Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IE52

Protein Details
Accession A0A4T0IE52    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-498QQQQQHTTNNQRKKNPNTLFHydrophilic
570-589VSDKNGKGFKNTHKNKKQSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018829  DUF2433  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10360  DUF2433  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12254  RRM_hnRNPH_ESRPs_RBM12_like  
Amino Acid Sequences LCLADVRGDFDCLNRLAEDYKADIIIHTGDIGFLGVSRRRRQEFHSQHSEKSSIDRATEKVLRHLITYSPIISTDQRHSLLNDHSSVTSLRAALSEKENGNEHMLSTFPSLLNHSLKLNVPVYAVSGACEDVSVLEKLRMREYHIPNLHVLDEASSYLLHIGGIKLRLFGLGGAFVLHKLFDNGDGQATIAGGQGTTWITALQMGELIDTAKKVYDPSETRLLVTHSPPGREGLLAQLALVLKADLTLSASLHFRMSASYNDFSVVPNYEVFMQKLVNGRTAVYGIYNSVRAQLEDVLDDTQRLLLANFLLVADRVPGPNHGKGVVASHEEAWKHTWHFNLSDVSVGNVLLLVQDGKLGSEIKSEGFTYSHRNHQKTAALAGNEIANEGGSRGEVGVSVPHESQKIDETQQTQSKAQAGVTGMVADQTHVSHSSIHPNHIPNAPMAPATEQHTNADSIASATSPPPSQQQQQQQQQQQQQQQQHTTNNQRKKNPNTLFIRGIPQGCTDEEVAEFFTQFKPSITAIKILIDHKTGIQRGLCYVDFNNERDMLAAEKLSGGAIRNSHLHVQVSDKNGKGFKNTHKNKKQSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.19
7 0.19
8 0.19
9 0.18
10 0.16
11 0.17
12 0.16
13 0.13
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.06
20 0.06
21 0.11
22 0.15
23 0.22
24 0.3
25 0.38
26 0.42
27 0.46
28 0.51
29 0.58
30 0.64
31 0.66
32 0.71
33 0.66
34 0.65
35 0.68
36 0.63
37 0.53
38 0.48
39 0.45
40 0.36
41 0.36
42 0.35
43 0.31
44 0.37
45 0.41
46 0.37
47 0.37
48 0.4
49 0.38
50 0.36
51 0.36
52 0.3
53 0.29
54 0.3
55 0.24
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.21
60 0.23
61 0.24
62 0.27
63 0.28
64 0.29
65 0.29
66 0.31
67 0.34
68 0.34
69 0.31
70 0.27
71 0.26
72 0.26
73 0.25
74 0.22
75 0.18
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.14
80 0.16
81 0.19
82 0.22
83 0.22
84 0.24
85 0.26
86 0.26
87 0.27
88 0.25
89 0.22
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.12
96 0.12
97 0.15
98 0.19
99 0.21
100 0.21
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.26
105 0.24
106 0.2
107 0.18
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.15
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.12
123 0.15
124 0.17
125 0.22
126 0.22
127 0.26
128 0.35
129 0.41
130 0.47
131 0.48
132 0.48
133 0.45
134 0.45
135 0.39
136 0.3
137 0.24
138 0.15
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.14
203 0.17
204 0.21
205 0.28
206 0.28
207 0.28
208 0.29
209 0.3
210 0.25
211 0.24
212 0.26
213 0.21
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.17
219 0.16
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.06
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.1
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.12
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.13
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.09
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.14
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.17
329 0.16
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.07
335 0.05
336 0.05
337 0.03
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.16
356 0.19
357 0.27
358 0.34
359 0.36
360 0.36
361 0.4
362 0.42
363 0.36
364 0.38
365 0.32
366 0.25
367 0.24
368 0.22
369 0.19
370 0.15
371 0.14
372 0.09
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.15
393 0.15
394 0.19
395 0.2
396 0.26
397 0.3
398 0.33
399 0.31
400 0.3
401 0.31
402 0.28
403 0.25
404 0.22
405 0.18
406 0.16
407 0.15
408 0.13
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.21
421 0.22
422 0.25
423 0.29
424 0.3
425 0.33
426 0.34
427 0.34
428 0.24
429 0.24
430 0.22
431 0.18
432 0.16
433 0.14
434 0.13
435 0.16
436 0.19
437 0.18
438 0.19
439 0.2
440 0.2
441 0.18
442 0.17
443 0.13
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.09
450 0.1
451 0.11
452 0.15
453 0.19
454 0.25
455 0.32
456 0.42
457 0.5
458 0.59
459 0.67
460 0.7
461 0.73
462 0.76
463 0.77
464 0.75
465 0.72
466 0.7
467 0.68
468 0.68
469 0.65
470 0.63
471 0.64
472 0.67
473 0.69
474 0.7
475 0.72
476 0.73
477 0.78
478 0.8
479 0.82
480 0.77
481 0.77
482 0.75
483 0.74
484 0.7
485 0.63
486 0.59
487 0.52
488 0.48
489 0.39
490 0.34
491 0.3
492 0.25
493 0.25
494 0.2
495 0.17
496 0.16
497 0.15
498 0.15
499 0.13
500 0.13
501 0.11
502 0.12
503 0.13
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.16
508 0.22
509 0.22
510 0.24
511 0.23
512 0.25
513 0.28
514 0.27
515 0.29
516 0.24
517 0.24
518 0.24
519 0.3
520 0.28
521 0.29
522 0.29
523 0.28
524 0.28
525 0.32
526 0.29
527 0.25
528 0.24
529 0.29
530 0.31
531 0.31
532 0.33
533 0.28
534 0.28
535 0.26
536 0.26
537 0.19
538 0.17
539 0.16
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.14
548 0.16
549 0.18
550 0.21
551 0.25
552 0.27
553 0.27
554 0.25
555 0.31
556 0.34
557 0.39
558 0.42
559 0.4
560 0.42
561 0.44
562 0.44
563 0.44
564 0.47
565 0.51
566 0.55
567 0.64
568 0.7
569 0.77