Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IHQ1

Protein Details
Accession A0A4T0IHQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-44VGARGKCKSFPKDDAKKPVHBasic
114-143DELKRRFYKNWYRSKKKAFTKYAKKHSENSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-130KKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 10.5, nucl 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045077  L3_arc_euk  
IPR000597  Ribosomal_L3  
IPR019926  Ribosomal_L3_CS  
IPR044892  Ribosomal_L3_dom_3_arc_sf  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00297  Ribosomal_L3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00474  RIBOSOMAL_L3  
Amino Acid Sequences MSHRKYEAPRHGSLGFLPKKRCTNVGARGKCKSFPKDDAKKPVHLTGLMGYKAGMTHVVRDLDRPGSKMHKREVVEPVTIVETPPMAVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSDELKRRFYKNWYRSKKKAFTKYAKKHSENSGASISREIERIKKYCQVVRVLAHTQVSKTSLQQKKAHLMEIQVNGGSVADKVDFAKSHFEKTFNASSVFEQDEVIDAIGITKGRGYEGVTKRWNVTRLPRKTHKGLRKVACIGAWHPSNVMFSVARSGQDGFHHRTELNKKVYRIANGEDNKNASTDFDPTDKQITPMGGFPHYGVVQNDFIMLKGCIVGPKKRAITLRKSHQVHTSRAHLEKVNLKFIDTSSKIGHGKFQTSAEKAAFYGSTSGRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.45
4 0.47
5 0.49
6 0.56
7 0.58
8 0.58
9 0.53
10 0.55
11 0.59
12 0.64
13 0.67
14 0.66
15 0.7
16 0.7
17 0.7
18 0.69
19 0.66
20 0.63
21 0.63
22 0.67
23 0.7
24 0.76
25 0.81
26 0.77
27 0.77
28 0.73
29 0.69
30 0.61
31 0.51
32 0.44
33 0.39
34 0.4
35 0.32
36 0.28
37 0.23
38 0.2
39 0.19
40 0.17
41 0.16
42 0.1
43 0.13
44 0.18
45 0.21
46 0.21
47 0.22
48 0.25
49 0.28
50 0.29
51 0.27
52 0.28
53 0.34
54 0.41
55 0.45
56 0.49
57 0.49
58 0.49
59 0.54
60 0.59
61 0.53
62 0.48
63 0.42
64 0.37
65 0.31
66 0.29
67 0.23
68 0.14
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.1
90 0.12
91 0.15
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.19
96 0.19
97 0.16
98 0.15
99 0.13
100 0.13
101 0.2
102 0.21
103 0.25
104 0.28
105 0.31
106 0.34
107 0.42
108 0.51
109 0.54
110 0.62
111 0.67
112 0.73
113 0.8
114 0.86
115 0.86
116 0.84
117 0.85
118 0.84
119 0.84
120 0.86
121 0.88
122 0.88
123 0.88
124 0.82
125 0.77
126 0.74
127 0.73
128 0.62
129 0.56
130 0.51
131 0.42
132 0.39
133 0.35
134 0.28
135 0.19
136 0.2
137 0.18
138 0.18
139 0.23
140 0.25
141 0.26
142 0.31
143 0.34
144 0.35
145 0.38
146 0.37
147 0.35
148 0.35
149 0.37
150 0.32
151 0.31
152 0.29
153 0.25
154 0.21
155 0.18
156 0.19
157 0.14
158 0.16
159 0.24
160 0.27
161 0.33
162 0.37
163 0.39
164 0.45
165 0.45
166 0.45
167 0.36
168 0.33
169 0.32
170 0.29
171 0.26
172 0.18
173 0.17
174 0.14
175 0.13
176 0.11
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.15
186 0.15
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.22
191 0.26
192 0.29
193 0.22
194 0.23
195 0.2
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.15
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.17
217 0.21
218 0.28
219 0.3
220 0.31
221 0.34
222 0.37
223 0.37
224 0.31
225 0.38
226 0.41
227 0.46
228 0.54
229 0.6
230 0.63
231 0.68
232 0.74
233 0.73
234 0.73
235 0.74
236 0.71
237 0.7
238 0.67
239 0.6
240 0.52
241 0.44
242 0.36
243 0.33
244 0.28
245 0.21
246 0.18
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.16
251 0.09
252 0.09
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.17
260 0.22
261 0.23
262 0.24
263 0.26
264 0.25
265 0.32
266 0.37
267 0.41
268 0.45
269 0.45
270 0.45
271 0.5
272 0.54
273 0.51
274 0.48
275 0.43
276 0.43
277 0.43
278 0.45
279 0.4
280 0.38
281 0.34
282 0.31
283 0.27
284 0.2
285 0.16
286 0.16
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.19
291 0.23
292 0.21
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.19
297 0.21
298 0.21
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.18
303 0.17
304 0.19
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.12
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.13
318 0.17
319 0.23
320 0.26
321 0.33
322 0.36
323 0.4
324 0.48
325 0.5
326 0.57
327 0.61
328 0.67
329 0.69
330 0.71
331 0.69
332 0.71
333 0.69
334 0.65
335 0.61
336 0.59
337 0.56
338 0.56
339 0.56
340 0.5
341 0.49
342 0.51
343 0.49
344 0.5
345 0.43
346 0.41
347 0.39
348 0.36
349 0.41
350 0.34
351 0.34
352 0.27
353 0.34
354 0.36
355 0.35
356 0.41
357 0.36
358 0.37
359 0.37
360 0.4
361 0.41
362 0.41
363 0.45
364 0.38
365 0.35
366 0.31
367 0.31
368 0.25
369 0.19
370 0.22
371 0.18