Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JBQ2

Protein Details
Accession A0A4T0JBQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
350-374QIRLLRGKKLTRRERRQLKRTTSDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-368LLRGKKLTRRERRQLK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, mito 4, pero 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011992  EF-hand-dom_pair  
IPR002048  EF_hand_dom  
IPR033122  LETM1-like_RBD  
IPR044202  LETM1/MDM38-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0015297  F:antiporter activity  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0043022  F:ribosome binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF07766  LETM1_RBD  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50222  EF_HAND_2  
PS51758  LETM1_RBD  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MLRDGGTGDWIGTFLGHKGAVWSAKLSLDTALAVTASADFSAKVWDSYTGTCLHTLPHNHIVRSAAISPDGLRVLTGGNERLLRLFHLGDIDNVTTLESSTGDVHAHSTTIKSVLWQDTAHAISGSEDGEIKWWTLSNSDKDYTECTKTIQLDHPLSFLEWSANGHIMIAIAANDVYFFDTHSPGSLLKCLTLPHKPSCASIHPITRDRFVVGLADDTWVRIYDYNTAQELDCFKGHHGPVHAVEFSPDGEYFASGSEDGTIRMWQNTPGPPPLSLLKQQPLSTPATALRLYSTNSTEKEKKHKDDKDSKAITTDPLSTRVWSKVKHEAQHYWHGSKLLAKEIRISARLQIRLLRGKKLTRRERRQLKRTTSDLLRLIPFVPFVLIPFMELFLPVALKLFPNMLPSTFEDKFAADEKKRKLLRVRLEMAKFLQETIKESGIRASESVTGSDEFKEFFRKIRTTGEHPSHSDVVKVARLFNNDLTLDNLSRPQLVSMCRYMNINAFGTDNYLRGHIRRRLEHLKRDDVLIKSENVDSLSTSELQHACQSRGIRVATHSNARLRDDLSQWVELHTTQEISGVLLVLSKAFNFAHLEDSVIASLEATLCSLPDVLLNEAELEVSDEATYKQKLDVLQEQEELIEDEAEQEQKEVEARQAQKEAEKAKKGEELEKARNLLPDEETDKQHEDDIRMTPEQLGELGQALNILSAKSSVLKERVELETLVEQTRDAERQAEEAQAGLPQEEKKVDKTNENVKKQVKSMINKIDSQLSDYDEKVGTQLNLIQVNNLGQISIHDLKQALRVIKHSPDEEHIDTIVHKLDVDKDGLVMLDDVVELAQEEGLGTVLDDSSQKIVDQGSEIRGNDKNNESSKKIKKEEIVQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.09
4 0.09
5 0.11
6 0.16
7 0.18
8 0.18
9 0.19
10 0.18
11 0.2
12 0.21
13 0.2
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.15
33 0.17
34 0.19
35 0.21
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.2
40 0.19
41 0.23
42 0.25
43 0.3
44 0.37
45 0.4
46 0.39
47 0.41
48 0.41
49 0.37
50 0.37
51 0.32
52 0.24
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.15
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.14
63 0.16
64 0.14
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.2
78 0.19
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.17
101 0.2
102 0.22
103 0.2
104 0.21
105 0.24
106 0.25
107 0.23
108 0.18
109 0.15
110 0.14
111 0.15
112 0.13
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.14
123 0.2
124 0.23
125 0.28
126 0.3
127 0.3
128 0.31
129 0.36
130 0.37
131 0.36
132 0.3
133 0.27
134 0.31
135 0.32
136 0.35
137 0.35
138 0.38
139 0.39
140 0.38
141 0.37
142 0.32
143 0.31
144 0.27
145 0.2
146 0.14
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.19
179 0.25
180 0.29
181 0.31
182 0.36
183 0.36
184 0.38
185 0.41
186 0.42
187 0.41
188 0.4
189 0.42
190 0.43
191 0.49
192 0.48
193 0.45
194 0.42
195 0.36
196 0.31
197 0.25
198 0.2
199 0.14
200 0.14
201 0.11
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.14
211 0.17
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.19
219 0.17
220 0.15
221 0.15
222 0.21
223 0.21
224 0.23
225 0.23
226 0.23
227 0.24
228 0.27
229 0.26
230 0.2
231 0.2
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.17
254 0.2
255 0.22
256 0.25
257 0.25
258 0.24
259 0.25
260 0.26
261 0.25
262 0.26
263 0.27
264 0.28
265 0.3
266 0.3
267 0.3
268 0.31
269 0.31
270 0.27
271 0.24
272 0.2
273 0.2
274 0.2
275 0.18
276 0.16
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.18
282 0.2
283 0.26
284 0.3
285 0.33
286 0.43
287 0.48
288 0.53
289 0.6
290 0.65
291 0.69
292 0.74
293 0.77
294 0.77
295 0.72
296 0.65
297 0.57
298 0.5
299 0.42
300 0.33
301 0.3
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.21
307 0.26
308 0.27
309 0.24
310 0.27
311 0.34
312 0.39
313 0.43
314 0.45
315 0.46
316 0.47
317 0.55
318 0.55
319 0.46
320 0.42
321 0.38
322 0.33
323 0.31
324 0.27
325 0.25
326 0.23
327 0.22
328 0.24
329 0.26
330 0.28
331 0.26
332 0.25
333 0.23
334 0.26
335 0.28
336 0.25
337 0.26
338 0.28
339 0.35
340 0.37
341 0.37
342 0.36
343 0.41
344 0.47
345 0.53
346 0.6
347 0.62
348 0.7
349 0.75
350 0.82
351 0.85
352 0.88
353 0.87
354 0.85
355 0.81
356 0.74
357 0.7
358 0.61
359 0.56
360 0.48
361 0.41
362 0.33
363 0.27
364 0.24
365 0.18
366 0.16
367 0.1
368 0.09
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.11
392 0.14
393 0.2
394 0.19
395 0.2
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.2
400 0.22
401 0.19
402 0.25
403 0.27
404 0.35
405 0.36
406 0.39
407 0.42
408 0.45
409 0.51
410 0.53
411 0.56
412 0.54
413 0.54
414 0.51
415 0.45
416 0.39
417 0.3
418 0.23
419 0.19
420 0.12
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.14
425 0.14
426 0.16
427 0.15
428 0.15
429 0.12
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.12
442 0.11
443 0.14
444 0.18
445 0.19
446 0.21
447 0.27
448 0.31
449 0.32
450 0.4
451 0.42
452 0.4
453 0.4
454 0.42
455 0.37
456 0.33
457 0.28
458 0.21
459 0.17
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.14
464 0.16
465 0.18
466 0.17
467 0.18
468 0.16
469 0.16
470 0.15
471 0.15
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.13
482 0.15
483 0.16
484 0.16
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.18
489 0.15
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.14
494 0.14
495 0.12
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.2
501 0.23
502 0.28
503 0.29
504 0.37
505 0.46
506 0.53
507 0.6
508 0.59
509 0.6
510 0.55
511 0.55
512 0.52
513 0.42
514 0.39
515 0.31
516 0.26
517 0.21
518 0.2
519 0.18
520 0.14
521 0.13
522 0.1
523 0.09
524 0.1
525 0.09
526 0.09
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.16
531 0.17
532 0.16
533 0.19
534 0.19
535 0.18
536 0.22
537 0.22
538 0.18
539 0.19
540 0.24
541 0.24
542 0.27
543 0.29
544 0.29
545 0.3
546 0.32
547 0.3
548 0.26
549 0.26
550 0.23
551 0.25
552 0.24
553 0.24
554 0.22
555 0.21
556 0.21
557 0.18
558 0.17
559 0.12
560 0.1
561 0.08
562 0.09
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.06
574 0.06
575 0.07
576 0.09
577 0.09
578 0.12
579 0.12
580 0.13
581 0.11
582 0.12
583 0.11
584 0.09
585 0.08
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.04
596 0.05
597 0.07
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.07
611 0.1
612 0.11
613 0.1
614 0.11
615 0.13
616 0.14
617 0.19
618 0.25
619 0.27
620 0.29
621 0.29
622 0.29
623 0.26
624 0.25
625 0.21
626 0.14
627 0.08
628 0.06
629 0.07
630 0.08
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.09
637 0.09
638 0.11
639 0.17
640 0.2
641 0.23
642 0.27
643 0.28
644 0.29
645 0.34
646 0.38
647 0.38
648 0.42
649 0.39
650 0.39
651 0.43
652 0.43
653 0.44
654 0.45
655 0.45
656 0.46
657 0.5
658 0.49
659 0.45
660 0.46
661 0.42
662 0.35
663 0.28
664 0.25
665 0.26
666 0.27
667 0.27
668 0.28
669 0.29
670 0.27
671 0.28
672 0.27
673 0.24
674 0.24
675 0.26
676 0.26
677 0.25
678 0.25
679 0.22
680 0.2
681 0.18
682 0.15
683 0.12
684 0.08
685 0.09
686 0.08
687 0.07
688 0.07
689 0.06
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.05
694 0.05
695 0.06
696 0.09
697 0.11
698 0.15
699 0.19
700 0.19
701 0.21
702 0.25
703 0.26
704 0.25
705 0.24
706 0.22
707 0.22
708 0.23
709 0.23
710 0.19
711 0.16
712 0.16
713 0.19
714 0.17
715 0.14
716 0.15
717 0.15
718 0.19
719 0.2
720 0.2
721 0.17
722 0.16
723 0.15
724 0.14
725 0.14
726 0.1
727 0.12
728 0.11
729 0.13
730 0.17
731 0.19
732 0.22
733 0.31
734 0.34
735 0.38
736 0.44
737 0.53
738 0.59
739 0.63
740 0.66
741 0.63
742 0.64
743 0.6
744 0.62
745 0.59
746 0.56
747 0.6
748 0.62
749 0.59
750 0.57
751 0.57
752 0.55
753 0.47
754 0.43
755 0.35
756 0.28
757 0.27
758 0.25
759 0.26
760 0.2
761 0.19
762 0.17
763 0.19
764 0.15
765 0.14
766 0.16
767 0.18
768 0.22
769 0.21
770 0.21
771 0.19
772 0.2
773 0.21
774 0.18
775 0.13
776 0.09
777 0.1
778 0.17
779 0.18
780 0.17
781 0.17
782 0.18
783 0.2
784 0.25
785 0.3
786 0.27
787 0.26
788 0.29
789 0.33
790 0.39
791 0.43
792 0.4
793 0.38
794 0.38
795 0.43
796 0.43
797 0.39
798 0.33
799 0.28
800 0.26
801 0.25
802 0.23
803 0.16
804 0.13
805 0.13
806 0.17
807 0.19
808 0.2
809 0.18
810 0.16
811 0.16
812 0.16
813 0.15
814 0.11
815 0.08
816 0.06
817 0.06
818 0.06
819 0.05
820 0.05
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.04
827 0.05
828 0.05
829 0.04
830 0.05
831 0.05
832 0.06
833 0.06
834 0.08
835 0.09
836 0.1
837 0.1
838 0.11
839 0.12
840 0.13
841 0.16
842 0.18
843 0.22
844 0.26
845 0.27
846 0.3
847 0.33
848 0.35
849 0.37
850 0.4
851 0.42
852 0.45
853 0.51
854 0.52
855 0.58
856 0.65
857 0.69
858 0.69
859 0.69
860 0.68