Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J8Q4

Protein Details
Accession A0A4T0J8Q4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-174VSNGRGRPRKRAPSTPPSRRVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-194RGRPRKRAPSTPPSRRVSSSHIKKEKDRDRERESHVAK
260-267KGTKSRRK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 13.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MAGRPSKKARIVKTLEANIVYTILPSSHTFMSRTQAIEVEVVQNNFGSFGRCSLRDCPTQACVTSPELLDDYTLHAMNAYESEKISTVEHQPVFAIEGAVKRCLSDQTKLIIGTLEQGDPFEDDGDVLKVVLRFQKNNTPTQYLPKQSTSSSVSNGRGRPRKRAPSTPPSRRVSSSHIKKEKDRDRERESHVAKKIEKNQEQCVICGTTDTSAWRFVGEPSSATGRVRACNSCGLYWKKNNSMRPEALWRAEEEKKELNKGTKSRRKISTHSRRDENVNVHTGDGSPVRRSFSVSQSQSSQALTQTQMRHSAHDSYPPKRTKTALSGLDNVLGDLGANKLNKRDNLLKAPPRKEAEPGFKIPTGPYTSPPRKTAYNNEYLQDILNSSPGTMLKHVFSEADVDAKEQDKNSSRYNSVDNLGSFPLQQEHTQNPSPLKWAMSSEAEDDDDDTTVVVGDASARKNSNAATPFDFSKLPPSSPPDSSEFVSPVNGKKNDVVLHLPGFEKSSSTREDEDEIDELASSPPDSAKRSKYGNLDELFQLISKKGNDDSPFIVDSPPEEPYPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.68
3 0.6
4 0.54
5 0.44
6 0.38
7 0.29
8 0.2
9 0.14
10 0.1
11 0.11
12 0.12
13 0.15
14 0.17
15 0.19
16 0.2
17 0.22
18 0.27
19 0.29
20 0.29
21 0.26
22 0.25
23 0.24
24 0.24
25 0.23
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.18
33 0.17
34 0.14
35 0.11
36 0.15
37 0.19
38 0.2
39 0.24
40 0.28
41 0.34
42 0.37
43 0.39
44 0.39
45 0.39
46 0.42
47 0.39
48 0.35
49 0.32
50 0.3
51 0.29
52 0.25
53 0.23
54 0.2
55 0.19
56 0.18
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.12
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.19
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.24
81 0.21
82 0.17
83 0.1
84 0.14
85 0.16
86 0.18
87 0.17
88 0.16
89 0.17
90 0.23
91 0.25
92 0.25
93 0.27
94 0.28
95 0.31
96 0.3
97 0.29
98 0.23
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.15
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.11
118 0.17
119 0.2
120 0.21
121 0.26
122 0.35
123 0.37
124 0.44
125 0.46
126 0.45
127 0.43
128 0.5
129 0.53
130 0.49
131 0.49
132 0.46
133 0.43
134 0.38
135 0.41
136 0.38
137 0.33
138 0.32
139 0.33
140 0.34
141 0.38
142 0.42
143 0.46
144 0.49
145 0.5
146 0.56
147 0.61
148 0.66
149 0.67
150 0.73
151 0.73
152 0.75
153 0.83
154 0.84
155 0.83
156 0.77
157 0.74
158 0.67
159 0.62
160 0.58
161 0.58
162 0.58
163 0.59
164 0.62
165 0.62
166 0.65
167 0.72
168 0.73
169 0.74
170 0.73
171 0.71
172 0.71
173 0.76
174 0.76
175 0.76
176 0.71
177 0.68
178 0.64
179 0.62
180 0.57
181 0.57
182 0.6
183 0.6
184 0.63
185 0.58
186 0.58
187 0.59
188 0.56
189 0.48
190 0.42
191 0.33
192 0.26
193 0.22
194 0.18
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.14
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.17
212 0.15
213 0.18
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.23
218 0.24
219 0.22
220 0.27
221 0.3
222 0.33
223 0.38
224 0.41
225 0.45
226 0.49
227 0.53
228 0.53
229 0.54
230 0.5
231 0.47
232 0.48
233 0.42
234 0.39
235 0.34
236 0.28
237 0.27
238 0.29
239 0.27
240 0.24
241 0.27
242 0.26
243 0.29
244 0.3
245 0.3
246 0.32
247 0.39
248 0.47
249 0.49
250 0.54
251 0.58
252 0.64
253 0.64
254 0.65
255 0.69
256 0.7
257 0.72
258 0.71
259 0.68
260 0.62
261 0.61
262 0.59
263 0.52
264 0.44
265 0.37
266 0.31
267 0.26
268 0.24
269 0.2
270 0.16
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.13
277 0.16
278 0.18
279 0.21
280 0.28
281 0.28
282 0.29
283 0.29
284 0.3
285 0.28
286 0.25
287 0.21
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.23
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.28
299 0.24
300 0.31
301 0.34
302 0.31
303 0.39
304 0.42
305 0.42
306 0.39
307 0.41
308 0.35
309 0.37
310 0.41
311 0.39
312 0.38
313 0.39
314 0.37
315 0.38
316 0.33
317 0.27
318 0.19
319 0.12
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.12
327 0.15
328 0.16
329 0.21
330 0.27
331 0.3
332 0.37
333 0.45
334 0.5
335 0.55
336 0.58
337 0.6
338 0.56
339 0.52
340 0.48
341 0.47
342 0.47
343 0.44
344 0.44
345 0.41
346 0.39
347 0.39
348 0.34
349 0.31
350 0.28
351 0.24
352 0.25
353 0.31
354 0.37
355 0.41
356 0.43
357 0.42
358 0.41
359 0.45
360 0.51
361 0.48
362 0.5
363 0.47
364 0.45
365 0.43
366 0.38
367 0.34
368 0.24
369 0.18
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.12
379 0.11
380 0.12
381 0.13
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.15
392 0.12
393 0.18
394 0.22
395 0.25
396 0.3
397 0.34
398 0.34
399 0.35
400 0.38
401 0.36
402 0.32
403 0.31
404 0.26
405 0.24
406 0.23
407 0.21
408 0.17
409 0.15
410 0.15
411 0.14
412 0.15
413 0.17
414 0.2
415 0.25
416 0.28
417 0.31
418 0.31
419 0.3
420 0.32
421 0.3
422 0.27
423 0.22
424 0.21
425 0.22
426 0.22
427 0.22
428 0.21
429 0.2
430 0.2
431 0.18
432 0.17
433 0.14
434 0.12
435 0.1
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.04
441 0.04
442 0.06
443 0.1
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.16
448 0.18
449 0.19
450 0.24
451 0.24
452 0.26
453 0.27
454 0.29
455 0.3
456 0.31
457 0.31
458 0.24
459 0.29
460 0.28
461 0.26
462 0.28
463 0.33
464 0.35
465 0.37
466 0.4
467 0.36
468 0.36
469 0.36
470 0.34
471 0.29
472 0.25
473 0.26
474 0.25
475 0.26
476 0.32
477 0.32
478 0.31
479 0.32
480 0.36
481 0.35
482 0.36
483 0.35
484 0.3
485 0.3
486 0.3
487 0.28
488 0.24
489 0.24
490 0.2
491 0.18
492 0.17
493 0.2
494 0.21
495 0.24
496 0.26
497 0.26
498 0.29
499 0.29
500 0.3
501 0.26
502 0.24
503 0.2
504 0.17
505 0.16
506 0.13
507 0.12
508 0.09
509 0.09
510 0.11
511 0.15
512 0.19
513 0.25
514 0.3
515 0.36
516 0.41
517 0.47
518 0.52
519 0.57
520 0.6
521 0.55
522 0.53
523 0.48
524 0.44
525 0.38
526 0.3
527 0.24
528 0.16
529 0.2
530 0.17
531 0.2
532 0.21
533 0.27
534 0.29
535 0.32
536 0.34
537 0.34
538 0.34
539 0.32
540 0.3
541 0.24
542 0.23
543 0.21
544 0.21