FuNGI

A0A4T0JPA8

Protein Details

Accession

A0A4T0JPA8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
113-137	DSDDEPSKPTKRRQPAKPRLPAIEP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
120-130	KPTKRRQPAKP

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005345 PHF5 IPR009091 RCC1/BLIP-II IPR000408 Reg_chr_condens
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF03660 PHF5 PF00415 RCC1
PROSITE	View protein in PROSITE PS00626 RCC1_2 PS50012 RCC1_3

Amino Acid Sequences

MCRRQPGISIGRLCDKCDGKCPVCDSYVRPQTIVKICDECAFGTFGGVICGGPGISDAYYCAEVFYTHLQPKDSQPTRQSKRVASNIPKSPTKPIQRAHTSSTASKKRKASDDSDDEPSKPTKRRQPAKPRLPAIEPVSLNPLPKLTSTNQIKTLLVFGTGDFGQFGLGVDTLGEIKRPRIHQWTEDAIDDNNLGPQGVEQIAAGGMHNLMIDSDGKIWSWGVNDGMSLGRITTDTGVEAEELETVPMKVDGLDDFRAVRVAAGDYISLAINDQGQLRAWGSFNSNDGLLGFDGKPNGARKQVLPSILPQLAKHRAVQAVCGADHALVLTTAGIVYAWGNGQQQQLGRRVIERRKLNGLTPEPLHLRKIVAVGTGSYHSFATDQDGVVFGWGLNKMRQTGVSDDRDGYEDSIAVPTPIDALHPDQHDGSRVVQISGGEHHTLFLFDNGQVWGCGRCDGKELGLSKDHPAYQAILENNEKVADDARHEKAKKLGTNVEDTEAPRTIADEYVDQPVRIQFPPPPTPDEPKPGNTPWEDGPSKTKIKQISAGLRHNLAVSDQGHVYSWGYGNACQLGHGAAESIEEPTRIDNTALTKVDALLVSAGGQHCAILAEKKGDENKVVDGKSKVDGKDEEDKEEEQDDENKEDKEDGKEDDQDDDKDEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.48
3	0.42
4	0.46
5	0.52
6	0.45
7	0.5
8	0.53
9	0.49
10	0.48
11	0.48
12	0.45
13	0.47
14	0.52
15	0.48
16	0.44
17	0.42
18	0.47
19	0.51
20	0.48
21	0.42
22	0.36
23	0.36
24	0.38
25	0.38
26	0.3
27	0.24
28	0.23
29	0.18
30	0.15
31	0.15
32	0.11
33	0.11
34	0.1
35	0.08
36	0.06
37	0.07
38	0.06
39	0.05
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.07
45	0.1
46	0.11
47	0.11
48	0.11
49	0.1
50	0.1
51	0.13
52	0.17
53	0.21
54	0.24
55	0.26
56	0.28
57	0.3
58	0.37
59	0.45
60	0.45
61	0.45
62	0.51
63	0.6
64	0.65
65	0.7
66	0.7
67	0.66
68	0.71
69	0.73
70	0.74
71	0.72
72	0.74
73	0.74
74	0.75
75	0.73
76	0.66
77	0.66
78	0.65
79	0.65
80	0.64
81	0.62
82	0.66
83	0.69
84	0.71
85	0.69
86	0.67
87	0.61
88	0.59
89	0.63
90	0.63
91	0.6
92	0.63
93	0.63
94	0.62
95	0.66
96	0.66
97	0.63
98	0.63
99	0.65
100	0.63
101	0.64
102	0.6
103	0.52
104	0.49
105	0.46
106	0.43
107	0.42
108	0.45
109	0.48
110	0.57
111	0.66
112	0.74
113	0.8
114	0.85
115	0.89
116	0.9
117	0.86
118	0.81
119	0.74
120	0.7
121	0.63
122	0.6
123	0.49
124	0.41
125	0.41
126	0.37
127	0.34
128	0.28
129	0.24
130	0.18
131	0.18
132	0.21
133	0.17
134	0.25
135	0.32
136	0.35
137	0.39
138	0.4
139	0.4
140	0.36
141	0.36
142	0.26
143	0.2
144	0.16
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.08
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.04
158	0.05
159	0.06
160	0.06
161	0.08
162	0.08
163	0.11
164	0.17
165	0.2
166	0.25
167	0.32
168	0.36
169	0.38
170	0.44
171	0.46
172	0.43
173	0.41
174	0.37
175	0.29
176	0.26
177	0.22
178	0.16
179	0.11
180	0.09
181	0.07
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.06
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.04
199	0.05
200	0.05
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.05
238	0.06
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.07
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.11
283	0.12
284	0.14
285	0.15
286	0.16
