Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J6U2

Protein Details
Accession A0A4T0J6U2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-83SVSGSKTKKRKSASKSDAKKPASRHydrophilic
104-128IIPTQSKKKKAENTTHRQNKQKTDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-80KTKKRKSASKSDAKKP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR032423  AAA_assoc_2  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR021886  MgsA_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR006642  Rad18_UBZ4  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF16193  AAA_assoc_2  
PF12002  MgsA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51908  ZF_UBZ4  
CDD cd00009  AAA  
cd18139  HLD_clamp_RarA  
Amino Acid Sequences MNTVKCPVCAIVLPSDAINDHLDKSCTLAKSPSKPRTSAIQNQIKNENGDWSFMTPASGSVSGSKTKKRKSASKSDAKKPASRVDDNDKDNDNDKNDSDSDLEIIPTQSKKKKAENTTHRQNKQKTDVPPAPIFTTKATQSTPNNLIQAQPLAERVRPTTIDGYVGQEDLMGENGILRSMILSDNIPSSIFWGPPGSGKTTLARIIAHRSNAKLKELSATNSGVAEAKQILDQAKTTLKLNGTRTILFIDEIHRYSKSQQDTFLPYMESGACVVIGATTENPSFKINNALLSRCHVYCLTKLSGEDITTMLRNALHKWRDQNAHHAHQAIEEIIDADFLRYLSSISDGDGRAALNSLEMVLRAVEIRHRSTTTKPTTKEDLLGSLKRSMVLKYDRDGDFHYDSISAFHKAVRGSCVDGALYWLARMVEAGEDALYIARRMVVIASEDVGMADCAALPLATATYQACQFIGLPECRINLAHCTVYLAEAAKSIRSYVGYNNAVDAVRNHPQYPVPIHLRNAPTQLMKSLGYGREYLYNPAYAHPVHQEYFPHDLPHDARLINREHKVHDQQLLDEWEKESVSVKSGDGQLHQQESSAQPAKCPKGLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.19
4 0.19
5 0.18
6 0.15
7 0.16
8 0.18
9 0.2
10 0.19
11 0.22
12 0.26
13 0.25
14 0.26
15 0.31
16 0.36
17 0.45
18 0.56
19 0.61
20 0.61
21 0.62
22 0.63
23 0.64
24 0.65
25 0.65
26 0.65
27 0.65
28 0.64
29 0.67
30 0.7
31 0.64
32 0.58
33 0.48
34 0.45
35 0.36
36 0.34
37 0.3
38 0.26
39 0.24
40 0.21
41 0.21
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.15
48 0.18
49 0.24
50 0.28
51 0.37
52 0.42
53 0.49
54 0.57
55 0.62
56 0.69
57 0.71
58 0.78
59 0.8
60 0.82
61 0.84
62 0.85
63 0.87
64 0.82
65 0.79
66 0.74
67 0.72
68 0.69
69 0.65
70 0.61
71 0.61
72 0.64
73 0.61
74 0.61
75 0.55
76 0.49
77 0.47
78 0.46
79 0.39
80 0.34
81 0.31
82 0.31
83 0.28
84 0.27
85 0.26
86 0.21
87 0.2
88 0.17
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.16
94 0.24
95 0.28
96 0.36
97 0.41
98 0.5
99 0.58
100 0.65
101 0.73
102 0.76
103 0.8
104 0.84
105 0.88
106 0.86
107 0.86
108 0.83
109 0.81
110 0.79
111 0.76
112 0.7
113 0.7
114 0.68
115 0.65
116 0.61
117 0.54
118 0.49
119 0.43
120 0.4
121 0.32
122 0.3
123 0.25
124 0.25
125 0.24
126 0.27
127 0.28
128 0.34
129 0.36
130 0.35
131 0.36
132 0.33
133 0.32
134 0.27
135 0.26
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.18
141 0.19
142 0.19
143 0.21
144 0.2
145 0.23
146 0.22
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.22
151 0.19
152 0.19
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.09
157 0.09
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.07
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.2
188 0.21
189 0.19
190 0.19
191 0.17
192 0.23
193 0.24
194 0.27
195 0.26
196 0.27
197 0.34
198 0.34
199 0.36
200 0.3
201 0.27
202 0.29
203 0.28
204 0.28
205 0.23
206 0.22
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.22
227 0.25
228 0.28
229 0.28
230 0.27
231 0.27
232 0.25
233 0.23
234 0.18
235 0.16
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.16
243 0.21
244 0.23
245 0.22
246 0.23
247 0.25
248 0.3
249 0.31
250 0.29
251 0.24
252 0.19
253 0.19
254 0.16
255 0.13
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.14
273 0.13
274 0.18
275 0.19
276 0.2
277 0.19
278 0.21
279 0.23
280 0.17
281 0.18
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.18
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.15
292 0.14
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.1
301 0.16
302 0.18
303 0.2
304 0.24
305 0.3
306 0.35
307 0.36
308 0.43
309 0.43
310 0.45
311 0.44
312 0.41
313 0.35
314 0.29
315 0.28
316 0.18
317 0.12
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.08
352 0.11
353 0.13
354 0.15
355 0.17
356 0.2
357 0.24
358 0.33
359 0.39
360 0.43
361 0.43
362 0.46
363 0.5
364 0.49
365 0.47
366 0.39
367 0.36
368 0.33
369 0.33
370 0.3
371 0.26
372 0.25
373 0.24
374 0.24
375 0.18
376 0.2
377 0.23
378 0.24
379 0.23
380 0.3
381 0.29
382 0.3
383 0.31
384 0.3
385 0.27
386 0.24
387 0.23
388 0.16
389 0.16
390 0.16
391 0.16
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.16
399 0.15
400 0.16
401 0.17
402 0.16
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.1
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.05
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.04
447 0.05
448 0.05
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.16
457 0.16
458 0.18
459 0.19
460 0.2
461 0.2
462 0.2
463 0.19
464 0.17
465 0.19
466 0.17
467 0.16
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.17
472 0.14
473 0.1
474 0.12
475 0.13
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.14
482 0.15
483 0.24
484 0.25
485 0.25
486 0.25
487 0.26
488 0.24
489 0.23
490 0.21
491 0.18
492 0.22
493 0.24
494 0.24
495 0.24
496 0.26
497 0.3
498 0.33
499 0.35
500 0.36
501 0.38
502 0.4
503 0.45
504 0.47
505 0.45
506 0.45
507 0.4
508 0.36
509 0.33
510 0.33
511 0.28
512 0.25
513 0.24
514 0.26
515 0.25
516 0.24
517 0.24
518 0.23
519 0.27
520 0.28
521 0.3
522 0.26
523 0.27
524 0.25
525 0.26
526 0.28
527 0.22
528 0.23
529 0.24
530 0.27
531 0.24
532 0.26
533 0.27
534 0.28
535 0.35
536 0.34
537 0.3
538 0.26
539 0.3
540 0.3
541 0.31
542 0.3
543 0.24
544 0.25
545 0.27
546 0.34
547 0.37
548 0.41
549 0.41
550 0.42
551 0.5
552 0.56
553 0.57
554 0.57
555 0.51
556 0.46
557 0.5
558 0.51
559 0.44
560 0.38
561 0.33
562 0.28
563 0.26
564 0.25
565 0.21
566 0.16
567 0.17
568 0.17
569 0.16
570 0.19
571 0.23
572 0.25
573 0.25
574 0.3
575 0.33
576 0.35
577 0.34
578 0.29
579 0.29
580 0.28
581 0.35
582 0.36
583 0.3
584 0.32
585 0.42
586 0.46
587 0.46