FuNGI

A0A4T0JDR3

Protein Details

Accession

A0A4T0JDR3

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
754-773	KLPIRYQSPPKYKNQKSFQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
486-494	KGKHKKVKS
573-591	KPSNPPKKLERKTSKMGSK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 3, plas 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020708 DNA-dir_RNA_polK_14-18kDa_CS IPR006110 Pol_omega/Rpo6/RPB6 IPR036161 RPB6/omega-like_sf IPR002994 Surf1/Shy1 IPR045214 Surf1/Surf4
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0016020 C:membrane GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF01192 RNA_pol_Rpb6 PF02104 SURF1
PROSITE	View protein in PROSITE PS01111 RNA_POL_K_14KD PS50895 SURF1
CDD	cd06662 SURF1

Amino Acid Sequences

MDNKNVRALAVDKLRRAASIPRRNVSGGSNDSNLDASRDISKDTSNDSRLDTSNSAPNSPYSPTIYEPVLECVQSTNSDGEDDKQGDNDKAENPETLDNSHTLQLVNPHSPQKPTKKQLLTLTQLQDQLLSKHGNSLLSRSNSATARVNAFNKLVNGALLNNDENSRLLRSNTVTGAIGGRGSRDDSRQAARANMLKRLGSRRQPPTQTTQKRRSSLGDLDLSNFDNLLNSSKPPQILPSNLLLVPPTPKRERKQSLESTNSIGSPSSAGNGDKFEYERMLNTSTRLSPANSDIEDSDDDITYEEVEEVDHVDKVDQLDIINSEISNKAAQRRRRQIHFTSSAYINELRKTLGPDRLAQLLGPQFVNEFGIGMGDMEEHKEEEDQGDRFKEIETDKGNGKENEEKPTNTSDIQPMQSIQPTIDEDIPLTEQINGAYSATRKSSELKPQPQIHLAARNADNAKSQAMLTRSMTTLPKSKLAQSEMGKGKHKKVKSQRSFGSFRIIKNKPSIQSNKEFYDSDPKLSPFPALKVTDSEGKTTSLRNRSMSPVSPVGVANAAFNTNKAPSTPSTPPKPSNPPKKLERKTSKMGSKLRRLFSVDEGQDFYQDAGMEEEDNVAPMEDDSNVVTSGAAITGSTATVANEDRVTTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVLVPIEAGETDPLQIAIKELSSKKVPLIAYKYACECTRQIAFNPTSLNVCTAFASLLVSLSAPFMAGMIRAALRSTRTLNNAKLPIRYQSPPKYKNQKSFQFPTAGLLALSAIPIFTLYLGFWQVRRLDWKLNLIAELDDKLGQDPLPLPKHIDTSVLPEFEYRKVTAGGTLLNHAIAVGPSTLDGEIGVHVIQPLLRHDGQTVLVNRGFIHNDNLDSFLSTLGNTSTDVDIVGMLRVSQKRNMFTPDNIPADNVWLWVDVPAIATHLSSLTNTPIENVLIDEIYDGLPGSRLAQGVPVGRPSKIELRNQHAVYAFTWFSLSLFTTGLLYRLAKRTQGLRLMRNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.4
4	0.42
5	0.43
6	0.48
7	0.54
8	0.54
9	0.57
10	0.57
11	0.57
12	0.5
13	0.48
14	0.44
15	0.39
16	0.37
17	0.34
18	0.34
19	0.33
20	0.29
21	0.23
22	0.17
23	0.15
24	0.18
25	0.18
26	0.19
27	0.2
28	0.22
29	0.22
30	0.28
31	0.34
32	0.32
33	0.34
34	0.35
35	0.37
36	0.37
37	0.4
38	0.36
39	0.31
40	0.35
41	0.35
42	0.33
43	0.3
44	0.3
45	0.27
46	0.28
47	0.27
48	0.24
49	0.25
50	0.26
51	0.28
52	0.27
53	0.26
54	0.25
55	0.27
56	0.24
57	0.21
58	0.19
59	0.18
60	0.19
61	0.19
62	0.19
63	0.16
64	0.14
65	0.16
66	0.17
67	0.17
68	0.22
69	0.23
70	0.21
71	0.23
72	0.25
73	0.25
74	0.26
75	0.27
76	0.24
77	0.27
78	0.28
79	0.26
80	0.26
81	0.28
82	0.28
83	0.27
84	0.25
85	0.22
86	0.22
87	0.23
88	0.21
89	0.17
90	0.17
91	0.22
92	0.25
93	0.27
94	0.29
95	0.33
96	0.35
97	0.41
98	0.48
99	0.52
