Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0HQA4

Protein Details
Accession A0A4T0HQA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-372DAPVNVLQPKKKQDKRKAEDQPASEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
358-364KKQDKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSESSSELSNITQEAHRLVSIGNYNEASNKYSDALEIVRDTHGELSVESAALLLKYAESLYLHAVSQSDVIGKSDEAGDTADTADAANAAHTAHTPSTSNASTANTANTDNLIQLSDDDDDDNDDQGDDDNQPEQDPDHSNEDTPDDDFGAAWEVADLAKVIYQKLDGDNNKLCLADAHMLLGDIALELETFEAAALEYSSSLEIKKLILNPTSRVLAEAHFKLAISYELVPGHVRRDTALVHVQDAKEVLDGRLGELKKRVESGAPVEVSGENENNDKPALRERVERLSIEDATKEIKDIEELIGDLREKIAELEQPPPPASEDPSKSTVDVLVAEMDKAKQSVASDAPVNVLQPKKKQDKRKAEDQPASEADKKVKSDPHAHPGKKTETENEETPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.15
6 0.18
7 0.22
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.23
12 0.26
13 0.28
14 0.25
15 0.2
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.05
41 0.04
42 0.05
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.08
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.14
124 0.16
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.22
130 0.19
131 0.16
132 0.14
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.05
145 0.03
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.1
153 0.17
154 0.16
155 0.21
156 0.23
157 0.25
158 0.25
159 0.24
160 0.22
161 0.15
162 0.16
163 0.13
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.05
171 0.03
172 0.03
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.08
194 0.11
195 0.13
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.22
200 0.22
201 0.2
202 0.18
203 0.16
204 0.14
205 0.16
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.19
228 0.18
229 0.18
230 0.21
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.15
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.2
245 0.22
246 0.21
247 0.22
248 0.22
249 0.17
250 0.2
251 0.22
252 0.23
253 0.21
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.2
258 0.18
259 0.15
260 0.1
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.17
268 0.22
269 0.23
270 0.28
271 0.31
272 0.39
273 0.41
274 0.4
275 0.36
276 0.35
277 0.35
278 0.3
279 0.26
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.15
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.12
301 0.14
302 0.19
303 0.22
304 0.24
305 0.25
306 0.24
307 0.25
308 0.23
309 0.25
310 0.28
311 0.3
312 0.32
313 0.35
314 0.35
315 0.33
316 0.32
317 0.28
318 0.21
319 0.18
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.15
332 0.16
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.2
338 0.2
339 0.21
340 0.25
341 0.27
342 0.33
343 0.42
344 0.51
345 0.59
346 0.69
347 0.75
348 0.81
349 0.83
350 0.87
351 0.88
352 0.88
353 0.87
354 0.79
355 0.76
356 0.69
357 0.67
358 0.61
359 0.53
360 0.49
361 0.46
362 0.46
363 0.44
364 0.46
365 0.46
366 0.51
367 0.56
368 0.6
369 0.65
370 0.65
371 0.66
372 0.67
373 0.69
374 0.66
375 0.63
376 0.61
377 0.57
378 0.61