Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J5L5

Protein Details
Accession A0A4T0J5L5    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-71GTAKMKFAPKIQPRKKPTEVKPEPTSDHydrophilic
191-221SIPKEHYKFDNKKDKKKKHLNKDIKPKVKPDBasic
318-340DDKEKEKDTKKDQDKKPDTKPDLAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-93KFAPKIQPRKKPTEVKPEPTSDPSSGRGRGRGRGDSTRGRGRGR
202-219KKDKKKKHLNKDIKPKVK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSNENPNENSNSNPNPANIGTLHTSNPNPSTSTRTNEYSSQTKAGTAKMKFAPKIQPRKKPTEVKPEPTSDPSSGRGRGRGRGDSTRGRGRGRGEVQMTASGPFAMGPSKNAGMGRARSAQASGITVGGNRQAMQKESAQLTGAGKPSRLAGDRGATVKDDPEQYSENEDEGMEIIDIQQVASLDQNAPTSIPKEHYKFDNKKDKKKKHLNKDIKPKVKPDPDGNVDEMKQDEDDDVEQADVEDIAKGGLDLSASEEEDETEDVAYDFTAALDADEDKMLFLQFPKTFPKFSAPPKQANTDKRVSFAGADQEKNQDEDDKEKEKDTKKDQDKKPDTKPDLSKLDQISQDDDAEGEIGELLVYEDGQVRIHLGNGQVYDLNRATQPSFLQNIVSIDHHHRQISVFGEVGLRYSAIPDIDRLIDQMYLEDQEEAAVKTDAGPALLITIHM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.34
4 0.33
5 0.26
6 0.25
7 0.25
8 0.24
9 0.25
10 0.25
11 0.26
12 0.27
13 0.29
14 0.27
15 0.26
16 0.27
17 0.34
18 0.34
19 0.39
20 0.39
21 0.41
22 0.43
23 0.45
24 0.48
25 0.45
26 0.44
27 0.42
28 0.37
29 0.37
30 0.35
31 0.37
32 0.39
33 0.35
34 0.38
35 0.41
36 0.48
37 0.46
38 0.5
39 0.54
40 0.56
41 0.66
42 0.68
43 0.72
44 0.73
45 0.8
46 0.84
47 0.84
48 0.83
49 0.84
50 0.83
51 0.81
52 0.8
53 0.76
54 0.71
55 0.66
56 0.61
57 0.53
58 0.47
59 0.43
60 0.42
61 0.42
62 0.4
63 0.42
64 0.41
65 0.45
66 0.49
67 0.51
68 0.51
69 0.53
70 0.57
71 0.58
72 0.62
73 0.63
74 0.62
75 0.57
76 0.55
77 0.51
78 0.54
79 0.49
80 0.49
81 0.42
82 0.4
83 0.39
84 0.38
85 0.35
86 0.26
87 0.22
88 0.15
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.17
100 0.19
101 0.21
102 0.24
103 0.25
104 0.25
105 0.23
106 0.24
107 0.23
108 0.19
109 0.18
110 0.14
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.19
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.17
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.15
139 0.17
140 0.2
141 0.21
142 0.2
143 0.18
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.14
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.2
153 0.2
154 0.17
155 0.15
156 0.14
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.12
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.27
184 0.36
185 0.42
186 0.5
187 0.58
188 0.6
189 0.68
190 0.77
191 0.8
192 0.81
193 0.86
194 0.86
195 0.86
196 0.9
197 0.9
198 0.88
199 0.91
200 0.9
201 0.87
202 0.8
203 0.74
204 0.71
205 0.67
206 0.61
207 0.54
208 0.51
209 0.47
210 0.46
211 0.43
212 0.36
213 0.29
214 0.26
215 0.22
216 0.15
217 0.11
218 0.09
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.21
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.3
277 0.3
278 0.37
279 0.46
280 0.44
281 0.49
282 0.52
283 0.58
284 0.59
285 0.6
286 0.58
287 0.55
288 0.51
289 0.46
290 0.44
291 0.37
292 0.3
293 0.25
294 0.28
295 0.24
296 0.25
297 0.25
298 0.28
299 0.28
300 0.28
301 0.26
302 0.22
303 0.19
304 0.23
305 0.27
306 0.28
307 0.29
308 0.31
309 0.38
310 0.4
311 0.47
312 0.51
313 0.56
314 0.61
315 0.7
316 0.74
317 0.79
318 0.82
319 0.83
320 0.84
321 0.84
322 0.79
323 0.78
324 0.77
325 0.73
326 0.71
327 0.65
328 0.61
329 0.53
330 0.53
331 0.47
332 0.43
333 0.37
334 0.31
335 0.29
336 0.23
337 0.19
338 0.14
339 0.11
340 0.09
341 0.06
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.11
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.2
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.19
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.2
373 0.23
374 0.22
375 0.22
376 0.21
377 0.22
378 0.21
379 0.2
380 0.19
381 0.23
382 0.28
383 0.3
384 0.29
385 0.29
386 0.28
387 0.31
388 0.3
389 0.25
390 0.2
391 0.17
392 0.19
393 0.18
394 0.18
395 0.14
396 0.12
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.13
418 0.12
419 0.13
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.15
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.1
428 0.11