100	0.58
101	0.62
102	0.68
103	0.68
104	0.72
105	0.75
106	0.76
107	0.71
108	0.68
109	0.65
110	0.59
111	0.55
112	0.48
113	0.41
114	0.33
115	0.29
116	0.25
117	0.23
118	0.19
119	0.22
120	0.24
121	0.25
122	0.25
123	0.28
124	0.32
125	0.33
126	0.34
127	0.31
128	0.34
129	0.31
130	0.33
131	0.34
132	0.29
133	0.31
134	0.34
135	0.35
136	0.33
137	0.33
138	0.32
139	0.28
140	0.26
141	0.22
142	0.17
143	0.15
144	0.13
145	0.14
146	0.14
147	0.14
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.15
153	0.16
154	0.15
155	0.16
156	0.19
157	0.21
158	0.24
159	0.24
160	0.24
161	0.21
162	0.2
163	0.2
164	0.16
165	0.15
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.13
170	0.15
171	0.16
172	0.2
173	0.23
174	0.27
175	0.31
176	0.32
177	0.31
178	0.34
179	0.37
180	0.36
181	0.37
182	0.36
183	0.33
184	0.36
185	0.42
186	0.46
187	0.48
188	0.55
189	0.58
190	0.64
191	0.69
192	0.68
193	0.69
194	0.72
195	0.74
196	0.75
197	0.77
198	0.76
199	0.73
200	0.72
201	0.67
202	0.63
203	0.58
204	0.54
205	0.49
206	0.41
207	0.4
208	0.38
209	0.34
210	0.27
211	0.22
212	0.15
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.12
218	0.15
219	0.18
220	0.19
221	0.19
222	0.23
223	0.24
224	0.26
225	0.28
226	0.27
227	0.28
228	0.27
229	0.27
230	0.22
231	0.19
232	0.21
233	0.21
234	0.25
235	0.29
236	0.37
237	0.42
238	0.53
239	0.6
240	0.62
241	0.69
242	0.72
243	0.74
244	0.73
245	0.69
246	0.62
247	0.55
248	0.47
249	0.38
250	0.28
251	0.19
252	0.13
253	0.11
254	0.09
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.12
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.15
267	0.18
268	0.17
269	0.17
270	0.2
271	0.18
272	0.2
273	0.2
274	0.18
275	0.17
276	0.2
277	0.22
278	0.19
279	0.19
280	0.17
281	0.19
282	0.18
283	0.17
284	0.15
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.09
308	0.08
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.11
315	0.19
316	0.25
317	0.34
318	0.43
319	0.53
320	0.6
321	0.65
322	0.71
323	0.69
324	0.72
325	0.71
326	0.63
327	0.56
328	0.5
329	0.44
330	0.38
331	0.36
332	0.28
333	0.22
334	0.2
335	0.17
336	0.16
337	0.21
338	0.22
339	0.24
340	0.25
341	0.26
342	0.27
343	0.28
344	0.27
345	0.22
346	0.22
347	0.18
348	0.17
349	0.15
350	0.13
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.08
355	0.06
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.1
371	0.1
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.13
377	0.15
378	0.13
379	0.17
380	0.18
381	0.19
382	0.22
383	0.24
384	0.29
385	0.26
386	0.28
387	0.32
388	0.32
389	0.36
390	0.36
391	0.34
392	0.32
393	0.34
394	0.33
395	0.25
396	0.24
397	0.21
398	0.22
399	0.22
400	0.2
401	0.18
402	0.17
403	0.17
404	0.16
405	0.12
406	0.11
407	0.11
