
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.07
303	0.11
304	0.14
305	0.21
306	0.26
307	0.33
308	0.38
309	0.43
310	0.48
311	0.48
312	0.55
313	0.55
314	0.55
315	0.52
316	0.49
317	0.44
318	0.39
319	0.34
320	0.24
321	0.18
322	0.13
323	0.1
324	0.08
325	0.09
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.11
331	0.11
332	0.12
333	0.12
334	0.12
335	0.11
336	0.12
337	0.13
338	0.1
339	0.11
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.1
351	0.1
352	0.09
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.07
374	0.08
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.08
395	0.09
396	0.13
397	0.17
398	0.17
399	0.2
400	0.21
401	0.24
402	0.25
403	0.29
404	0.29
405	0.28
406	0.29
407	0.28
408	0.26
409	0.24
410	0.21
411	0.19
412	0.16
413	0.14
414	0.13
415	0.11
416	0.12
417	0.12
418	0.13
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.14
427	0.17
428	0.25
429	0.27
430	0.29
431	0.3
432	0.35
433	0.39
434	0.42
435	0.43
436	0.36
437	0.35
438	0.37
439	0.37
440	0.37
441	0.37
442	0.34
443	0.31
444	0.3
445	0.3
446	0.29
447	0.28
448	0.23
449	0.18
450	0.15
451	0.11
452	0.11
453	0.1
454	0.07
455	0.08
456	0.06
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.08
464	0.09
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.12
472	0.12
473	0.1
474	0.09
475	0.1
476	0.09
477	0.07
478	0.09
479	0.11
480	0.11
481	0.13
482	0.2
483	0.22
484	0.3
485	0.37
486	0.36
487	0.41
488	0.49
489	0.53
490	0.49
491	0.51
492	0.5
493	0.53
494	0.59
495	0.61
496	0.63
497	0.63
498	0.66
499	0.68
500	0.71
501	0.72
502	0.76
503	0.78
504	0.79
505	0.84
506	0.84
507	0.87
508	0.87
509	0.77
510	0.68
511	0.59
512	0.56
513	0.48
514	0.42
515	0.36
516	0.26
517	0.25
518	0.25
519	0.25
520	0.19
521	0.19
522	0.18
523	0.18
524	0.19
525	0.21
526	0.2
527	0.24
528	0.28
529	0.3
530	0.36
531	0.33
532	0.31
533	0.32
534	0.31
535	0.25
536	0.19
537	0.15
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.12
557	0.13
558	0.14
559	0.12
560	0.12
561	0.12
562	0.21
563	0.28
564	0.29
565	0.28
566	0.28
567	0.34
568	0.36
569	0.43
570	0.46
571	0.47
572	0.5
573	0.59
574	0.65
575	0.67
576	0.71
577	0.7
578	0.64
579	0.64
580	0.69
581	0.69
582	0.72
583	0.75
584	0.78
585	0.81
586	0.82
587	0.82
588	0.84
589	0.83
590	0.83
591	0.85
592	0.83
593	0.83
594	0.86
595	0.86
596	0.86
597	0.83
598	0.84
599	0.83
600	0.84
601	0.85
602	0.81
603	0.75
604	0.68
605	0.64
606	0.62
607	0.6
608	0.56
609	0.5
610	0.53
611	0.54
612	0.57
613	0.56
614	0.56
615	0.56
616	0.59
617	0.64
618	0.67
619	0.71
620	0.74
621	0.78
622	0.77
623	0.76
624	0.72
625	0.65
626	0.61

A0A4T0IPF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer