Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JJ39

Protein Details
Accession A0A4T0JJ39    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-99ETTPQPQPQKLGKRAKQTRQLVQMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
451-467KNRIKSKKARGGKKVVK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 8, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR007128  PMF1/Nnf1  
IPR007222  Sig_recog_particle_rcpt_asu_N  
IPR013822  Signal_recog_particl_SRP54_hlx  
IPR036225  SRP/SRP_N  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
Gene Ontology GO:0000444  C:MIS12/MIND type complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005785  C:signal recognition particle receptor complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03980  Nnf1  
PF04086  SRP-alpha_N  
PF00448  SRP54  
PF02881  SRP54_N  
CDD cd14826  SR_alpha_SRX  
cd17876  SRalpha_C  
Amino Acid Sequences MSDDTDMEVERIVDGEEGGNDGDKGQNKINDPEPAGSEAERDEAEGVRDTNGANGANVANAGVEASTSAIANPSETTPQPQPQKLGKRAKQTRQLVQMALNHIVEGWSYDNFAESFPAIAKDAPESLSSMREQTKDHFEASVTSSIAALHERRRVVESLNSLDDMLEEIQRAKRSKGTNFKKKGEMLANDPFLAYRVRRKAVLMQEHREMDDRVEDARREMDQLVGNIKEMEAEEEAGESEKRELERLLGVVDSSTQNIPIDEMRFIRVGGTVLWSRTYTQEAAHDAESAHSPTNTLIKEGVIEGRLTSSPHDINQYRVHWGLENKTDLIFVIAYSKIIQLGWVDELLETAKALFVSLFKPVIEHIIAALSGATPDDAVNLDLPAMFKGWDEVFDQLVNDIDKKKNIRGKSSNAGAATRNATSNQNKSAPTRNEPKAIDAEEISKNVEAMKNRIKSKKARGGKKVVKGETINDTPVDTKKGKKEMRSWGDKISSKQMSELDYSSGGADDGLDDKYVQTLVSDSSKGSHDGEVYTLAEYANEKGSDEDDDLLDIEIPALSDTPQKGTSWGIFSSLPSLNVLKGKKLNKNTLQPVLSSMSSLLMKKNVASSVSEQICDSVEQQLVGRTISSFSSIKGAVKSALTTSITRVLTPKTSTDILYEISQKKKTTTSNGKTTPYSVVFCGVNGVGKSTNLSKVTYWLLENRYKVLIAACDTFRSGAVEQLRTHVSNLNKLKLGSGVTAQVELYERGYGKDASGIARDALGYGAQNGFDVVLIDTAGRMQDNEPLMRALAKLTTVNEPDKIIFVGEALVGNEATDQLVKFDRALKDLSSGGGSGGSGRGIDGMLLTKFDTIDDKVGAALSMTYITGQPILFVGCGQVGEVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.14
10 0.16
11 0.2
12 0.24
13 0.29
14 0.32
15 0.38
16 0.42
17 0.44
18 0.44
19 0.43
20 0.4
21 0.37
22 0.35
23 0.3
24 0.26
25 0.21
26 0.2
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.15
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.17
39 0.15
40 0.13
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.1
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.15
62 0.16
63 0.21
64 0.25
65 0.33
66 0.41
67 0.43
68 0.48
69 0.53
70 0.63
71 0.67
72 0.73
73 0.72
74 0.75
75 0.81
76 0.84
77 0.85
78 0.83
79 0.82
80 0.8
81 0.78
82 0.69
83 0.64
84 0.59
85 0.53
86 0.48
87 0.39
88 0.29
89 0.25
90 0.22
91 0.17
92 0.14
93 0.11
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.17
115 0.17
116 0.2
117 0.22
118 0.23
119 0.25
120 0.27
121 0.35
122 0.35
123 0.35
124 0.31
125 0.27
126 0.28
127 0.3
128 0.28
129 0.19
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.18
137 0.23
138 0.24
139 0.25
140 0.29
141 0.29
142 0.29
143 0.32
144 0.32
145 0.31
146 0.32
147 0.31
148 0.27
149 0.26
150 0.23
151 0.18
152 0.14
153 0.1
154 0.09
155 0.11
156 0.15
157 0.21
158 0.22
159 0.23
160 0.28
161 0.34
162 0.43
163 0.51
164 0.59
165 0.64
166 0.71
167 0.75
168 0.75
169 0.72
170 0.7
171 0.67
172 0.6
173 0.55
174 0.54
175 0.5
176 0.43
177 0.4
178 0.32
179 0.25
180 0.24
181 0.2
182 0.21
183 0.26
184 0.28
185 0.3
186 0.32
187 0.39
188 0.45
189 0.54
190 0.52
191 0.51
192 0.54
193 0.54
194 0.53
195 0.48
196 0.39
197 0.29
198 0.24
199 0.2
200 0.17
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.17
210 0.19
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.16
215 0.16
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.07
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.12
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.17
266 0.14
267 0.13
268 0.16
269 0.17
270 0.19
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.15
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.2
300 0.19
301 0.23
302 0.28
303 0.28
304 0.27
305 0.28
306 0.27
307 0.23
308 0.25
309 0.26
310 0.24
311 0.24
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.17
316 0.15
317 0.11
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.1
388 0.11
389 0.14
390 0.16
391 0.22
392 0.27
393 0.29
394 0.37
395 0.4
396 0.44
397 0.47
398 0.48
399 0.45
400 0.4
401 0.38
402 0.31
403 0.27
404 0.22
405 0.17
406 0.14
407 0.13
408 0.17
409 0.19
410 0.21
411 0.23
412 0.25
413 0.26
414 0.28
415 0.35
416 0.34
417 0.36
418 0.41
419 0.4
420 0.42
421 0.41
422 0.41
423 0.35
424 0.32
425 0.28
426 0.2
427 0.21
428 0.16
429 0.16
430 0.15
431 0.12
432 0.1
433 0.1
434 0.12
435 0.1
436 0.13
437 0.21
438 0.26
439 0.31
440 0.36
441 0.4
442 0.45
443 0.54
444 0.59
445 0.6
446 0.63
447 0.66
448 0.72
449 0.74
450 0.75
451 0.73
452 0.65
453 0.6
454 0.52
455 0.47
456 0.42
457 0.35
458 0.28
459 0.2
460 0.19
461 0.16
462 0.17
463 0.19
464 0.15
465 0.18
466 0.22
467 0.32
468 0.35
469 0.39
470 0.46
471 0.52
472 0.59
473 0.62
474 0.59
475 0.55
476 0.57
477 0.54
478 0.49
479 0.46
480 0.41
481 0.33
482 0.33
483 0.3
484 0.25
485 0.24
486 0.23
487 0.16
488 0.13
489 0.14
490 0.11
491 0.1
492 0.07
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.06
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.1
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.09
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.07
547 0.08
548 0.1
549 0.11
550 0.11
551 0.12
552 0.14
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.13
558 0.13
559 0.17
560 0.16
561 0.14
562 0.13
563 0.13
564 0.13
565 0.18
566 0.18
567 0.18
568 0.24
569 0.3
570 0.37
571 0.43
572 0.51
573 0.54
574 0.62
575 0.64
576 0.64
577 0.58
578 0.51
579 0.47
580 0.4
581 0.33
582 0.24
583 0.18
584 0.13
585 0.14
586 0.14
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.15
592 0.14
593 0.14
594 0.15
595 0.17
596 0.23
597 0.24
598 0.24
599 0.21
600 0.2
601 0.2
602 0.19
603 0.16
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.11
608 0.13
609 0.13
610 0.12
611 0.12
612 0.09
613 0.1
614 0.1
615 0.13
616 0.1
617 0.1
618 0.13
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.16
623 0.14
624 0.14
625 0.14
626 0.12
627 0.14
628 0.14
629 0.14
630 0.15
631 0.21
632 0.2
633 0.2
634 0.22
635 0.21
636 0.23
637 0.24
638 0.23
639 0.2
640 0.22
641 0.22
642 0.21
643 0.2
644 0.18
645 0.19
646 0.24
647 0.26
648 0.3
649 0.33
650 0.33
651 0.33
652 0.37
653 0.4
654 0.43
655 0.49
656 0.52
657 0.58
658 0.62
659 0.64
660 0.59
661 0.57
662 0.52
663 0.43
664 0.37
665 0.28
666 0.25
667 0.21
668 0.2
669 0.19
670 0.14
671 0.14
672 0.12
673 0.14
674 0.11
675 0.12
676 0.14
677 0.14
678 0.2
679 0.18
680 0.2
681 0.18
682 0.21
683 0.23
684 0.23
685 0.22
686 0.22
687 0.27
688 0.31
689 0.31
690 0.31
691 0.29
692 0.27
693 0.26
694 0.22
695 0.19
696 0.17
697 0.2
698 0.18
699 0.18
700 0.18
701 0.18
702 0.16
703 0.17
704 0.15
705 0.17
706 0.2
707 0.23
708 0.23
709 0.26
710 0.29
711 0.26
712 0.27
713 0.27
714 0.25
715 0.31
716 0.36
717 0.37
718 0.36
719 0.35
720 0.35
721 0.32
722 0.31
723 0.23
724 0.2
725 0.19
726 0.17
727 0.17
728 0.16
729 0.15
730 0.15
731 0.14
732 0.13
733 0.12
734 0.12
735 0.13
736 0.16
737 0.15
738 0.14
739 0.16
740 0.16
741 0.16
742 0.17
743 0.17
744 0.15
745 0.15
746 0.14
747 0.11
748 0.1
749 0.09
750 0.07
751 0.08
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.08
756 0.08
757 0.07
758 0.08
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.07
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.13
770 0.17
771 0.18
772 0.18
773 0.19
774 0.19
775 0.19
776 0.18
777 0.14
778 0.12
779 0.13
780 0.14
781 0.15
782 0.21
783 0.24
784 0.26
785 0.26
786 0.27
787 0.26
788 0.25
789 0.23
790 0.18
791 0.13
792 0.11
793 0.1
794 0.09
795 0.09
796 0.08
797 0.09
798 0.08
799 0.08
800 0.08
801 0.07
802 0.07
803 0.08
804 0.07
805 0.09
806 0.12
807 0.13
808 0.14
809 0.21
810 0.23
811 0.24
812 0.26
813 0.25
814 0.25
815 0.25
816 0.25
817 0.19
818 0.17
819 0.15
820 0.13
821 0.12
822 0.1
823 0.09
824 0.08
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.07
831 0.09
832 0.09
833 0.1
834 0.11
835 0.11
836 0.11
837 0.12
838 0.14
839 0.14
840 0.17
841 0.17
842 0.16
843 0.16
844 0.16
845 0.15
846 0.12
847 0.1
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.08
854 0.1
855 0.1
856 0.1
857 0.1
858 0.11
859 0.1
860 0.1
861 0.1
862 0.09
863 0.09