Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J8Q7

Protein Details
Accession A0A4T0J8Q7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-271AEQSAKKEKKAGKKKSKPQQPNQQHHQQRHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-259KKEKKAGKKKSKP
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MMNSQLPQDIREILENSIAEQPPDPVPVSRQRQRSSSVSSSSSSSVSSSSSSSSSNNSDQEDAQDQWEVDSNPIVDDTVNQLEINDPDDPIPSNSQAVHTKNELIQHTIRPLPFEKFPESVELIKVGHLHSLIENTLVIQSSVSGKDKTLDQGTLLCLHDGKLLGEIFETFGSVDAPVHSVLIEDGAVDRNLVTHNDHVFYAPQHATIIDTRSLYQVKGSDASNLYDEELPDWQQEHSDDEAEQSAKKEKKAGKKKSKPQQPNQQHHQQRHADDFVDYTPRQRPVQLDYNAGDFNPEVALQQQPVQQSQTPAQMSNQYNPYQFMQMPFNPMVMAQQYAAMQAQLAAMTISTKFGVLTADAKLNTRNSNLNFREMLKPNSDVNYAEVVQRIIIKTDQQASIFLQQKLKSLERPQLDLLVDAVLNRALPLSTNRFGNFLIQRILDVEDISYKLRIVNAISGQIEGVAMNSYGTHVLQKLLATSPEHVKAGYIMNKNVAQGVTHKNASHVWSKALEIKWLIYTPHIMPTVNAAMKGRWVHCANTDTGSLIIQSILGKDGAGACFNEILDNITSCALNKWGSTVVQYLIERASESSLARVTTLLIYSYKQLSVDFYGARCLMACLTMGRKNEYAVELLSRLLLNDAETIFTIKVIVDSSIGVQFLVNILSLVGAVHRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.24
4 0.29
5 0.27
6 0.23
7 0.22
8 0.24
9 0.21
10 0.24
11 0.23
12 0.18
13 0.23
14 0.32
15 0.41
16 0.46
17 0.54
18 0.55
19 0.58
20 0.63
21 0.63
22 0.62
23 0.59
24 0.56
25 0.5
26 0.47
27 0.46
28 0.41
29 0.36
30 0.28
31 0.22
32 0.17
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.2
41 0.24
42 0.27
43 0.29
44 0.3
45 0.31
46 0.29
47 0.33
48 0.32
49 0.28
50 0.25
51 0.24
52 0.21
53 0.2
54 0.24
55 0.2
56 0.17
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.1
63 0.1
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.16
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.18
82 0.22
83 0.28
84 0.29
85 0.3
86 0.29
87 0.31
88 0.31
89 0.36
90 0.33
91 0.32
92 0.32
93 0.32
94 0.34
95 0.36
96 0.34
97 0.32
98 0.34
99 0.33
100 0.34
101 0.35
102 0.35
103 0.32
104 0.33
105 0.33
106 0.33
107 0.31
108 0.27
109 0.24
110 0.2
111 0.19
112 0.2
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.06
127 0.07
128 0.09
129 0.12
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.16
134 0.18
135 0.22
136 0.22
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.23
142 0.21
143 0.17
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.19
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.17
200 0.18
201 0.16
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.18
233 0.2
234 0.2
235 0.27
236 0.31
237 0.42
238 0.52
239 0.62
240 0.66
241 0.74
242 0.83
243 0.86
244 0.9
245 0.9
246 0.89
247 0.89
248 0.88
249 0.87
250 0.85
251 0.85
252 0.82
253 0.75
254 0.74
255 0.68
256 0.6
257 0.55
258 0.49
259 0.39
260 0.32
261 0.29
262 0.21
263 0.21
264 0.19
265 0.17
266 0.19
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.24
271 0.25
272 0.34
273 0.33
274 0.32
275 0.3
276 0.32
277 0.3
278 0.27
279 0.22
280 0.12
281 0.11
282 0.07
283 0.07
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.21
297 0.19
298 0.18
299 0.19
300 0.24
301 0.25
302 0.26
303 0.28
304 0.25
305 0.24
306 0.25
307 0.25
308 0.2
309 0.19
310 0.17
311 0.18
312 0.16
313 0.2
314 0.18
315 0.17
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.1
320 0.09
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.19
353 0.19
354 0.28
355 0.29
356 0.3
357 0.3
358 0.31
359 0.36
360 0.34
361 0.35
362 0.27
363 0.28
364 0.27
365 0.27
366 0.26
367 0.19
368 0.18
369 0.17
370 0.16
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.11
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.11
381 0.15
382 0.16
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.23
387 0.27
388 0.26
389 0.27
390 0.27
391 0.3
392 0.33
393 0.33
394 0.31
395 0.3
396 0.35
397 0.33
398 0.35
399 0.32
400 0.31
401 0.29
402 0.24
403 0.2
404 0.14
405 0.12
406 0.09
407 0.09
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.08
415 0.14
416 0.16
417 0.18
418 0.18
419 0.2
420 0.2
421 0.25
422 0.23
423 0.2
424 0.2
425 0.18
426 0.18
427 0.17
428 0.18
429 0.13
430 0.11
431 0.09
432 0.08
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.1
440 0.09
441 0.12
442 0.13
443 0.15
444 0.15
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.07
450 0.07
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.15
468 0.18
469 0.19
470 0.19
471 0.18
472 0.16
473 0.16
474 0.2
475 0.25
476 0.24
477 0.23
478 0.26
479 0.28
480 0.28
481 0.28
482 0.22
483 0.16
484 0.18
485 0.23
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.25
490 0.27
491 0.3
492 0.3
493 0.25
494 0.24
495 0.22
496 0.24
497 0.29
498 0.27
499 0.27
500 0.22
501 0.22
502 0.22
503 0.22
504 0.2
505 0.15
506 0.18
507 0.16
508 0.2
509 0.2
510 0.18
511 0.17
512 0.21
513 0.27
514 0.24
515 0.24
516 0.2
517 0.19
518 0.23
519 0.27
520 0.23
521 0.24
522 0.25
523 0.26
524 0.3
525 0.33
526 0.3
527 0.28
528 0.28
529 0.22
530 0.2
531 0.18
532 0.13
533 0.11
534 0.09
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.09
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.11
562 0.13
563 0.15
564 0.15
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.2
569 0.2
570 0.19
571 0.18
572 0.18
573 0.16
574 0.15
575 0.16
576 0.13
577 0.13
578 0.14
579 0.15
580 0.15
581 0.15
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.15
590 0.17
591 0.17
592 0.16
593 0.16
594 0.17
595 0.19
596 0.22
597 0.21
598 0.19
599 0.23
600 0.22
601 0.22
602 0.19
603 0.17
604 0.13
605 0.12
606 0.13
607 0.11
608 0.17
609 0.22
610 0.24
611 0.28
612 0.28
613 0.29
614 0.31
615 0.3
616 0.26
617 0.22
618 0.23
619 0.19
620 0.18
621 0.18
622 0.15
623 0.13
624 0.13
625 0.12
626 0.1
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.12
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.09
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.08
640 0.09
641 0.11
642 0.13
643 0.13
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.08
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06