Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IWS1

Protein Details
Accession A0A4T0IWS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-28GGDNAPRQRKYRKDGTQVQFKSFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSKREGGDNAPRQRKYRKDGTQVQFKSFSPPEGPAIFVTCVRGKEKQATHDILDILNEICDRYFPDMNVQQRNKVEIEGSDNRQEDKKEDDKVDVDKDTTDKKEDSDIKSQLAAELDEINKTQTPFKKPQNSSTDLKRFVNHPTDTQCMIYLEVRRPFNPIAIVERYLEEVEQTGKMRTKYIQRLTPVSHVAHASENAFEALCGFTFQNYLDASTADGIGGNYRIELRTRSHNTLKRDFIIQKIVDSISPPHRIDLSNPDRWCIVEVFKSVVGVSVVSSYAKFRKFNPFSLVEAKNKERAGGNSGVEQSKVEQDKEDKVEQKKEDKVEQDRDDKKEKTSIHHITFHLLRLVSGSNRLLSLLDRRSISLDFIAHTEWVSSLPWTLEVALSLVAKQPNLSWLRVERVLHAEDALNEQWLRVLHVSMQEAHHGKGCEQALDLGDIRSCTNITPATKLTSLEVSCKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.74
3 0.75
4 0.74
5 0.75
6 0.82
7 0.84
8 0.86
9 0.8
10 0.77
11 0.7
12 0.61
13 0.59
14 0.5
15 0.45
16 0.37
17 0.36
18 0.35
19 0.32
20 0.33
21 0.26
22 0.28
23 0.25
24 0.23
25 0.24
26 0.22
27 0.25
28 0.27
29 0.3
30 0.31
31 0.39
32 0.44
33 0.47
34 0.51
35 0.52
36 0.51
37 0.5
38 0.47
39 0.38
40 0.33
41 0.27
42 0.19
43 0.15
44 0.13
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.15
50 0.17
51 0.16
52 0.25
53 0.31
54 0.38
55 0.48
56 0.48
57 0.5
58 0.49
59 0.52
60 0.45
61 0.39
62 0.33
63 0.25
64 0.31
65 0.31
66 0.33
67 0.36
68 0.36
69 0.37
70 0.38
71 0.38
72 0.32
73 0.33
74 0.35
75 0.35
76 0.36
77 0.38
78 0.38
79 0.41
80 0.43
81 0.36
82 0.31
83 0.26
84 0.27
85 0.29
86 0.28
87 0.28
88 0.24
89 0.24
90 0.32
91 0.37
92 0.4
93 0.43
94 0.42
95 0.4
96 0.41
97 0.39
98 0.32
99 0.26
100 0.21
101 0.13
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.2
110 0.23
111 0.31
112 0.38
113 0.48
114 0.57
115 0.58
116 0.67
117 0.68
118 0.68
119 0.65
120 0.67
121 0.65
122 0.59
123 0.57
124 0.5
125 0.44
126 0.44
127 0.48
128 0.39
129 0.35
130 0.35
131 0.37
132 0.36
133 0.35
134 0.29
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.2
139 0.22
140 0.27
141 0.28
142 0.27
143 0.31
144 0.3
145 0.29
146 0.27
147 0.22
148 0.21
149 0.22
150 0.23
151 0.2
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.15
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.14
163 0.15
164 0.17
165 0.2
166 0.27
167 0.34
168 0.4
169 0.42
170 0.42
171 0.46
172 0.47
173 0.47
174 0.42
175 0.34
176 0.29
177 0.24
178 0.22
179 0.19
180 0.17
181 0.14
182 0.1
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.19
216 0.24
217 0.29
218 0.36
219 0.41
220 0.47
221 0.51
222 0.51
223 0.43
224 0.44
225 0.4
226 0.34
227 0.35
228 0.29
229 0.23
230 0.22
231 0.21
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.22
242 0.29
243 0.3
244 0.32
245 0.32
246 0.32
247 0.31
248 0.3
249 0.3
250 0.21
251 0.17
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.1
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.12
268 0.15
269 0.16
270 0.19
271 0.3
272 0.33
273 0.37
274 0.4
275 0.39
276 0.39
277 0.45
278 0.46
279 0.39
280 0.41
281 0.39
282 0.39
283 0.36
284 0.34
285 0.29
286 0.27
287 0.28
288 0.27
289 0.25
290 0.23
291 0.26
292 0.25
293 0.22
294 0.21
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.26
302 0.3
303 0.35
304 0.35
305 0.38
306 0.45
307 0.47
308 0.51
309 0.52
310 0.51
311 0.52
312 0.52
313 0.55
314 0.57
315 0.58
316 0.61
317 0.61
318 0.62
319 0.64
320 0.58
321 0.53
322 0.51
323 0.47
324 0.44
325 0.48
326 0.51
327 0.48
328 0.52
329 0.5
330 0.48
331 0.48
332 0.43
333 0.36
334 0.28
335 0.23
336 0.18
337 0.2
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.2
347 0.2
348 0.22
349 0.22
350 0.23
351 0.25
352 0.25
353 0.25
354 0.2
355 0.17
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.19
383 0.22
384 0.23
385 0.23
386 0.26
387 0.31
388 0.35
389 0.36
390 0.31
391 0.33
392 0.34
393 0.3
394 0.28
395 0.23
396 0.2
397 0.24
398 0.21
399 0.18
400 0.16
401 0.16
402 0.17
403 0.16
404 0.18
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.2
409 0.22
410 0.23
411 0.24
412 0.28
413 0.29
414 0.29
415 0.31
416 0.27
417 0.26
418 0.3
419 0.3
420 0.23
421 0.22
422 0.24
423 0.2
424 0.23
425 0.23
426 0.17
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.15
431 0.15
432 0.12
433 0.15
434 0.2
435 0.21
436 0.25
437 0.27
438 0.31
439 0.32
440 0.32
441 0.3
442 0.32
443 0.31