Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JEN2

Protein Details
Accession A0A4T0JEN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-468AAETKGKKERKKSIKRKPLPKDNDKHKDNBasic
585-608GGGSGSGKKKKKKKGKGGGAGGAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-473PAAETKGKKERKKSIKRKPLPKDNDKHKDNDKGKK
590-610SGKKKKKKKGKGGGAGGAGGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.166, cyto 10.5, nucl 9.5, cyto_mito 8.999, mito_nucl 8.499, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000717  PCI_dom  
IPR040780  Rpn6_C_helix  
IPR040773  Rpn6_N  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000502  C:proteasome complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PF18503  RPN6_C_helix  
PF18055  RPN6_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSSTAKAKTAKLIRTLIDFFDQIENSRQAQLNCLVDNITWAKSEKRVFLRQSLEIRLAGLYYESKEYKAALDLLDGLLKELKKLDDKIILTQVHNLESKIYYSTANYVKSKAALTSARTAGNAIYCPPILQAQLDLQSGILHANDRDWKTAFSYFFETLEAFSSQDDDRAVSALKYMLLCKIMLNLSDDVDSIIQNKMSQRYAGANVEAMKAVAQAHKKRSLTDFEKALKDYKQELSADPIIKSHLSSLYDTLLESNLLKIIEPYSRVEIDYMASLLSQPVNAIEGKLSQMILDKVFYGIIDQGNNCLIVFDPPHQDHLYDATLKTLGNVGQVVNGLFEKTASLQSWILNGVYENNKCCVDIVCNQLTMVIGLGLSLHSLPRRRFGPRDPSGNDGNLGAPKSSPAASVSPLLFFPETENADANSNGPPALASPPPPAPPAAETKGKKERKKSIKRKPLPKDNDKHKDNDKGKKANQEKLEAEHEGENKGTVAFINAPTLVAEDFYSEDGHGSPMSVPMANADDEPIIEDLFHEIERDSRLLKAEHDKENDKRDYKEVDAEKEDETPAIPDTSASEAETSNTSNAGGGSGSGKKKKKKKGKGGGAGGAGGGEKSADKPTDEAAPKSEENVEDKPTEDKPAQDKSPLPPTPDAPPAPPKDEIEMKDNAPPTEAGESAEQSLPIPPVDIKIDGPAEIKIDPPIDGPAEIKIEPPESDKQGQDNPAMNPPKAPTTAVSSSFGDMDSTAPPLSTPPTSPPASRPGTPPPATTPNMQNMPPAHSQYDPQTMFEDGRPSLLSVAFHAIAFNKDSLAIPPHPGNDVLMNSTINMVDRDVGLLPQTERTGFTGEVSEMAKQLIAASNELRKAWHGSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.45
4 0.4
5 0.35
6 0.29
7 0.3
8 0.28
9 0.24
10 0.28
11 0.29
12 0.27
13 0.32
14 0.34
15 0.29
16 0.33
17 0.37
18 0.35
19 0.32
20 0.31
21 0.27
22 0.23
23 0.27
24 0.25
25 0.2
26 0.18
27 0.19
28 0.22
29 0.28
30 0.33
31 0.36
32 0.41
33 0.49
34 0.52
35 0.58
36 0.61
37 0.61
38 0.63
39 0.59
40 0.54
41 0.46
42 0.42
43 0.34
44 0.28
45 0.21
46 0.16
47 0.13
48 0.12
49 0.17
50 0.17
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.19
69 0.23
70 0.26
71 0.3
72 0.33
73 0.35
74 0.39
75 0.44
76 0.43
77 0.39
78 0.42
79 0.39
80 0.35
81 0.34
82 0.29
83 0.24
84 0.22
85 0.23
86 0.19
87 0.18
88 0.15
89 0.15
90 0.21
91 0.24
92 0.29
93 0.29
94 0.29
95 0.3
96 0.31
97 0.31
98 0.25
99 0.26
100 0.24
101 0.26
102 0.31
103 0.32
104 0.31
105 0.3
106 0.3
107 0.25
108 0.24
109 0.21
110 0.16
111 0.16
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.11
131 0.18
132 0.2
133 0.23
134 0.24
135 0.24
136 0.26
137 0.32
138 0.29
139 0.25
140 0.29
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.23
145 0.18
146 0.19
147 0.16
148 0.11
149 0.1
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.15
169 0.14
170 0.15
171 0.17
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.11
183 0.14
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.21
189 0.25
190 0.25
191 0.22
192 0.21
193 0.21
194 0.21
195 0.19
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.13
201 0.19
202 0.25
203 0.31
204 0.38
205 0.39
206 0.41
207 0.44
208 0.49
209 0.47
210 0.46
211 0.47
212 0.45
213 0.48
214 0.46
215 0.45
216 0.38
217 0.36
218 0.34
219 0.3
220 0.3
221 0.28
222 0.27
223 0.3
224 0.33
225 0.32
226 0.28
227 0.25
228 0.23
229 0.21
230 0.21
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.16
255 0.16
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.1
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.15
300 0.15
301 0.19
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.2
306 0.2
307 0.16
308 0.15
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.11
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.08
329 0.07
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.09
337 0.08
338 0.1
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.15
347 0.14
348 0.17
349 0.21
350 0.2