287	0.17
288	0.23
289	0.26
290	0.25
291	0.23
292	0.22
293	0.24
294	0.25
295	0.25
296	0.19
297	0.22
298	0.25
299	0.26
300	0.25
301	0.22
302	0.23
303	0.22
304	0.23
305	0.2
306	0.16
307	0.15
308	0.15
309	0.12
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.05
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.02
318	0.02
319	0.02
320	0.02
321	0.02
322	0.02
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.05
327	0.07
328	0.07
329	0.09
330	0.1
331	0.13
332	0.18
333	0.18
334	0.18
335	0.2
336	0.26
337	0.31
338	0.37
339	0.38
340	0.37
341	0.42
342	0.43
343	0.42
344	0.43
345	0.4
346	0.35
347	0.31
348	0.31
349	0.27
350	0.27
351	0.26
352	0.19
353	0.17
354	0.15
355	0.15
356	0.12
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.13
385	0.13
386	0.17
387	0.23
388	0.25
389	0.25
390	0.24
391	0.25
392	0.25
393	0.23
394	0.19
395	0.12
396	0.09
397	0.08
398	0.09
399	0.08
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.08
408	0.12
409	0.13
410	0.14
411	0.15
412	0.15
413	0.17
414	0.17
415	0.16
416	0.16
417	0.15
418	0.14
419	0.15
420	0.14
421	0.13
422	0.14
423	0.15
424	0.12
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.11
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.14
444	0.15
445	0.15
446	0.19
447	0.2
448	0.2
449	0.23
450	0.23
451	0.23
452	0.26
453	0.25
454	0.21
455	0.2
456	0.19
457	0.16
458	0.2
459	0.18
460	0.19
461	0.19
462	0.19
463	0.18
464	0.17
465	0.16
466	0.11
467	0.13
468	0.11
469	0.13
470	0.18
471	0.22
472	0.3
473	0.31
474	0.33
475	0.36
476	0.42
477	0.42
478	0.42
479	0.45
480	0.4
481	0.45
482	0.44
483	0.4
484	0.35
485	0.32
486	0.3
487	0.25
488	0.22
489	0.16
490	0.15
491	0.14
492	0.13
493	0.13
494	0.11
495	0.12
496	0.19
497	0.2
498	0.19
499	0.19
500	0.21
501	0.23
502	0.22
503	0.22
504	0.19
505	0.26
506	0.33
507	0.35
508	0.39
509	0.4
510	0.47
511	0.49
512	0.53
513	0.5
514	0.47
515	0.5
516	0.46
517	0.47
518	0.42
519	0.41
520	0.35
521	0.4
522	0.37
523	0.33
524	0.36
525	0.36
526	0.4
527	0.39
528	0.42
529	0.38
530	0.41
531	0.46
532	0.48
533	0.52
534	0.55
535	0.59
536	0.57
537	0.53
538	0.5
539	0.44
540	0.36
541	0.26
542	0.23
543	0.16
544	0.16
545	0.15
546	0.15
547	0.15
548	0.15
549	0.15
550	0.12
551	0.12
552	0.13
553	0.14
554	0.14
555	0.16
556	0.17
557	0.16
558	0.14
559	0.14
560	0.12
561	0.11
562	0.1
563	0.08
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.1
571	0.11
572	0.12
573	0.13
574	0.13
575	0.13
576	0.17
577	0.23
578	0.24
579	0.23
580	0.22
581	0.21
582	0.23
583	0.2
584	0.17
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.11
589	0.11
590	0.1
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.11
596	0.11
597	0.13
598	0.17
599	0.18
600	0.23
601	0.28
602	0.3
603	0.31
604	0.3
605	0.35
606	0.37
607	0.38
608	0.38
609	0.35
610	0.35
611	0.38
612	0.42
613	0.36
614	0.35
615	0.36
616	0.37
617	0.45
618	0.45
619	0.44
620	0.41
621	0.41
622	0.38
623	0.38
624	0.33
625	0.25
626	0.29
627	0.27
628	0.28
629	0.31
630	0.29
631	0.28
632	0.3
633	0.31
634	0.31
635	0.31
636	0.31
637	0.33
638	0.38
639	0.38
640	0.4
641	0.41
642	0.36

A0A4T0JPA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer