Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4LYY0

Protein Details
Accession A0A4V4LYY0    Localization Confidence Low Confidence Score 5.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-65QHPHTHHSRSHSHPRPRKPTYDGBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21, cyto_mito 12.333, mito_nucl 12.333, nucl 2.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
Amino Acid Sequences MFRAFPNSAVRVAGVRVAGVSARRISTQPGSGSGLGSRTRNTQHPHTHHSRSHSHPRPRKPTYDGTGKLQANDSYLLSQRVRELSQRSKFDEALKLVLSESRGEGLANVVVWNQLLQESRVAQNSNPTETYKLFMDMKKRGITPNSRSYTILFRAFSGGEKDRPSKKTLEAALTVFRQLGSYHAYLREEMDEEIIQEESSVLPINAYLALLAKVAHSYEMMKIFDDMAQSGPSSPDLYTYTTIFQGLLRAGQAEDVERGHELWRVYFARLKQASIDADNGADNATQSLQRLTPDTALISNVLRLFTKGTPKDCKAGLMIAHTFLSVPAPSPFIERQKGYLPRVELNDRVIDSLFHLGLAAGRPSLVIRHADHLLNQEKVRSFLRTRSMFFALLACAREGDAGKAIEYLRVMRSLKHGQPDAQSFEQAMAAAMRAQNASYKKACEVWEMVQATKTPVDIRIMSSLMKASLNERDVDVWDALEKLSGFPLSAFFNAKTHAAHPNDSRGQLKHQQFWEHRLAKSLLQAVDRVGRGEHVNIPGKTRRHDEMLDEYADMARTVLGVEQRAPRKQHKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.19
11 0.2
12 0.25
13 0.28
14 0.32
15 0.3
16 0.31
17 0.34
18 0.33
19 0.33
20 0.29
21 0.28
22 0.25
23 0.25
24 0.24
25 0.25
26 0.29
27 0.35
28 0.4
29 0.46
30 0.53
31 0.59
32 0.67
33 0.7
34 0.74
35 0.72
36 0.72
37 0.71
38 0.69
39 0.73
40 0.73
41 0.76
42 0.77
43 0.82
44 0.86
45 0.85
46 0.84
47 0.8
48 0.79
49 0.76
50 0.77
51 0.7
52 0.66
53 0.68
54 0.61
55 0.56
56 0.49
57 0.42
58 0.34
59 0.32
60 0.26
61 0.2
62 0.21
63 0.24
64 0.21
65 0.22
66 0.23
67 0.25
68 0.26
69 0.29
70 0.34
71 0.4
72 0.48
73 0.52
74 0.53
75 0.54
76 0.54
77 0.53
78 0.53
79 0.45
80 0.4
81 0.35
82 0.3
83 0.26
84 0.26
85 0.22
86 0.16
87 0.14
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.14
106 0.16
107 0.2
108 0.21
109 0.19
110 0.26
111 0.28
112 0.29
113 0.28
114 0.28
115 0.28
116 0.27
117 0.29
118 0.22
119 0.23
120 0.23
121 0.24
122 0.31
123 0.33
124 0.37
125 0.39
126 0.39
127 0.4
128 0.44
129 0.5
130 0.5
131 0.55
132 0.54
133 0.51
134 0.51
135 0.48
136 0.47
137 0.43
138 0.4
139 0.3
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.25
144 0.24
145 0.23
146 0.22
147 0.26
148 0.31
149 0.36
150 0.39
151 0.41
152 0.39
153 0.39
154 0.42
155 0.42
156 0.4
157 0.35
158 0.34
159 0.35
160 0.32
161 0.29
162 0.22
163 0.18
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.08
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.1
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.17
254 0.17
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.21
259 0.22
260 0.22
261 0.2
262 0.21
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.08
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.19
294 0.21
295 0.25
296 0.31
297 0.32
298 0.35
299 0.33
300 0.32
301 0.25
302 0.24
303 0.2
304 0.17
305 0.16
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.11
318 0.14
319 0.18
320 0.22
321 0.21
322 0.23
323 0.29
324 0.35
325 0.33
326 0.34
327 0.32
328 0.31
329 0.35
330 0.35
331 0.29
332 0.25
333 0.26
334 0.22
335 0.2
336 0.17
337 0.14
338 0.12
339 0.13
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.09
354 0.1
355 0.13
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.23
360 0.25
361 0.25
362 0.24
363 0.24
364 0.23
365 0.25
366 0.25
367 0.24
368 0.23
369 0.25
370 0.34
371 0.34
372 0.36
373 0.38
374 0.39
375 0.35
376 0.33
377 0.28
378 0.21
379 0.19
380 0.18
381 0.13
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.13
395 0.11
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.22
400 0.29
401 0.32
402 0.36
403 0.37
404 0.36
405 0.41
406 0.43
407 0.43
408 0.36
409 0.33
410 0.27
411 0.25
412 0.22
413 0.17
414 0.13
415 0.07
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.13
423 0.15
424 0.2
425 0.21
426 0.22
427 0.23
428 0.27
429 0.28
430 0.27
431 0.29
432 0.26
433 0.32
434 0.31
435 0.3
436 0.28
437 0.27
438 0.25
439 0.22
440 0.2
441 0.14
442 0.14
443 0.17
444 0.17
445 0.18
446 0.19
447 0.2
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.2
459 0.2
460 0.2
461 0.23
462 0.2
463 0.14
464 0.13
465 0.13
466 0.11
467 0.12
468 0.11
469 0.08
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.11
475 0.12
476 0.13
477 0.16
478 0.15
479 0.16
480 0.18
481 0.19
482 0.19
483 0.19
484 0.26
485 0.26
486 0.31
487 0.33
488 0.4
489 0.43
490 0.45
491 0.47
492 0.4
493 0.45
494 0.49
495 0.52
496 0.51
497 0.51
498 0.58
499 0.58
500 0.62
501 0.65
502 0.61
503 0.55
504 0.54
505 0.51
506 0.43
507 0.45
508 0.44
509 0.36
510 0.32
511 0.32
512 0.29
513 0.33
514 0.31
515 0.26
516 0.21
517 0.2
518 0.2
519 0.23
520 0.25
521 0.27
522 0.34
523 0.34
524 0.4
525 0.45
526 0.48
527 0.5
528 0.5
529 0.48
530 0.46
531 0.48
532 0.47
533 0.48
534 0.48
535 0.44
536 0.39
537 0.35
538 0.3
539 0.28
540 0.22
541 0.14
542 0.09
543 0.07
544 0.07
545 0.1
546 0.11
547 0.13
548 0.18
549 0.26
550 0.33
551 0.4
552 0.46