Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JCG0

Protein Details
Accession A0A4T0JCG0    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-63PETNTETPQQPPKKKRIRKSAKKYKKAAQHEAEHydrophilic
117-141EKTAAIKKHKSNKRREDRIAQRQSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-58PKKKRIRKSAKKYKKAA
111-132KKTAKLEKTAAIKKHKSNKRRE
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 16, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MGRKRNYVDAGFEGALGADTADTASVPENSPETNTETPQQPPKKKRIRKSAKKYKKAAQHEAEGKREDTADNDGDKTGDKSGIPSNSNKFSATGANATTPQPSQPSQPSEKKTAKLEKTAAIKKHKSNKRREDRIAQRQSDTLCYGCRQKGHSVDRCPQNDGKKQSTLCYRCGSTTHSLKLCRKPKPKDGVELPYASCFICNNKGHLAGQCERNQRGVYPRGGECKICKSVEHLAKDCPVRSDQEKEARRPPLIVGTGETGGNADEDDFHVLTARKTDIEMKEKAIKSGKGGLATPKQPNKKVVGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.13
4 0.09
5 0.04
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.06
12 0.08
13 0.09
14 0.1
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.16
19 0.21
20 0.22
21 0.23
22 0.26
23 0.28
24 0.33
25 0.41
26 0.49
27 0.53
28 0.58
29 0.67
30 0.74
31 0.8
32 0.85
33 0.87
34 0.88
35 0.9
36 0.93
37 0.94
38 0.94
39 0.94
40 0.92
41 0.89
42 0.88
43 0.86
44 0.85
45 0.79
46 0.77
47 0.76
48 0.74
49 0.71
50 0.63
51 0.54
52 0.44
53 0.39
54 0.3
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.19
63 0.18
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.13
68 0.18
69 0.22
70 0.24
71 0.27
72 0.31
73 0.33
74 0.35
75 0.33
76 0.28
77 0.25
78 0.25
79 0.22
80 0.19
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.18
91 0.21
92 0.27
93 0.33
94 0.4
95 0.43
96 0.49
97 0.52
98 0.51
99 0.54
100 0.57
101 0.53
102 0.52
103 0.5
104 0.47
105 0.51
106 0.54
107 0.53
108 0.52
109 0.54
110 0.55
111 0.63
112 0.66
113 0.66
114 0.71
115 0.75
116 0.78
117 0.81
118 0.8
119 0.81
120 0.83
121 0.85
122 0.83
123 0.74
124 0.64
125 0.57
126 0.51
127 0.43
128 0.34
129 0.24
130 0.16
131 0.15
132 0.18
133 0.17
134 0.19
135 0.19
136 0.22
137 0.3
138 0.37
139 0.42
140 0.44
141 0.5
142 0.55
143 0.54
144 0.53
145 0.49
146 0.48
147 0.48
148 0.48
149 0.45
150 0.42
151 0.41
152 0.41
153 0.47
154 0.42
155 0.39
156 0.36
157 0.33
158 0.3
159 0.3
160 0.3
161 0.27
162 0.29
163 0.3
164 0.31
165 0.36
166 0.41
167 0.5
168 0.53
169 0.57
170 0.62
171 0.64
172 0.7
173 0.74
174 0.72
175 0.7
176 0.69
177 0.65
178 0.59
179 0.54
180 0.45
181 0.36
182 0.33
183 0.24
184 0.18
185 0.13
186 0.12
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.22
191 0.24
192 0.25
193 0.28
194 0.31
195 0.27
196 0.32
197 0.36
198 0.4
199 0.39
200 0.41
201 0.38
202 0.35
203 0.38
204 0.36
205 0.34
206 0.32
207 0.34
208 0.37
209 0.38
210 0.38
211 0.34
212 0.35
213 0.37
214 0.33
215 0.31
216 0.3
217 0.37
218 0.42
219 0.45
220 0.41
221 0.38
222 0.43
223 0.46
224 0.42
225 0.35
226 0.3
227 0.29
228 0.31
229 0.34
230 0.36
231 0.43
232 0.49
233 0.52
234 0.58
235 0.58
236 0.55
237 0.5
238 0.45
239 0.42
240 0.38
241 0.34
242 0.28
243 0.25
244 0.25
245 0.24
246 0.22
247 0.14
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.17
261 0.17
262 0.14
263 0.16
264 0.24
265 0.28
266 0.34
267 0.35
268 0.38
269 0.46
270 0.46
271 0.5
272 0.49
273 0.44
274 0.42
275 0.48
276 0.45
277 0.39
278 0.4
279 0.43
280 0.44
281 0.5
282 0.55
283 0.56
284 0.62
285 0.64
286 0.68