Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JB13

Protein Details
Accession A0A4T0JB13    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
480-507YENHLSSKAHKAKTRKPTTKPTQEEIERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
490-496KAKTRKP
Subcellular Location(s) nucl 12, mito_nucl 11.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0016765  F:transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MTNKKKLITIIGSTATGKSDLAVQLAKYRDGHVLNADSIQVYKGLDVISNKISESEQDSVKHHMMSFLDKDKEYSIPQFIADSGYLVDKLSAQKTLPVVAGGTHYYIHHLIFQNNLIKTDDISDKPHSLTANPHADFHSMISPLSSSDKDLIMALPSIKESQYTNVDSSNTPLYSHLHRILSLIDPVTASRWHLRDFRKVKRSLDIIWENGRKRSDIEQEQKASKSIDALSQTKYKNLVFWVYTDPDTLSKRLERRVEKMTEVCVLLVGSTCLTRAPKQGLLNEIEELRALENAFISNGQQDYTRGLFQAIGYKEFDAYFKATTEKERDEAFKQGLELMKIGTRRYAMKQLKWIQNKLLPEIVAHQKSASSDGVTSSIDIYMVDSSDISRWDEMVVHPAKDILDSELECGNKFELTKSTEFLNDEPLPDPKSYSEVAERLFSKESKLAASNAETGYRKITCGVCTNDPHNPIVLNEGMEYENHLSSKAHKAKTRKPTTKPTQEEIERLRKLKNRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.27
3 0.22
4 0.18
5 0.13
6 0.15
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.22
12 0.24
13 0.27
14 0.24
15 0.25
16 0.29
17 0.28
18 0.3
19 0.29
20 0.3
21 0.28
22 0.28
23 0.26
24 0.2
25 0.19
26 0.17
27 0.13
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.12
33 0.13
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.19
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.26
46 0.31
47 0.32
48 0.32
49 0.27
50 0.27
51 0.25
52 0.28
53 0.31
54 0.32
55 0.34
56 0.33
57 0.34
58 0.33
59 0.34
60 0.32
61 0.3
62 0.27
63 0.23
64 0.24
65 0.23
66 0.21
67 0.2
68 0.17
69 0.13
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.13
77 0.14
78 0.16
79 0.15
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.19
84 0.16
85 0.14
86 0.13
87 0.15
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.2
99 0.24
100 0.28
101 0.28
102 0.29
103 0.25
104 0.23
105 0.22
106 0.24
107 0.24
108 0.2
109 0.24
110 0.26
111 0.26
112 0.27
113 0.29
114 0.25
115 0.22
116 0.25
117 0.29
118 0.34
119 0.33
120 0.33
121 0.32
122 0.32
123 0.31
124 0.27
125 0.23
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.19
152 0.2
153 0.22
154 0.21
155 0.22
156 0.22
157 0.17
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.18
162 0.23
163 0.24
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.19
170 0.14
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.13
178 0.14
179 0.17
180 0.24
181 0.28
182 0.37
183 0.44
184 0.52
185 0.57
186 0.6
187 0.59
188 0.58
189 0.58
190 0.49
191 0.51
192 0.44
193 0.38
194 0.4
195 0.44
196 0.39
197 0.4
198 0.38
199 0.3
200 0.29
201 0.31
202 0.32
203 0.35
204 0.41
205 0.43
206 0.46
207 0.48
208 0.47
209 0.42
210 0.35
211 0.26
212 0.21
213 0.16
214 0.15
215 0.16
216 0.18
217 0.19
218 0.24
219 0.24
220 0.24
221 0.26
222 0.23
223 0.21
224 0.2
225 0.2
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.14
237 0.16
238 0.19
239 0.24
240 0.31
241 0.31
242 0.34
243 0.4
244 0.41
245 0.39
246 0.38
247 0.33
248 0.28
249 0.25
250 0.2
251 0.13
252 0.11
253 0.08
254 0.07
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.08
262 0.11
263 0.14
264 0.18
265 0.21
266 0.23
267 0.25
268 0.26
269 0.25
270 0.23
271 0.2
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.17
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.1
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.12
310 0.16
311 0.2
312 0.2
313 0.21
314 0.22
315 0.25
316 0.25
317 0.28
318 0.26
319 0.21
320 0.2
321 0.21
322 0.2
323 0.17
324 0.15
325 0.12
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.16
332 0.19
333 0.29
334 0.32
335 0.35
336 0.44
337 0.51
338 0.59
339 0.63
340 0.62
341 0.57
342 0.55
343 0.53
344 0.46
345 0.4
346 0.31
347 0.24
348 0.27
349 0.3
350 0.27
351 0.25
352 0.22
353 0.21
354 0.21
355 0.24
356 0.19
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.12
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.18
382 0.19
383 0.18
384 0.18
385 0.19
386 0.18
387 0.17
388 0.18
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.14
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.16
402 0.2
403 0.21
404 0.22
405 0.23
406 0.24
407 0.26
408 0.25
409 0.28
410 0.24
411 0.24
412 0.24
413 0.26
414 0.25
415 0.23
416 0.24
417 0.17
418 0.2
419 0.19
420 0.2
421 0.23
422 0.23
423 0.24
424 0.28
425 0.28
426 0.28
427 0.3
428 0.27
429 0.26
430 0.26
431 0.26
432 0.25
433 0.26
434 0.24
435 0.24
436 0.27
437 0.28
438 0.25
439 0.29
440 0.27
441 0.26
442 0.29
443 0.26
444 0.24
445 0.24
446 0.26
447 0.24
448 0.3
449 0.35
450 0.36
451 0.41
452 0.45
453 0.47
454 0.47
455 0.44
456 0.39
457 0.34
458 0.28
459 0.27
460 0.24
461 0.18
462 0.15
463 0.16
464 0.15
465 0.14
466 0.17
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.16
471 0.15
472 0.19
473 0.3
474 0.35
475 0.4
476 0.45
477 0.54
478 0.63
479 0.74
480 0.81
481 0.8
482 0.8
483 0.84
484 0.88
485 0.9
486 0.87
487 0.82
488 0.81
489 0.76
490 0.76
491 0.74
492 0.73
493 0.69
494 0.64
495 0.66