Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4TNC4

Protein Details
Accession G4TNC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-506QKFSSSRIFRLPRHRRRTPRRHMVLVTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
489-498LPRHRRRTPR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 5.5, cyto_mito 4, plas 2, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MPTATTRSSDTQPRLKPVSGTKARRQERHLGHRYGRVRREGDEDIVREARSDDEEESESVHSDEGDSMSQSSAASLPDSHQRSSSRSFLRPDLSNGNTSSLSDPSEPVPSTSNSNSQVFQQSGLDWSDVANEHGEGVHVVQFDNMGDLVKENTGNDEDEGVPRASSRDPRVNKRPGGMSARQVYLKRLENDPAYIPRVGEFWGHDERLLDKDLRSLSGWWRGKWTARGGFSGRGRGSFGPSGHRRSLTIDAQSGGPQSDPVDQTWKHDGYEEMSKGDETSKLKNREETSRGRGRGRGVASRGLSHVTRPIRSQSSASQAQATPRPYGHGRSYSLWGRYEHAWTKHAVTFLFQDVLNKPKNGEDVGIRVKLPGQSRYNVVRIPKIDSSVDASSPSRPAQPARHIIVKLPNRPTSPKAENSSLPDLKLDIGEKQEVEPNPESDPQPSEVAQAKDSVEEAEREQADVTALQPGESIEHRSPQKFSSSRIFRLPRHRRRTPRRHMVLVTNIRCLVQPIQACKCPIHQCGLTLACHMDTQHHHPCPVTFIPLLLHLLFIKFIITIILTHFLMPTTFLMELRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.58
4 0.57
5 0.61
6 0.62
7 0.65
8 0.66
9 0.72
10 0.78
11 0.79
12 0.77
13 0.77
14 0.77
15 0.8
16 0.8
17 0.78
18 0.75
19 0.78
20 0.8
21 0.79
22 0.76
23 0.73
24 0.66
25 0.6
26 0.62
27 0.56
28 0.54
29 0.51
30 0.45
31 0.42
32 0.42
33 0.39
34 0.32
35 0.29
36 0.25
37 0.21
38 0.21
39 0.17
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.17
46 0.15
47 0.14
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.19
65 0.23
66 0.23
67 0.26
68 0.28
69 0.32
70 0.37
71 0.44
72 0.42
73 0.44
74 0.48
75 0.48
76 0.51
77 0.49
78 0.49
79 0.48
80 0.44
81 0.42
82 0.39
83 0.37
84 0.31
85 0.3
86 0.27
87 0.2
88 0.2
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.2
96 0.19
97 0.23
98 0.25
99 0.29
100 0.29
101 0.3
102 0.29
103 0.3
104 0.33
105 0.28
106 0.27
107 0.22
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.16
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.19
153 0.24
154 0.31
155 0.37
156 0.47
157 0.56
158 0.63
159 0.63
160 0.61
161 0.59
162 0.55
163 0.56
164 0.51
165 0.48
166 0.43
167 0.43
168 0.42
169 0.39
170 0.36
171 0.34
172 0.37
173 0.33
174 0.31
175 0.33
176 0.31
177 0.32
178 0.32
179 0.29
180 0.26
181 0.24
182 0.21
183 0.18
184 0.17
185 0.16
186 0.14
187 0.11
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.19
196 0.15
197 0.12
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.26
205 0.29
206 0.25
207 0.29
208 0.3
209 0.32
210 0.35
211 0.38
212 0.34
213 0.33
214 0.36
215 0.34
216 0.38
217 0.36
218 0.38
219 0.32
220 0.27
221 0.27
222 0.24
223 0.26
224 0.23
225 0.22
226 0.24
227 0.28
228 0.32
229 0.32
230 0.32
231 0.29
232 0.3
233 0.34
234 0.29
235 0.27
236 0.23
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.18
241 0.12
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.15
249 0.15
250 0.19
251 0.24
252 0.23
