Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JYK6

Protein Details
Accession A0A4T0JYK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-414AVEMRESQQKKRKGKHSARDDMDMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-404KRKGK
428-433KKKQKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044765  DDX47/Rrp3_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17954  DEADc_DDX47  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MACSFKDLNLIDDLIKNCQRLGYTSPTEIQQQSIPYSLQSRDIIGLAQTGSGKTAAFALPVIQLLYDTPSPYFCCVLAPTRELAYQISEQFDALGSSIGLRTATIVGGMDMMTQSIALSKKPHVIVATPGRLHDHLENTKGFSLRNIKFLIMDEADRLLDMDFGPIIDKLLKILPKSRTTMLFSATMTTKVAKLQRASLSNPVKVEVSDKYQTVSTLLQHYLFFPFKLKDSYLIYLANEVAGHSMIIFTRTVADAQRISIILRNLGFPAIPLHGQLSQSSRLGALNKFKAGGRNILVATDVASRGLDIPSVDYVVNYDTPSNSKDYIHRVGRTARAGRSGKAVTFVTQYDVELLQRIEKSTNVKMEEFPHDKQAIPLLVERVNEAARLAAVEMRESQQKKRKGKHSARDDMDMDDDVASLPKTTSQGKKKQKKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.29
4 0.27
5 0.28
6 0.27
7 0.26
8 0.3
9 0.31
10 0.32
11 0.35
12 0.37
13 0.36
14 0.41
15 0.38
16 0.35
17 0.29
18 0.27
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.21
23 0.24
24 0.23
25 0.25
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.2
31 0.16
32 0.17
33 0.12
34 0.13
35 0.12
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.09
41 0.11
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.15
58 0.17
59 0.18
60 0.14
61 0.15
62 0.16
63 0.22
64 0.24
65 0.24
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.24
70 0.22
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.12
80 0.09
81 0.08
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.12
106 0.14
107 0.19
108 0.2
109 0.22
110 0.2
111 0.21
112 0.27
113 0.32
114 0.36
115 0.31
116 0.31
117 0.32
118 0.31
119 0.32
120 0.28
121 0.27
122 0.24
123 0.27
124 0.28
125 0.27
126 0.29
127 0.27
128 0.24
129 0.22
130 0.28
131 0.26
132 0.3
133 0.29
134 0.27
135 0.27
136 0.28
137 0.27
138 0.19
139 0.17
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.09
158 0.12
159 0.12
160 0.19
161 0.24
162 0.27
163 0.3
164 0.31
165 0.31
166 0.33
167 0.34
168 0.29
169 0.25
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.17
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.13
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.22
182 0.26
183 0.28
184 0.3
185 0.35
186 0.36
187 0.34
188 0.33
189 0.29
190 0.25
191 0.22
192 0.22
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.16
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.16
270 0.18
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.28
277 0.27
278 0.29
279 0.23
280 0.24
281 0.24
282 0.22
283 0.22
284 0.17
285 0.16
286 0.13
287 0.11
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.11
307 0.13
308 0.16
309 0.15
310 0.16
311 0.2
312 0.26
313 0.34
314 0.38
315 0.38
316 0.39
317 0.42
318 0.46
319 0.5
320 0.48
321 0.42
322 0.45
323 0.45
324 0.42
325 0.44
326 0.4
327 0.33
328 0.32
329 0.31
330 0.23
331 0.24
332 0.23
333 0.2
334 0.18
335 0.18
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.16
344 0.15
345 0.18
346 0.23
347 0.27
348 0.32
349 0.32
350 0.33
351 0.34
352 0.38
353 0.44
354 0.44
355 0.4
356 0.41
357 0.39
358 0.38
359 0.36
360 0.37
361 0.3
362 0.26
363 0.27
364 0.23
365 0.24
366 0.24
367 0.24
368 0.21
369 0.19
370 0.18
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.12
380 0.14
381 0.23
382 0.25
383 0.34
384 0.41
385 0.51
386 0.59
387 0.67
388 0.74
389 0.77
390 0.86
391 0.87
392 0.89
393 0.9
394 0.85
395 0.82
396 0.73
397 0.65
398 0.56
399 0.47
400 0.36
401 0.26
402 0.21
403 0.14
404 0.14
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.11
409 0.14
410 0.22
411 0.31
412 0.4
413 0.5
414 0.61