Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JQK6

Protein Details
Accession A0A4T0JQK6    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
575-598LLECLSKEHRRRRRARQATYHESEHydrophilic
988-1007KDFMLRQLRRTEHKKRELSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
584-588RRRRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR038089  Med31_sf  
IPR008831  Mediator_Med31  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF05669  Med31  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MEGEKETHDTQDKQKTENRNKFEIELEFVQSLAHPFYLHALAQQGYFDKPEFIKYIKYLNYWRDPEYIKFITYPHCLHNLDLLMEPKFRESIKHQDRYIGSNIAYGLTTNDHQMLKPFKLNNFTNTTKPINILYHFNDSLIVGSTNQLQFQSYRHNTYNNINLDFTPKQILQFNNSLVMLDTDGVLYHLNGYNPQKSNIRNVIKLLQSSNSIVVIRQSSIGRLKLSPRLTVINELPLPSLHLDSAINNDVICLADTANTYSLLNLTNSVLLPLLPFEGSPSITSIDDADEFLMITHNDLGAVGVFIDSYSGEPKHGPLQFPSTIKSIVHQSPHLFTLLSNNTLQIHSTITHSLIHSLSLSSLHPMFLQSTPLGLSIPQSIPNQLHFVSFPLLNTSVDYSNASNRPSNSSSQLESTQVILATDTGSIHAFIPPSIFDQSIYLLDMENDNARQQALSLANSLPTDSLESCYIHLYAALQLFRSTSFSDASALFSKSQCDIRLILSWFLDLTAGLFDPDEFVKIPLGIANLIENIPRTIKDLIVGNLEKNYSPYLNVESDEPVRQLYDSLMENARSMLLECLSKEHRRRRRARQATYHESESYTDMILDTCLAIIFAERSDKDRNALNVFINNSNNILLPIAEPWFTRYGRYAALSRLYESHGDIKEAIKIHKRFIEQTIVDKDVVDPLRDIIRLLNRVEEADLLLEYGLWLILYDRNAGLQVLSSHPRTSIDEGILLEALGRTDKVAEQEYLEILVLARNREDTGMRQALLDMLIGNVVEALKDSNISGDMWRLIEEYKLQKHDQSYAQYVTAVLDTTEISPMTKNAIISRLKLLLFLQMASDLDWNSIETALHPFTESTLLFEKAVILGKLEQHSAALNILARNLRDTFTSQHYCAFPGYILSGSLARKCIDNSHLSNCWLVALARTSMVAVAPPLRSHLLRILLDVYMADGDVFSAEIASLLGSQALHLNFLETLPRIPNDTPLISIKDFMLRQLRRTEHKKRELSILKGVAAAENLTKTEEAWLATREAGAIIEEAIDDANQVDGNDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.61
3 0.67
4 0.72
5 0.7
6 0.67
7 0.68
8 0.65
9 0.63
10 0.55
11 0.5
12 0.43
13 0.39
14 0.32
15 0.29
16 0.26
17 0.22
18 0.2
19 0.15
20 0.13
21 0.1
22 0.1
23 0.13
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.18
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.22
38 0.24
39 0.24
40 0.28
41 0.28
42 0.35
43 0.36
44 0.4
45 0.43
46 0.48
47 0.56
48 0.54
49 0.55
50 0.53
51 0.53
52 0.51
53 0.52
54 0.46
55 0.38
56 0.35
57 0.34
58 0.34
59 0.36
60 0.35
61 0.31
62 0.35
63 0.35
64 0.34
65 0.38
66 0.34
67 0.3
68 0.31
69 0.3
70 0.25
71 0.26
72 0.26
73 0.21
74 0.22
75 0.2
76 0.22
77 0.25
78 0.34
79 0.43
80 0.5
81 0.49
82 0.55
83 0.57
84 0.57
85 0.55
86 0.48
87 0.38
88 0.32
89 0.32
90 0.25
91 0.22
92 0.17
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.23
101 0.27
102 0.28
103 0.35
104 0.37
105 0.38
106 0.46
107 0.48
108 0.48
109 0.5
110 0.5
111 0.48
112 0.49
113 0.48
114 0.41
115 0.4
116 0.38
117 0.35
118 0.34
119 0.35
120 0.33
121 0.37
122 0.36
123 0.34
124 0.3
125 0.25
126 0.24
127 0.2
128 0.16
129 0.09
130 0.1
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.27
139 0.27
140 0.32
141 0.34
142 0.37
143 0.39
144 0.45
145 0.51
146 0.45
147 0.43
148 0.38
149 0.35
150 0.39
151 0.36
152 0.31
153 0.28
154 0.23
155 0.23
156 0.28
157 0.29
158 0.28
159 0.32
160 0.32
161 0.3
162 0.29
163 0.27
164 0.21
165 0.2
166 0.15
167 0.11
168 0.1
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.15
178 0.2
179 0.27
180 0.28
181 0.32
182 0.35
183 0.35
184 0.44
185 0.49
186 0.5
187 0.45
188 0.46
189 0.49
190 0.47
191 0.47
192 0.4
193 0.32
194 0.29
195 0.28
196 0.26
197 0.21
198 0.18
199 0.16
200 0.17
201 0.16
202 0.14
203 0.16
204 0.15
205 0.17
206 0.22
207 0.24
208 0.23
209 0.24
210 0.28
211 0.33
212 0.35
213 0.33
214 0.31
215 0.33
216 0.33
217 0.35
218 0.32
219 0.31
220 0.3
221 0.28
222 0.26
223 0.21
224 0.22
225 0.17
226 0.17
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.07
240 0.05
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.04
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.17
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.26
306 0.29
307 0.3
308 0.31
309 0.26
310 0.25
311 0.24
312 0.23
313 0.23
314 0.23
315 0.24
316 0.25
317 0.24
318 0.25
319 0.26
320 0.25
321 0.18
322 0.15
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.12
332 0.11
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.13
338 0.12
339 0.14
340 0.12
341 0.12
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.11
353 0.1
354 0.12
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.07
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.16
368 0.17
369 0.19
370 0.16
371 0.16
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.13
385 0.11
386 0.15
387 0.17
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.24
392 0.25
393 0.27
394 0.26
395 0.27
396 0.26
397 0.26
398 0.26
399 0.22
400 0.2
401 0.19
402 0.15
403 0.12
404 0.11
405 0.09
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.07
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.08
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.12
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.17
487 0.17
488 0.17
489 0.15
490 0.14
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.11
526 0.11
527 0.15
528 0.15
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.13
533 0.12
534 0.12
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.11
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.14
544 0.14
545 0.13
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.08
560 0.08
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.1
566 0.14
567 0.2
568 0.27
569 0.37
570 0.45
571 0.55
572 0.64
573 0.71
574 0.79
575 0.83
576 0.85
577 0.85
578 0.86
579 0.84
580 0.79
581 0.71
582 0.6
583 0.5
584 0.42
585 0.33
586 0.24
587 0.15
588 0.11
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.06
593 0.04
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.04
601 0.06
602 0.06
603 0.1
604 0.14
605 0.15
606 0.16
607 0.19
608 0.21
609 0.22
610 0.23
611 0.21
612 0.2
613 0.22
614 0.24
615 0.21
616 0.18
617 0.17
618 0.15
619 0.14
620 0.11
621 0.09
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.09
629 0.13
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.16
634 0.17
635 0.19
636 0.18
637 0.17
638 0.21
639 0.21
640 0.2
641 0.19
642 0.19
643 0.18
644 0.18
645 0.21
646 0.17
647 0.17
648 0.17
649 0.16
650 0.19
651 0.2
652 0.22
653 0.24
654 0.25
655 0.27
656 0.31
657 0.33
658 0.32
659 0.33
660 0.38
661 0.31
662 0.36
663 0.36
664 0.33
665 0.31
666 0.29
667 0.26
668 0.23
669 0.23
670 0.18
671 0.14
672 0.13
673 0.15
674 0.15
675 0.15
676 0.12
677 0.17
678 0.19
679 0.19
680 0.2
681 0.18
682 0.19
683 0.19
684 0.16
685 0.11
686 0.09
687 0.08
688 0.06
689 0.05