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.17
257 0.23
258 0.2
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.12
266 0.18
267 0.26
268 0.31
269 0.32
270 0.37
271 0.39
272 0.42
273 0.45
274 0.44
275 0.44
276 0.46
277 0.48
278 0.45
279 0.45
280 0.4
281 0.4
282 0.37
283 0.34
284 0.28
285 0.3
286 0.29
287 0.27
288 0.25
289 0.22
290 0.19
291 0.15
292 0.19
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.22
297 0.23
298 0.24
299 0.26
300 0.22
301 0.27
302 0.28
303 0.27
304 0.26
305 0.24
306 0.25
307 0.28
308 0.27
309 0.21
310 0.19
311 0.21
312 0.2
313 0.24
314 0.24
315 0.24
316 0.25
317 0.26
318 0.3
319 0.31
320 0.32
321 0.3
322 0.27
323 0.25
324 0.24
325 0.28
326 0.28
327 0.27
328 0.25
329 0.24
330 0.27
331 0.27
332 0.27
333 0.21
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.2
342 0.21
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.21
347 0.19
348 0.19
349 0.15
350 0.18
351 0.22
352 0.22
353 0.21
354 0.19
355 0.2
356 0.22
357 0.24
358 0.25
359 0.24
360 0.25
361 0.29
362 0.33
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.3
367 0.29
368 0.32
369 0.29
370 0.28
371 0.25
372 0.23
373 0.26
374 0.23
375 0.21
376 0.18
377 0.18
378 0.17
379 0.19
380 0.19
381 0.16
382 0.17
383 0.21
384 0.25
385 0.32
386 0.37
387 0.39
388 0.44
389 0.42
390 0.43
391 0.48
392 0.49
393 0.49
394 0.49
395 0.5
396 0.47
397 0.51
398 0.51
399 0.5
400 0.49
401 0.49
402 0.47
403 0.47
404 0.46
405 0.48
406 0.53
407 0.46
408 0.4
409 0.34
410 0.29
411 0.25
412 0.24
413 0.18
414 0.12
415 0.13
416 0.15
417 0.15
418 0.15
419 0.21
420 0.2
421 0.25
422 0.25
423 0.23
424 0.25
425 0.28
426 0.27
427 0.24
428 0.26
429 0.22
430 0.22
431 0.21
432 0.22
433 0.25
434 0.25
435 0.24
436 0.23
437 0.21
438 0.2
439 0.2
440 0.17
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.17
445 0.17
446 0.17
447 0.17
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.13
458 0.13
459 0.19
460 0.15
461 0.22
462 0.27
463 0.29
464 0.31
465 0.31
466 0.4
467 0.36
468 0.39
469 0.43
470 0.46
471 0.48
472 0.56
473 0.6
474 0.58
475 0.67
476 0.74
477 0.74
478 0.76
479 0.82
480 0.84
481 0.89
482 0.93
483 0.93
484 0.93
485 0.9
486 0.88
487 0.83
488 0.8
489 0.79
490 0.78
491 0.7
492 0.63
493 0.55
494 0.47
495 0.42
496 0.37
497 0.29
498 0.25
499 0.27
500 0.3
501 0.36
502 0.4
503 0.41
504 0.4
505 0.45
506 0.47
507 0.45
508 0.45
509 0.4
510 0.37
511 0.42
512 0.43
513 0.36
514 0.31
515 0.29
516 0.23
517 0.22
518 0.21
519 0.2
520 0.21
521 0.29
522 0.37
523 0.38
524 0.39
525 0.39
526 0.4
527 0.41
528 0.38
529 0.35
530 0.26
531 0.24
532 0.24
533 0.24
534 0.27
535 0.2
536 0.19
537 0.15
538 0.15
539 0.14
540 0.13
541 0.11
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.1
548 0.14
549 0.13
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.14
555 0.13
556 0.12
557 0.12