Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IQ65

Protein Details
Accession A0A4T0IQ65    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-52DVDVAIEKRRRKKMKGELRAEGEEBasic
373-401CIGCRKQKLKCLGGKPCQRCDKRGKDCVYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-44KRRRKKMKG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito_nucl 8.5, mito 5.5, E.R. 5, golg 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019411  MMM1_dom  
IPR031468  SMP_LBD  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10296  MMM1  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
cd21671  SMP_Mmm1  
Amino Acid Sequences MSFTLGLIVGQLSVIALLMLIIKYFIFSDVDVAIEKRRRKKMKGELRAEGEEGEEDTKGSTEKEESVEWMNLLLKSLYAVYRQHFNKVGKEKIEEMLNRRRGGVMDRIIVNDVGIGDKYPNFSNARYTQGKCYLDFDYNDELELDVTTKLMINYPKPRFGSIPVDVVIRLIRFSGSVWVEVDGGEMTVGLSSNYNLNIKCQSYVGSRAKLKDVPKIEELIYNNLDNILTNKLSEYKFKIVDHPPSPAITECLMSQSQQLPTLEPKAYSSLAINQKNIVELSGDKDLYLFKLDNISHHQPSEQTQKKEPSKSELVARRYMTDSTTPSSSRMSRMSSVPSVSSVSMSTLSTLSRDKDTRNHAHAHSPTNRQPLACIGCRKQKLKCLGGKPCQRCDKRGKDCVYDTQVRRRGPDRIAGGRLKPGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.03
3 0.03
4 0.03
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.06
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.19
21 0.25
22 0.32
23 0.4
24 0.5
25 0.58
26 0.64
27 0.74
28 0.78
29 0.82
30 0.85
31 0.84
32 0.82
33 0.8
34 0.76
35 0.66
36 0.55
37 0.44
38 0.34
39 0.27
40 0.19
41 0.13
42 0.1
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.13
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.21
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.17
60 0.15
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.15
67 0.16
68 0.25
69 0.26
70 0.31
71 0.37
72 0.38
73 0.44
74 0.49
75 0.54
76 0.48
77 0.5
78 0.48
79 0.44
80 0.48
81 0.42
82 0.41
83 0.45
84 0.48
85 0.45
86 0.43
87 0.41
88 0.35
89 0.35
90 0.36
91 0.3
92 0.28
93 0.28
94 0.29
95 0.29
96 0.28
97 0.23
98 0.16
99 0.12
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.22
111 0.24
112 0.3
113 0.34
114 0.36
115 0.38
116 0.44
117 0.45
118 0.39
119 0.39
120 0.35
121 0.33
122 0.31
123 0.29
124 0.26
125 0.24
126 0.23
127 0.2
128 0.17
129 0.14
130 0.13
131 0.1
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.09
138 0.12
139 0.16
140 0.26
141 0.29
142 0.35
143 0.35
144 0.37
145 0.35
146 0.37
147 0.38
148 0.31
149 0.31
150 0.25
151 0.25
152 0.23
153 0.22
154 0.18
155 0.11
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.22
191 0.24
192 0.26
193 0.28
194 0.29
195 0.31
196 0.34
197 0.34
198 0.31
199 0.31
200 0.3
201 0.29
202 0.3
203 0.28
204 0.27
205 0.26
206 0.24
207 0.22
208 0.18
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.12
219 0.13
220 0.16
221 0.19
222 0.21
223 0.24
224 0.24
225 0.31
226 0.31
227 0.38
228 0.37
229 0.35
230 0.32
231 0.3
232 0.3
233 0.24
234 0.21
235 0.14
236 0.13
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.18
248 0.22
249 0.2
250 0.17
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.18
257 0.26
258 0.29
259 0.28
260 0.27
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.18
265 0.11
266 0.09
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.11
276 0.08
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.25
281 0.3
282 0.29
283 0.29
284 0.29
285 0.25
286 0.3
287 0.38
288 0.38
289 0.36
290 0.41
291 0.51
292 0.57
293 0.62
294 0.6
295 0.57
296 0.55
297 0.53
298 0.56
299 0.54
300 0.52
301 0.51
302 0.5
303 0.45
304 0.41
305 0.39
306 0.32
307 0.28
308 0.27
309 0.24
310 0.26
311 0.24
312 0.24
313 0.27
314 0.27
315 0.26
316 0.27
317 0.28
318 0.27
319 0.29
320 0.33
321 0.32
322 0.32
323 0.28
324 0.26
325 0.24
326 0.22
327 0.2
328 0.15
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.14
337 0.15
338 0.2
339 0.22
340 0.25
341 0.32
342 0.41
343 0.47
344 0.5
345 0.54
346 0.5
347 0.56
348 0.58
349 0.59
350 0.57
351 0.57
352 0.59
353 0.61
354 0.61
355 0.52
356 0.48
357 0.48
358 0.47
359 0.46
360 0.47
361 0.45
362 0.53
363 0.61
364 0.64
365 0.63
366 0.64
367 0.67
368 0.69
369 0.71
370 0.71
371 0.74
372 0.79
373 0.83
374 0.82
375 0.82
376 0.84
377 0.79
378 0.78
379 0.78
380 0.79
381 0.79
382 0.81
383 0.78
384 0.76
385 0.76
386 0.77
387 0.75
388 0.74
389 0.69
390 0.7
391 0.71
392 0.65
393 0.65
394 0.61
395 0.6
396 0.55
397 0.57
398 0.55
399 0.55
400 0.6
401 0.6
402 0.58