Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FXN7

Protein Details
Accession A0A4T0FXN7    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-154EEDGSDKPKSRKPRKQQKKKQQQKKAAAAAAHydrophilic
183-211ENSSEKKAGNKKRSQRKRQASRQSAKPLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-149KPKSRKPRKQQKKKQQQKKA
188-204KKAGNKKRSQRKRQASR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSQAPPVETHAAQAVEAHQPAEAAVLPTLKVFVGNLPFSVKDDGLKDLCKEHGEITDAQIIRFGSRSKGFGFVDYATKEQAETAVKALNGQDYQGRNIVVEIARPKEPKPERSQRIDDSAAPGEEDGSDKPKSRKPRKQQKKKQQQKKAAAAAAAENNDEAGVEQVDSTPAQSDAQQPKSEEENSSEKKAGNKKRSQRKRQASRQSAKPLGEPLADSVFVDNLPFRHYQGDDQPKIPFRDQQLRELFESKGLEVDQVRVVNRSNPLTKRSRGLGFVQLKKSTDQEKAINELNGSVVGRRTITVKVAKQRLDGENKEDTNQSNENNEQKEQPPAKDASAPTTESNEKKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.2
4 0.18
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.11
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.19
24 0.2
25 0.22
26 0.25
27 0.21
28 0.18
29 0.19
30 0.23
31 0.23
32 0.25
33 0.24
34 0.23
35 0.26
36 0.24
37 0.24
38 0.21
39 0.21
40 0.23
41 0.22
42 0.23
43 0.27
44 0.26
45 0.24
46 0.25
47 0.22
48 0.19
49 0.21
50 0.18
51 0.17
52 0.19
53 0.22
54 0.21
55 0.27
56 0.26
57 0.26
58 0.28
59 0.24
60 0.26
61 0.25
62 0.25
63 0.2
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.14
77 0.14
78 0.18
79 0.17
80 0.19
81 0.2
82 0.19
83 0.16
84 0.16
85 0.18
86 0.13
87 0.15
88 0.17
89 0.17
90 0.21
91 0.23
92 0.23
93 0.3
94 0.36
95 0.41
96 0.47
97 0.55
98 0.58
99 0.65
100 0.71
101 0.64
102 0.64
103 0.59
104 0.5
105 0.43
106 0.38
107 0.3
108 0.23
109 0.2
110 0.14
111 0.11
112 0.12
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.15
117 0.19
118 0.24
119 0.35
120 0.45
121 0.54
122 0.62
123 0.72
124 0.8
125 0.88
126 0.94
127 0.94
128 0.95
129 0.96
130 0.95
131 0.94
132 0.93
133 0.91
134 0.89
135 0.83
136 0.74
137 0.63
138 0.53
139 0.44
140 0.36
141 0.27
142 0.18
143 0.11
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.14
161 0.19
162 0.22
163 0.24
164 0.24
165 0.25
166 0.28
167 0.28
168 0.22
169 0.2
170 0.25
171 0.26
172 0.28
173 0.28
174 0.26
175 0.31
176 0.39
177 0.44
178 0.46
179 0.51
180 0.59
181 0.68
182 0.78
183 0.83
184 0.85
185 0.86
186 0.88
187 0.9
188 0.92
189 0.91
190 0.88
191 0.86
192 0.84
193 0.77
194 0.67
195 0.58
196 0.49
197 0.41
198 0.33
199 0.25
200 0.18
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.12
214 0.13
215 0.16
216 0.25
217 0.34
218 0.34
219 0.35
220 0.38
221 0.4
222 0.43
223 0.42
224 0.37
225 0.33
226 0.41
227 0.41
228 0.46
229 0.47
230 0.47
231 0.48
232 0.46
233 0.4
234 0.33
235 0.32
236 0.23
237 0.19
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.19
248 0.22
249 0.25
250 0.29
251 0.31
252 0.37
253 0.42
254 0.44
255 0.45
256 0.46
257 0.44
258 0.41
259 0.41
260 0.45
261 0.47
262 0.51
263 0.52
264 0.5
265 0.48
266 0.46
267 0.47
268 0.42
269 0.39
270 0.36
271 0.36
272 0.36
273 0.39
274 0.41
275 0.38
276 0.33
277 0.28
278 0.23
279 0.2
280 0.17
281 0.14
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.2
289 0.26
290 0.32
291 0.4
292 0.47
293 0.49
294 0.51
295 0.55
296 0.57
297 0.59
298 0.56
299 0.52
300 0.53
301 0.51
302 0.5
303 0.46
304 0.4
305 0.37
306 0.37
307 0.34
308 0.31
309 0.36
310 0.41
311 0.42
312 0.42
313 0.41
314 0.4
315 0.48
316 0.47
317 0.44
318 0.43
319 0.42
320 0.42
321 0.44
322 0.43
323 0.39
324 0.38
325 0.38
326 0.34
327 0.37
328 0.42