Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JAG3

Protein Details
Accession A0A4T0JAG3    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MDKAGIIQLEKKRKRNQKRQDDHKEDHKEEHBasic
553-578QDDQEDEKPKKRRSNKTGEYNKQGVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-19KKRKRNQKR
562-565KKRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044773  DDX18/Has1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17942  DEADc_DDX18  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDKAGIIQLEKKRKRNQKRQDDHKEDHKEEHKEEHKEEDMEDMEDTSTTLPDLPPTSSDYQELSPEQFHFDSLDLTPGTRNAINDLGFKSMTQVQAKTIPPLMAGRDVLGAAHTGSGKTLAFLIPAIEMLSRLHFKPRNGTGAIVISPTRELALQIFGVAKEIMKNHNQTFGIIMGGANRKAEADKLQKGVNLIIATPGRLLDHLQNTKGFVFSNMKSLIIDEADRILEIGFEEEMRQIVKILPTENRQTMLFSATQTTKVTDLARVSLRQGPLYINVHEEKSAATNEQLEQGYVVCESDARFLLLFTFLKKNLKKKVIVFFSSCNSVKYHGELLNYIDIPVLDLHGKQKQQKRTNTFFEFCNAPTGILLCTDVAARGLDIPAVDWIIQFDPPDDPRDYIHRVGRTARAGKAGKSLLFLLPTELGFLRFLKTAKVPLNEYSFPKEKIANVQTQLEKLINKNYYLHQSAKDGYRSYLQSYASYSLKKIFDVNKLDLNKVAKAFGFSVPPKVNVSIGTNLKSSKESVGKKGKGMDRLDDSELAAIQDAQSDNPDQDDQEDEKPKKRRSNKTGEYNKQGVDKGAYRQKQHSKSGSQWSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.87
3 0.89
4 0.9
5 0.92
6 0.94
7 0.96
8 0.94
9 0.91
10 0.9
11 0.89
12 0.81
13 0.79
14 0.77
15 0.73
16 0.66
17 0.69
18 0.67
19 0.64
20 0.62
21 0.6
22 0.57
23 0.51
24 0.48
25 0.43
26 0.36
27 0.3
28 0.28
29 0.21
30 0.16
31 0.15
32 0.15
33 0.1
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.11
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.2
43 0.23
44 0.23
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.26
49 0.27
50 0.24
51 0.23
52 0.22
53 0.25
54 0.23
55 0.22
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.15
60 0.18
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.14
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.2
70 0.21
71 0.23
72 0.24
73 0.23
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.25
79 0.25
80 0.24
81 0.24
82 0.31
83 0.33
84 0.32
85 0.31
86 0.26
87 0.24
88 0.25
89 0.24
90 0.2
91 0.2
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.11
97 0.1
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.21
121 0.25
122 0.27
123 0.35
124 0.4
125 0.42
126 0.41
127 0.41
128 0.35
129 0.33
130 0.32
131 0.24
132 0.19
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.14
151 0.19
152 0.24
153 0.24
154 0.3
155 0.3
156 0.28
157 0.28
158 0.24
159 0.19
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.14
170 0.17
171 0.22
172 0.26
173 0.28
174 0.29
175 0.3
176 0.3
177 0.29
178 0.25
179 0.18
180 0.14
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.19
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.25
195 0.25
196 0.24
197 0.19
198 0.15
199 0.17
200 0.16
201 0.21
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.13
208 0.13
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.15
231 0.18
232 0.22
233 0.23
234 0.22
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.18
239 0.15
240 0.11
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.17
255 0.19
256 0.18
257 0.16
258 0.16
259 0.14
260 0.17
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.11
296 0.12
297 0.19
298 0.23
299 0.29
300 0.36
301 0.41
302 0.43
303 0.46
304 0.53
305 0.52
306 0.52
307 0.47
308 0.41
309 0.37
310 0.38
311 0.33
312 0.26
313 0.21
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.21
318 0.17
319 0.18
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.15
325 0.11
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.05
331 0.06
332 0.09
333 0.13
334 0.16
335 0.23
336 0.3
337 0.39
338 0.47
339 0.56
340 0.62
341 0.65
342 0.7
343 0.7
344 0.65
345 0.55
346 0.49
347 0.42
348 0.34
349 0.31
350 0.22
351 0.16
352 0.14
353 0.14
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.1
379 0.11
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.16
384 0.22
385 0.25
386 0.27
387 0.31
388 0.3
389 0.31
390 0.33
391 0.37
392 0.38
393 0.37
394 0.34
395 0.37
396 0.37
397 0.36
398 0.38
399 0.36
400 0.3
401 0.27
402 0.27
403 0.2
404 0.2
405 0.18
406 0.14
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.15
419 0.2
420 0.25
421 0.28
422 0.29
423 0.31
424 0.37
425 0.38
426 0.39
427 0.39
428 0.38
429 0.36
430 0.36
431 0.34
432 0.29
433 0.35
434 0.37
435 0.36
436 0.35
437 0.39
438 0.39
439 0.37
440 0.38
441 0.31
442 0.28
443 0.24
444 0.29
445 0.25
446 0.25
447 0.27
448 0.29
449 0.33
450 0.35
451 0.36
452 0.3
453 0.32
454 0.34
455 0.37
456 0.37
457 0.32
458 0.3
459 0.32
460 0.32
461 0.31
462 0.32
463 0.28
464 0.25
465 0.27
466 0.29
467 0.26
468 0.26
469 0.24
470 0.26
471 0.26
472 0.25
473 0.28
474 0.29
475 0.35
476 0.4
477 0.42
478 0.43
479 0.44
480 0.45
481 0.43
482 0.4
483 0.36
484 0.3
485 0.29
486 0.21
487 0.22
488 0.23
489 0.21
490 0.25
491 0.23
492 0.3
493 0.31
494 0.32
495 0.32
496 0.31
497 0.3
498 0.25
499 0.28
500 0.27
501 0.29
502 0.29
503 0.29
504 0.29
505 0.29
506 0.29
507 0.27
508 0.26
509 0.31
510 0.33
511 0.41
512 0.51
513 0.52
514 0.54
515 0.61
516 0.6
517 0.59
518 0.58
519 0.55
520 0.51
521 0.52
522 0.52
523 0.44
524 0.39
525 0.32
526 0.29
527 0.22
528 0.16
529 0.11
530 0.08
531 0.11
532 0.11
533 0.1
534 0.12
535 0.13
536 0.13
537 0.16
538 0.17
539 0.14
540 0.15
541 0.19
542 0.21
543 0.27
544 0.37
545 0.38
546 0.46
547 0.55
548 0.62
549 0.68
550 0.74
551 0.78
552 0.79
553 0.86
554 0.88
555 0.9
556 0.92
557 0.91
558 0.89
559 0.83
560 0.76
561 0.7
562 0.61
563 0.53
564 0.48
565 0.42
566 0.43
567 0.48
568 0.5
569 0.51
570 0.59
571 0.67
572 0.68
573 0.74
574 0.73
575 0.71
576 0.73