408	0.12
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.1
413	0.1
414	0.08
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.14
429	0.19
430	0.28
431	0.36
432	0.42
433	0.49
434	0.52
435	0.53
436	0.52
437	0.5
438	0.42
439	0.4
440	0.33
441	0.3
442	0.27
443	0.29
444	0.27
445	0.24
446	0.23
447	0.17
448	0.17
449	0.13
450	0.12
451	0.11
452	0.12
453	0.13
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.15
458	0.16
459	0.15
460	0.2
461	0.19
462	0.22
463	0.22
464	0.25
465	0.26
466	0.28
467	0.32
468	0.28
469	0.35
470	0.36
471	0.38
472	0.42
473	0.4
474	0.46
475	0.46
476	0.46
477	0.47
478	0.52
479	0.6
480	0.62
481	0.67
482	0.65
483	0.65
484	0.68
485	0.59
486	0.59
487	0.5
488	0.44
489	0.45
490	0.41
491	0.37
492	0.38
493	0.41
494	0.34
495	0.39
496	0.43
497	0.38
498	0.43
499	0.45
500	0.41
501	0.4
502	0.38
503	0.31
504	0.36
505	0.31
506	0.27
507	0.25
508	0.24
509	0.22
510	0.22
511	0.23
512	0.14
513	0.15
514	0.17
515	0.16
516	0.16
517	0.16
518	0.18
519	0.23
520	0.22
521	0.22
522	0.18
523	0.19
524	0.19
525	0.21
526	0.25
527	0.25
528	0.27
529	0.27
530	0.28
531	0.3
532	0.33
533	0.31
534	0.28
535	0.24
536	0.22
537	0.21
538	0.19
539	0.15
540	0.13
541	0.12
542	0.09
543	0.07
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.1
552	0.1
553	0.16
554	0.22
555	0.27
556	0.32
557	0.37
558	0.4
559	0.43
560	0.53
561	0.56
562	0.61
563	0.61
564	0.62
565	0.66
566	0.74
567	0.75
568	0.76
569	0.75
570	0.71
571	0.72
572	0.74
573	0.71
574	0.68
575	0.7
576	0.67
577	0.68
578	0.69
579	0.63
580	0.58
581	0.55
582	0.48
583	0.44
584	0.44
585	0.35
586	0.29
587	0.29
588	0.26
589	0.23
590	0.21
591	0.16
592	0.1
593	0.09
594	0.08
595	0.06
596	0.07
597	0.06
598	0.06
599	0.07
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.04
608	0.05
609	0.05
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.04
617	0.04
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.06
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.08
631	0.1
632	0.12
633	0.11
634	0.12
635	0.14
636	0.17
637	0.18
638	0.21
639	0.24
640	0.29
641	0.32
642	0.32
643	0.32
644	0.31
645	0.33
646	0.33
647	0.31
648	0.27
649	0.24
650	0.22
651	0.2
652	0.18
653	0.16
654	0.14
655	0.13
656	0.1
657	0.09
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.07
662	0.05
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.05
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.1
677	0.11
678	0.14
679	0.16
680	0.17
681	0.17
682	0.22
683	0.22
684	0.23
685	0.28
686	0.32
687	0.32
688	0.33
689	0.35
690	0.32
691	0.32
692	0.29
693	0.24
694	0.22
695	0.24
696	0.24
697	0.23
698	0.29
699	0.29
700	0.29
701	0.3
702	0.26
703	0.24
704	0.22
705	0.22
706	0.14
707	0.14
708	0.12
709	0.11
710	0.1
711	0.08
712	0.09
713	0.07
714	0.06
715	0.06
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.06
730	0.07
731	0.09
732	0.11
733	0.15
734	0.18
735	0.24
736	0.3
737	0.33
738	0.39
739	0.44
740	0.44
741	0.43
742	0.41
743	0.39
744	0.39
745	0.39
746	0.41
747	0.44
748	0.53
749	0.55
750	0.63
751	0.7
752	0.73
753	0.79
754	0.8
755	0.79
756	0.77
757	0.78
758	0.72
759	0.65
760	0.58
761	0.5
762	0.42
763	0.33
764	0.24
765	0.17
766	0.14
767	0.09
768	0.09
769	0.05
770	0.04
771	0.03
772	0.04
773	0.04
774	0.03
775	0.04
776	0.04
777	0.05
778	0.08
779	0.09
780	0.09
781	0.13
782	0.14
783	0.16
784	0.22
785	0.24
786	0.29
787	0.32
788	0.37
789	0.37
790	0.36
791	0.35
792	0.3
793	0.27
794	0.22
795	0.19
796	0.14
797	0.12
798	0.11
799	0.11
800	0.11
801	0.1
802	0.11
803	0.13
804	0.2
805	0.22
806	0.23
807	0.26
808	0.26
809	0.3
810	0.29
811	0.29
812	0.22
813	0.26
814	0.29
815	0.26
816	0.24
817	0.23
818	0.25
819	0.24
820	0.27
821	0.2
822	0.18
823	0.19
824	0.19
825	0.19
826	0.18
827	0.18
828	0.16
829	0.17
830	0.15
831	0.14
832	0.13
833	0.11
834	0.1
835	0.07
836	0.07
837	0.06
838	0.05
839	0.05
840	0.07
841	0.07
842	0.06
843	0.06
844	0.05
845	0.06
846	0.06
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.06
851	0.07
852	0.08
853	0.1
854	0.16
855	0.16
856	0.17
857	0.18
858	0.2
859	0.21
860	0.26
861	0.26
862	0.25
863	0.25
864	0.25
865	0.24
866	0.25
867	0.26
868	0.21
869	0.24
870	0.21
871	0.21
872	0.22
873	0.24
874	0.21
875	0.19
876	0.18
877	0.14
878	0.12
879	0.1
880	0.1
881	0.09
882	0.09
883	0.09
884	0.11
885	0.1
886	0.1
887	0.1
888	0.09
889	0.09
890	0.09
891	0.08
892	0.06
893	0.06
894	0.13
895	0.17
896	0.2
897	0.26
898	0.31
899	0.34
900	0.38
901	0.45
902	0.43
903	0.43
904	0.48
905	0.5
906	0.48
907	0.45
908	0.42
909	0.35
910	0.35
911	0.31
912	0.24
913	0.16
914	0.13
915	0.13
916	0.12
917	0.12
918	0.08
919	0.09
920	0.08
921	0.09
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.08
926	0.09
927	0.09
928	0.1
929	0.12
930	0.13
931	0.13
932	0.14
933	0.15
934	0.15
935	0.15
936	0.14
937	0.12
938	0.11
939	0.11
940	0.1
941	0.09
942	0.08
943	0.08
944	0.07
945	0.06
946	0.07
947	0.07
948	0.09
949	0.1
950	0.1
951	0.1
952	0.13
953	0.17
954	0.2
955	0.22
956	0.27
957	0.27
958	0.27
959	0.29
960	0.31
961	0.37
962	0.4
963	0.47
964	0.48
965	0.54
966	0.63
967	0.62
968	0.61
969	0.54
970	0.48
971	0.4
972	0.37
973	0.29
974	0.2
975	0.2
976	0.16
977	0.14
978	0.14
979	0.15
980	0.1
981	0.11
982	0.11
983	0.12
984	0.12
985	0.13
986	0.14
987	0.15
988	0.19
989	0.25
990	0.28
991	0.29
992	0.33
993	0.38
994	0.43
995	0.51
996	0.53

A0A4T0JDR3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer