FuNGI

A0A4T0J453

Protein Details

Accession

A0A4T0J453

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
349-368	YYKHMPTKMTLKKRRPKDEE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSKSKYDLIVRTRYQNQIPAPKFGPKLINIEPNLQRLGDYNFTADLVAEQPHAMLADAESGMRLQLQHFAELWDDHDEDDEHIHLNPEADVELDDDDLALLVDPADVSLRGNTTLNSGTTTPDKPSQASNKAWLYKSKYSNLNASEVNEKRTNYSKAALSRKQSSDVRVYDDTPEGRAQEIESTFQWDTRQPSSQELSEITHPQKKHLKAVDTYDFLPDFETFANDYFLMRFADDPSDRTTSSDHRLHNGILRPRYADNGETWLQYYLPESDEQYALLRSKLEAETLPEDVDEQQRVIFNYIREYNVTNEQKDTNDILLMFDNGDSKPPGSTVINPSLASARPRGKGVYYKHMPTKMTLKKRRPKDEEDEDMWDKIQLGLEPLNEEEVSERMAIDDYFMPAGPQRAKEKKEEQRQMEDAAKEEEKLRIKSEKIQHKQDLEKERKAAMEEQIRREEEDKIGVNASKSDESEDEEFGDKEEEDEDKDGDESKGNNNSKEKEVPRSSPPGSDDGEHDNVTSEAASKEIDEAIRREIDQRQTGNDNRDVNMRSASPPTDGDKPESKGSGQPEDAQEAQEAQEAQETSASLAPPATNTETSPGGEKAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.6
3	0.6
4	0.61
5	0.6
6	0.59
7	0.56
8	0.56
9	0.54
10	0.52
11	0.5
12	0.43
13	0.47
14	0.47
15	0.52
16	0.46
17	0.53
18	0.52
19	0.5
20	0.48
21	0.4
22	0.35
23	0.29
24	0.32
25	0.27
26	0.23
27	0.21
28	0.2
29	0.2
30	0.2
31	0.17
32	0.13
33	0.11
34	0.11
35	0.1
36	0.09
37	0.09
38	0.09
39	0.1
40	0.08
41	0.07
42	0.06
43	0.08
44	0.08
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.07
52	0.14
53	0.15
54	0.17
55	0.18
56	0.19
57	0.2
58	0.19
59	0.21
60	0.18
61	0.17
62	0.15
63	0.16
64	0.16
65	0.15
66	0.16
67	0.14
68	0.11
69	0.11
70	0.12
71	0.11
72	0.11
73	0.11
74	0.1
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.07
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.05
86	0.04
87	0.03
88	0.03
89	0.03
90	0.03
91	0.04
92	0.05
93	0.05
94	0.06
95	0.07
96	0.08
97	0.09
98	0.1
99	0.1
100	0.13
101	0.15
102	0.14
103	0.16
104	0.15
105	0.16
106	0.2
107	0.21
108	0.22
109	0.25
110	0.26
111	0.25
112	0.32
113	0.38
114	0.41
115	0.42
116	0.46
117	0.47
118	0.51
119	0.52
120	0.52
121	0.51
122	0.53
123	0.55
124	0.55
125	0.55
126	0.52
127	0.57
128	0.53
129	0.49
130	0.41
131	0.38
132	0.4
133	0.35
134	0.37
135	0.34
136	0.32
137	0.32
138	0.37
139	0.39
140	0.32
141	0.35
142	0.34
143	0.39
144	0.48
145	0.5
146	0.49
147	0.52
148	0.52
149	0.54
150	0.52
151	0.48
152	0.47
153	0.43
154	0.44
155	0.38
156	0.37
157	0.33
158	0.33
159	0.3
160	0.24
161	0.23
162	0.18
163	0.17
164	0.16
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.18
171	0.18
172	0.18
173	0.19
174	0.18
175	0.21
176	0.23
177	0.27
178	0.24
179	0.28
180	0.3
181	0.3
182	0.28
183	0.25
184	0.24
185	0.22
186	0.26
187	0.25
188	0.27
189	0.26
190	0.31
191	0.38
192	0.38
193	0.43
194	0.44
195	0.45
196	0.43
197	0.5
198	0.49
199	0.44
200	0.42
201	0.36
202	0.3
203	0.25
204	0.23
205	0.16
206	0.12
207	0.1
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.08
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.13
221	0.13
222	0.14
223	0.17
224	0.19
225	0.18
226	0.19
227	0.2
228	0.19
229	0.25
230	0.29
231	0.27
232	0.27
233	0.28
234	0.28
235	0.31
236	0.34
237	0.33
238	0.3
239	0.3
240	0.29
