Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J297

Protein Details
Accession A0A4T0J297    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-389SQPPLTRKQKLAKEKEEKNGKKPELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-385KLAKEKEEKNGK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MDQDEFKIAQNNSDDSDENDSAEDEVPDYRQLASFTNRKSKETYIPRRGEKEFEPSGLKIQQKALDESRDAMFNAIDGVRQSSNKNISIGLWSNAHSRASIIIQRGTHFSSIGHPVRNTPSKREGNVEKVASETRMELLPEEALYMVERGSLLCYEYEWSDNNDKMLKLSTNDSAVDERVAGLAPFSAQRAFDCCIGKDGLTLEKYTVYAQLKRLGYIVKRAQQQQIKPGEQPGLLGRIYNTLKGIVNTIFSPIASFVRLFNVRVTTLLGSRSSFLRPHQNYDSIFKALRLTPWGYNDTPEVSTRLSEEQQHEFDVTWDIWRPSSKFRKSAPPPPDFRIVVVDTHKSSLPSLEQFAHIFSHQPYSQPPLTRKQKLAKEKEEKNGKKPELAVSEISWFSRWWNRKQLAADESNRKKSPAVMFPALKHGKRAVVFAIVDSGTTSWIQFGEGQFGEFPLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.25
3 0.33
4 0.28
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.15
19 0.18
20 0.24
21 0.3
22 0.36
23 0.45
24 0.47
25 0.48
26 0.51
27 0.53
28 0.56
29 0.6
30 0.64
31 0.64
32 0.71
33 0.75
34 0.77
35 0.74
36 0.69
37 0.61
38 0.59
39 0.51
40 0.46
41 0.43
42 0.37
43 0.4
44 0.41
45 0.4
46 0.34
47 0.36
48 0.37
49 0.36
50 0.41
51 0.4
52 0.38
53 0.36
54 0.36
55 0.33
56 0.29
57 0.26
58 0.21
59 0.16
60 0.12
61 0.13
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.12
66 0.13
67 0.15
68 0.17
69 0.22
70 0.27
71 0.28
72 0.29
73 0.26
74 0.25
75 0.29
76 0.3
77 0.25
78 0.21
79 0.2
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.18
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.2
88 0.2
89 0.22
90 0.22
91 0.24
92 0.26
93 0.26
94 0.23
95 0.19
96 0.17
97 0.17
98 0.24
99 0.27
100 0.27
101 0.25
102 0.28
103 0.35
104 0.43
105 0.42
106 0.4
107 0.46
108 0.49
109 0.5
110 0.54
111 0.52
112 0.51
113 0.55
114 0.5
115 0.4
116 0.36
117 0.36
118 0.29
119 0.24
120 0.18
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.14
147 0.17
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.16
155 0.14
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.1
178 0.11
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.15
195 0.14
196 0.16
197 0.18
198 0.24
199 0.24
200 0.24
201 0.24
202 0.22
203 0.21
204 0.26
205 0.29
206 0.27
207 0.31
208 0.34
209 0.4
210 0.42
211 0.43
212 0.43
213 0.45
214 0.42
215 0.38
216 0.37
217 0.32
218 0.27
219 0.26
220 0.19
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.15
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.24
264 0.25
265 0.31
266 0.34
267 0.37
268 0.37
269 0.39
270 0.39
271 0.3
272 0.29
273 0.23
274 0.22
275 0.19
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.22
281 0.25
282 0.23
283 0.23
284 0.23
285 0.22
286 0.2
287 0.19
288 0.17
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.16
293 0.15
294 0.19
295 0.21
296 0.24
297 0.24
298 0.25
299 0.24
300 0.21
301 0.2
302 0.18
303 0.15
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.17
309 0.18
310 0.25
311 0.35
312 0.4
313 0.44
314 0.48
315 0.57
316 0.62
317 0.69
318 0.69
319 0.67
320 0.66
321 0.64
322 0.67
323 0.56
324 0.5
325 0.45
326 0.37
327 0.33
328 0.31
329 0.3
330 0.24
331 0.25
332 0.25
333 0.21
334 0.2
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.19
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.2
343 0.19
344 0.16
345 0.16
346 0.14
347 0.19
348 0.18
349 0.19
350 0.2
351 0.26
352 0.3
353 0.34
354 0.37
355 0.41
356 0.51
357 0.56
358 0.62
359 0.64
360 0.69
361 0.73
362 0.79
363 0.8
364 0.8
365 0.81
366 0.83
367 0.85
368 0.82
369 0.8
370 0.8
371 0.72
372 0.66
373 0.61
374 0.59
375 0.53
376 0.5
377 0.43
378 0.34
379 0.36
380 0.32
381 0.31
382 0.24
383 0.19
384 0.2
385 0.27
386 0.32
387 0.35
388 0.45
389 0.47
390 0.52
391 0.57
392 0.61
393 0.59
394 0.61
395 0.62
396 0.62
397 0.68
398 0.7
399 0.66
400 0.6
401 0.53
402 0.52
403 0.52
404 0.5
405 0.5
406 0.49
407 0.52
408 0.52
409 0.62
410 0.62
411 0.55
412 0.5
413 0.45
414 0.43
415 0.41
416 0.42
417 0.34
418 0.32
419 0.32
420 0.28
421 0.29
422 0.22
423 0.21
424 0.19
425 0.16
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.13
433 0.13
434 0.18
435 0.18
436 0.19
437 0.19