Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IQ48

Protein Details
Accession A0A4T0IQ48    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-140VQPPRSNKKSSSKSKAQQPSNKQQNQRKSSKSKNSNPHQSNQRKSSNRRNQKNLDKNPKDKAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-110RKSSKSK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 2, mito 1, E.R. 1, golg 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MTSNGNVWESRQAIASPASQQDLLVKDEISWPSASDANDKREEEREEKKDNKKDDSITSTRRGKKNWVSVPVEQVLPVQPPRSNKKSSSKSKAQQPSNKQQNQRKSSKSKNSNPHQSNQRKSSNRRNQKNLDKNPKDKAFPPVVPPMPSSFQMFGAPNSQAGHTYAPMPMPTPVTTTNYPLDPLRFYLLGQLEYYFTTQNLVRDFFLRQQMDSDGWVDIPVFTTFNRVKALSVDVYLLRDVFAMSQLVEVFFFAGNQEPSQKEEGVLQKESLDMSQVQKEIDFIASNTNPAGKVRLAHGVWKKWVLPNAQKSNVDVESLPQDDNAQFDDSATPVEASNHNEQVAAMSAQFESADSQPAQSNEPTNQSSHQNASSNSIDGGSSDAIKESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.21
4 0.22
5 0.24
6 0.22
7 0.22
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.23
15 0.24
16 0.21
17 0.19
18 0.17
19 0.18
20 0.22
21 0.22
22 0.25
23 0.3
24 0.34
25 0.4
26 0.4
27 0.41
28 0.44
29 0.49
30 0.47
31 0.51
32 0.52
33 0.55
34 0.63
35 0.7
36 0.72
37 0.72
38 0.73
39 0.7
40 0.67
41 0.65
42 0.65
43 0.63
44 0.61
45 0.63
46 0.65
47 0.67
48 0.68
49 0.64
50 0.66
51 0.67
52 0.71
53 0.7
54 0.7
55 0.67
56 0.64
57 0.67
58 0.59
59 0.5
60 0.4
61 0.33
62 0.26
63 0.24
64 0.23
65 0.19
66 0.2
67 0.27
68 0.35
69 0.4
70 0.44
71 0.48
72 0.56
73 0.64
74 0.72
75 0.74
76 0.76
77 0.77
78 0.82
79 0.84
80 0.83
81 0.82
82 0.81
83 0.83
84 0.84
85 0.83
86 0.82
87 0.81
88 0.82
89 0.82
90 0.81
91 0.79
92 0.77
93 0.81
94 0.82
95 0.84
96 0.83
97 0.84
98 0.86
99 0.87
100 0.82
101 0.8
102 0.8
103 0.79
104 0.78
105 0.75
106 0.75
107 0.73
108 0.76
109 0.79
110 0.8
111 0.81
112 0.82
113 0.83
114 0.83
115 0.85
116 0.88
117 0.88
118 0.88
119 0.86
120 0.82
121 0.82
122 0.77
123 0.69
124 0.6
125 0.57
126 0.52
127 0.45
128 0.44
129 0.43
130 0.41
131 0.39
132 0.37
133 0.33
134 0.29
135 0.28
136 0.26
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.12
161 0.16
162 0.17
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.19
167 0.17
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.14
192 0.16
193 0.22
194 0.2
195 0.19
196 0.19
197 0.2
198 0.19
199 0.18
200 0.16
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.16
217 0.19
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.11
246 0.14
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.19
251 0.25
252 0.26
253 0.27
254 0.24
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.17
259 0.13
260 0.1
261 0.12
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.11
270 0.08
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.17
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.21
283 0.2
284 0.28
285 0.34
286 0.36
287 0.39
288 0.4
289 0.41
290 0.37
291 0.42
292 0.42
293 0.44
294 0.5
295 0.56
296 0.59
297 0.57
298 0.55
299 0.55
300 0.48
301 0.4
302 0.3
303 0.24
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.16
308 0.17
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.14
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.12
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.09
321 0.12
322 0.14
323 0.18
324 0.23
325 0.24
326 0.24
327 0.23
328 0.23
329 0.21
330 0.21
331 0.17
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.14
341 0.13
342 0.15
343 0.18
344 0.2
345 0.23
346 0.23
347 0.26
348 0.25
349 0.31
350 0.31
351 0.3
352 0.32
353 0.34
354 0.36
355 0.37
356 0.39
357 0.38
358 0.37
359 0.4
360 0.39
361 0.35
362 0.31
363 0.27
364 0.21
365 0.16
366 0.18
367 0.14
368 0.12
369 0.11