241	0.28
242	0.3
243	0.26
244	0.21
245	0.16
246	0.18
247	0.18
248	0.16
249	0.16
250	0.14
251	0.13
252	0.12
253	0.12
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.11
272	0.12
273	0.13
274	0.12
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.12
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.11
285	0.12
286	0.11
287	0.14
288	0.15
289	0.15
290	0.15
291	0.16
292	0.16
293	0.23
294	0.25
295	0.22
296	0.22
297	0.22
298	0.22
299	0.23
300	0.22
301	0.13
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.09
306	0.09
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.12
319	0.15
320	0.19
321	0.2
322	0.2
323	0.21
324	0.2
325	0.2
326	0.19
327	0.19
328	0.19
329	0.19
330	0.2
331	0.21
332	0.21
333	0.27
334	0.3
335	0.35
336	0.35
337	0.37
338	0.41
339	0.44
340	0.42
341	0.38
342	0.44
343	0.42
344	0.49
345	0.55
346	0.61
347	0.66
348	0.75
349	0.83
350	0.8
351	0.79
352	0.77
353	0.76
354	0.73
355	0.67
356	0.64
357	0.55
358	0.48
359	0.41
360	0.32
361	0.23
362	0.17
363	0.14
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.12
389	0.13
390	0.16
391	0.24
392	0.3
393	0.33
394	0.4
395	0.5
396	0.56
397	0.64
398	0.69
399	0.66
400	0.67
401	0.66
402	0.63
403	0.58
404	0.49
405	0.4
406	0.35
407	0.3
408	0.23
409	0.23
410	0.24
411	0.24
412	0.25
413	0.27
414	0.28
415	0.29
416	0.37
417	0.45
418	0.5
419	0.52
420	0.6
421	0.62
422	0.63
423	0.68
424	0.68
425	0.69
426	0.66
427	0.64
428	0.57
429	0.53
430	0.49
431	0.45
432	0.41
433	0.37
434	0.39
435	0.4
436	0.43
437	0.47
438	0.46
439	0.45
440	0.43
441	0.39
442	0.3
443	0.3
444	0.25
445	0.21
446	0.22
447	0.21
448	0.2
449	0.19
450	0.21
451	0.17
452	0.16
453	0.17
454	0.16
455	0.19
456	0.2
457	0.19
458	0.18
459	0.18
460	0.18
461	0.16
462	0.17
463	0.12
464	0.11
465	0.12
466	0.11
467	0.11
468	0.12
469	0.12
470	0.11
471	0.12
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.14
476	0.18
477	0.27
478	0.3
479	0.35
480	0.39
481	0.42
482	0.44
483	0.51
484	0.5
485	0.5
486	0.54
487	0.53
488	0.53
489	0.58
490	0.54
491	0.5
492	0.49
493	0.43
494	0.39
495	0.35
496	0.32
497	0.3
498	0.32
499	0.27
500	0.25
501	0.22
502	0.2
503	0.19
504	0.16
505	0.11
506	0.08
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.09
511	0.11
512	0.12
513	0.14
514	0.15
515	0.19
516	0.21
517	0.21
518	0.23
519	0.28
520	0.34
521	0.38
522	0.38
523	0.4
524	0.45
525	0.5
526	0.53
527	0.53
528	0.48
529	0.42
530	0.47
531	0.44
532	0.38
533	0.36
534	0.31
535	0.28
536	0.29
537	0.29
538	0.25
539	0.26
540	0.28
541	0.32
542	0.33
543	0.36
544	0.39
545	0.41
546	0.43
547	0.42
548	0.4
549	0.37
550	0.41
551	0.42
552	0.38
553	0.39
554	0.38
555	0.41
556	0.4
557	0.36
558	0.31
559	0.25
560	0.23
561	0.21
562	0.18
563	0.13
564	0.17
565	0.17
566	0.16
567	0.17
568	0.16
569	0.15
570	0.17
571	0.17
572	0.13
573	0.13
574	0.13
575	0.13
576	0.17
577	0.2
578	0.19
579	0.19
580	0.22
581	0.23
582	0.24
583	0.27

A0A4T0J453

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer