Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IHY9

Protein Details
Accession A0A4T0IHY9    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-344NGIGQGPPRKSRKNRSGQREPRRGKDSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-297RGGPGSERRRKEKEHLK
323-345PPRKSRKNRSGQREPRRGKDSGR
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences DANDADNSISHLTLPDYINVNLDDPADTQNHKIRVLDGDDKEYTENESDFVDVDQHGAGPVRYFQEDVNRHEYTVCRTCKQTGHLSKDCPHIICLTCGAVDEHRERDCPISLVCYNCGGRGHFARNCTVPKQKDSRLSCRRCGSPSHQTRACLTLWRIYQYVDAEHFDSKPQKESKDDAERKDIQQARTEMWCYNCADSGHLGDDCDMRRGCPIPLIEPSAFSEQNLFSGPFKTALIGDKKKGRNGSNGDKNSNSNTNAYRRAKHLDRASGYPPNTRIPDRGGPGSERRRKEKEHLKRLEESSDDSDDYDRYVADINGIGQGPPRKSRKNRSGQREPRRGKDSGRESGGSWSKNEVDKGSDRDSLLDSRRRQAPNPPPPRFGRYEDNYRSYKNIDRPKSTGSRSTWRGGYGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.23
7 0.23
8 0.19
9 0.18
10 0.16
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.22
16 0.28
17 0.31
18 0.31
19 0.3
20 0.29
21 0.32
22 0.37
23 0.41
24 0.36
25 0.39
26 0.38
27 0.39
28 0.37
29 0.32
30 0.29
31 0.22
32 0.2
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.25
53 0.3
54 0.34
55 0.39
56 0.37
57 0.36
58 0.37
59 0.38
60 0.36
61 0.39
62 0.38
63 0.34
64 0.36
65 0.4
66 0.43
67 0.46
68 0.49
69 0.5
70 0.55
71 0.58
72 0.6
73 0.6
74 0.63
75 0.61
76 0.51
77 0.43
78 0.39
79 0.34
80 0.3
81 0.27
82 0.2
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.13
87 0.16
88 0.18
89 0.2
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.24
95 0.21
96 0.18
97 0.2
98 0.21
99 0.22
100 0.22
101 0.23
102 0.22
103 0.22
104 0.24
105 0.19
106 0.21
107 0.23
108 0.29
109 0.27
110 0.29
111 0.3
112 0.33
113 0.35
114 0.37
115 0.41
116 0.38
117 0.43
118 0.48
119 0.51
120 0.56
121 0.59
122 0.65
123 0.67
124 0.69
125 0.69
126 0.68
127 0.65
128 0.58
129 0.58
130 0.54
131 0.55
132 0.57
133 0.58
134 0.55
135 0.53
136 0.52
137 0.49
138 0.42
139 0.36
140 0.29
141 0.26
142 0.25
143 0.26
144 0.24
145 0.22
146 0.23
147 0.19
148 0.19
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.19
156 0.19
157 0.24
158 0.25
159 0.26
160 0.29
161 0.31
162 0.37
163 0.43
164 0.47
165 0.44
166 0.48
167 0.49
168 0.47
169 0.52
170 0.49
171 0.39
172 0.39
173 0.38
174 0.32
175 0.31
176 0.32
177 0.25
178 0.22
179 0.23
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.1
192 0.1
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.15
203 0.19
204 0.17
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.16
210 0.16
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.13
223 0.2
224 0.22
225 0.25
226 0.33
227 0.35
228 0.39
229 0.44
230 0.42
231 0.42
232 0.47
233 0.53
234 0.55
235 0.57
236 0.56
237 0.52
238 0.51
239 0.46
240 0.43
241 0.35
242 0.28
243 0.28
244 0.3
245 0.37
246 0.39
247 0.38
248 0.37
249 0.43
250 0.43
251 0.47
252 0.47
253 0.46
254 0.45
255 0.47
256 0.48
257 0.47
258 0.45
259 0.42
260 0.38
261 0.35
262 0.35
263 0.33
264 0.31
265 0.3
266 0.34
267 0.33
268 0.34
269 0.31
270 0.31
271 0.39
272 0.47
273 0.5
274 0.5
275 0.54
276 0.57
277 0.6
278 0.67
279 0.69
280 0.69
281 0.72
282 0.76
283 0.74
284 0.74
285 0.72
286 0.66
287 0.56
288 0.5
289 0.43
290 0.36
291 0.31
292 0.25
293 0.23
294 0.19
295 0.18
296 0.14
297 0.1
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.13
308 0.18
309 0.2
310 0.27
311 0.34
312 0.42
313 0.51
314 0.62
315 0.69
316 0.75
317 0.82
318 0.84
319 0.89
320 0.9
321 0.91
322 0.92
323 0.87
324 0.85
325 0.81
326 0.74
327 0.69
328 0.68
329 0.65
330 0.62
331 0.6
332 0.53
333 0.48
334 0.54
335 0.54
336 0.45
337 0.38
338 0.34
339 0.33
340 0.35
341 0.36
342 0.29
343 0.28
344 0.32
345 0.36
346 0.37
347 0.37
348 0.34
349 0.34
350 0.35
351 0.36
352 0.38
353 0.41
354 0.4
355 0.43
356 0.51
357 0.53
358 0.53
359 0.57
360 0.61
361 0.64
362 0.71
363 0.7
364 0.69
365 0.71
366 0.75
367 0.7
368 0.64
369 0.63
370 0.6
371 0.64
372 0.65
373 0.67
374 0.64
375 0.61
376 0.58
377 0.53
378 0.54
379 0.53
380 0.56
381 0.58
382 0.61
383 0.62
384 0.67
385 0.71
386 0.68
387 0.67
388 0.64
389 0.65
390 0.63
391 0.65
392 0.59
393 0.56