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.03
694 0.02
695 0.03
696 0.03
697 0.05
698 0.06
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.1
708 0.13
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.16
713 0.18
714 0.21
715 0.2
716 0.18
717 0.18
718 0.18
719 0.18
720 0.16
721 0.13
722 0.1
723 0.07
724 0.06
725 0.05
726 0.05
727 0.04
728 0.05
729 0.06
730 0.09
731 0.11
732 0.11
733 0.12
734 0.13
735 0.13
736 0.13
737 0.12
738 0.09
739 0.07
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.09
745 0.1
746 0.11
747 0.12
748 0.13
749 0.2
750 0.22
751 0.22
752 0.21
753 0.21
754 0.2
755 0.19
756 0.16
757 0.08
758 0.05
759 0.05
760 0.05
761 0.04
762 0.04
763 0.04
764 0.03
765 0.04
766 0.04
767 0.04
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.09
775 0.1
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.15
782 0.2
783 0.24
784 0.28
785 0.29
786 0.32
787 0.34
788 0.38
789 0.39
790 0.37
791 0.36
792 0.34
793 0.33
794 0.3
795 0.28
796 0.23
797 0.18
798 0.13
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.09
808 0.12
809 0.13
810 0.13
811 0.14
812 0.21
813 0.22
814 0.24
815 0.27
816 0.27
817 0.25
818 0.26
819 0.24
820 0.22
821 0.21
822 0.19
823 0.15
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.14
828 0.09
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.08
833 0.09
834 0.08
835 0.08
836 0.11
837 0.12
838 0.12
839 0.12
840 0.11
841 0.12
842 0.15
843 0.14
844 0.14
845 0.16
846 0.17
847 0.17
848 0.17
849 0.16
850 0.15
851 0.18
852 0.14
853 0.12
854 0.13
855 0.17
856 0.18
857 0.18
858 0.17
859 0.14
860 0.15
861 0.14
862 0.13
863 0.11
864 0.11
865 0.11
866 0.14
867 0.15
868 0.15
869 0.17
870 0.18
871 0.17
872 0.17
873 0.19
874 0.21
875 0.27
876 0.32
877 0.3
878 0.33
879 0.33
880 0.33
881 0.31
882 0.27
883 0.19
884 0.15
885 0.16
886 0.12
887 0.11
888 0.11
889 0.14
890 0.15
891 0.17
892 0.18
893 0.17
894 0.18
895 0.19
896 0.23
897 0.24
898 0.3
899 0.32
900 0.37
901 0.4
902 0.4
903 0.39
904 0.34
905 0.29
906 0.23
907 0.18
908 0.14
909 0.13
910 0.13
911 0.12
912 0.12
913 0.12
914 0.11
915 0.11
916 0.09
917 0.08
918 0.11
919 0.12
920 0.12
921 0.15
922 0.18
923 0.18
924 0.2
925 0.24
926 0.28
927 0.27
928 0.28
929 0.27
930 0.24
931 0.24
932 0.21
933 0.16
934 0.09
935 0.09
936 0.07
937 0.05
938 0.05
939 0.05
940 0.05
941 0.04
942 0.04
943 0.04
944 0.04
945 0.04
946 0.04
947 0.04
948 0.04
949 0.05
950 0.05
951 0.06
952 0.1
953 0.1
954 0.11
955 0.11
956 0.12
957 0.12
958 0.12
959 0.15
960 0.12
961 0.14
962 0.16
963 0.17
964 0.2
965 0.21
966 0.26
967 0.28
968 0.28
969 0.29
970 0.29
971 0.34
972 0.3
973 0.31
974 0.26
975 0.28
976 0.27
977 0.29
978 0.36
979 0.33
980 0.37
981 0.45
982 0.5
983 0.53
984 0.63
985 0.69
986 0.69
987 0.77
988 0.8
989 0.74
990 0.79
991 0.78
992 0.74
993 0.73
994 0.65
995 0.56
996 0.5
997 0.47
998 0.37
999 0.29
1000 0.24
1001 0.17
1002 0.14
1003 0.14
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.13
1007 0.15
1008 0.16
1009 0.15
1010 0.17
1011 0.18
1012 0.18
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.15
1016 0.14
1017 0.12
1018 0.11
1019 0.09
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.07
1023 0.07
1024 0.07
1025 0.06
1026 0.05
1027 0.05
1028 0.06
1029 0.06