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.19
355 0.15
356 0.11
357 0.05
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.06
366 0.11
367 0.12
368 0.16
369 0.19
370 0.23
371 0.27
372 0.34
373 0.42
374 0.43
375 0.5
376 0.48
377 0.49
378 0.47
379 0.43
380 0.37
381 0.26
382 0.22
383 0.16
384 0.14
385 0.1
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.11
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.14
424 0.12
425 0.14
426 0.17
427 0.18
428 0.24
429 0.24
430 0.3
431 0.4
432 0.47
433 0.5
434 0.53
435 0.6
436 0.64
437 0.74
438 0.79
439 0.8
440 0.83
441 0.88
442 0.9
443 0.9
444 0.9
445 0.88
446 0.87
447 0.85
448 0.85
449 0.85
450 0.77
451 0.72
452 0.67
453 0.68
454 0.65
455 0.65
456 0.63
457 0.61
458 0.62
459 0.67
460 0.67
461 0.64
462 0.59
463 0.56
464 0.49
465 0.44
466 0.44
467 0.34
468 0.3
469 0.26
470 0.24
471 0.19
472 0.17
473 0.14
474 0.11
475 0.1
476 0.08
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.08
512 0.07
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.07
522 0.09
523 0.1
524 0.09
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.15
529 0.23
530 0.27
531 0.32
532 0.36
533 0.41
534 0.43
535 0.51
536 0.54
537 0.48
538 0.44
539 0.42
540 0.42
541 0.38
542 0.41
543 0.36
544 0.34
545 0.34
546 0.33
547 0.3
548 0.27
549 0.26
550 0.18
551 0.15
552 0.12
553 0.1
554 0.08
555 0.08
556 0.06
557 0.08
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.1
566 0.09
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.06
573 0.05
574 0.07
575 0.12
576 0.17
577 0.24
578 0.3
579 0.39
580 0.48
581 0.58
582 0.67
583 0.73
584 0.8
585 0.84
586 0.88
587 0.9
588 0.87
589 0.82
590 0.71
591 0.6
592 0.49
593 0.38
594 0.27
595 0.16
596 0.09
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.08
601 0.08
602 0.09
603 0.1
604 0.12
605 0.2
606 0.22
607 0.22
608 0.22
609 0.25
610 0.25
611 0.26
612 0.27
613 0.2
614 0.22
615 0.24
616 0.24
617 0.2
618 0.21
619 0.23
620 0.22
621 0.24
622 0.21
623 0.23
624 0.26
625 0.32
626 0.33
627 0.34
628 0.36
629 0.37
630 0.46
631 0.44
632 0.42
633 0.38
634 0.39
635 0.39
636 0.42
637 0.39
638 0.33
639 0.38
640 0.38
641 0.39
642 0.4
643 0.36
644 0.34
645 0.39
646 0.37
647 0.34
648 0.33
649 0.3
650 0.32
651 0.33
652 0.28
653 0.24
654 0.21
655 0.19
656 0.18
657 0.18
658 0.15
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.16
663 0.14
664 0.12
665 0.13
666 0.13
667 0.11
668 0.11
669 0.09
670 0.11
671 0.13
672 0.14
673 0.12
674 0.15
675 0.16
676 0.15
677 0.16
678 0.15
679 0.14
680 0.13
681 0.14
682 0.12
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.13
687 0.12
688 0.13
689 0.13
690 0.13
691 0.15
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.16
697 0.2
698 0.23
699 0.25
700 0.29
701 0.29
702 0.32
703 0.35
704 0.38
705 0.38
706 0.38
707 0.35
708 0.4
709 0.43
710 0.38
711 0.35
712 0.34
713 0.34
714 0.31
715 0.3
716 0.22
717 0.26
718 0.3
719 0.31
720 0.32
721 0.29
722 0.28
723 0.27
724 0.26
725 0.18
726 0.14
727 0.13
728 0.1
729 0.11
730 0.1
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.13
735 0.14
736 0.15
737 0.18
738 0.24
739 0.27
740 0.28
741 0.31
742 0.36
743 0.38
744 0.39
745 0.39
746 0.42
747 0.49
748 0.49
749 0.48
750 0.47
751 0.5
752 0.5
753 0.49
754 0.46
755 0.44
756 0.46
757 0.44
758 0.42
759 0.37
760 0.4
761 0.4
762 0.38
763 0.32
764 0.3
765 0.32
766 0.33
767 0.4
768 0.35
769 0.32
770 0.31
771 0.3
772 0.31
773 0.3
774 0.29
775 0.2
776 0.21
777 0.2
778 0.19
779 0.19
780 0.19
781 0.17
782 0.14
783 0.19
784 0.17
785 0.16
786 0.17
787 0.16
788 0.16
789 0.18
790 0.17
791 0.12
792 0.13
793 0.14
794 0.16
795 0.2
796 0.2
797 0.22
798 0.25
799 0.26
800 0.27
801 0.27
802 0.25
803 0.24
804 0.23
805 0.21
806 0.2
807 0.19
808 0.17
809 0.18
810 0.16
811 0.14
812 0.13
813 0.11
814 0.1
815 0.1
816 0.12
817 0.11
818 0.11
819 0.11
820 0.13
821 0.14
822 0.16
823 0.18
824 0.17
825 0.18
826 0.2
827 0.22
828 0.2
829 0.2
830 0.19
831 0.18
832 0.2
833 0.19
834 0.18
835 0.15
836 0.15
837 0.14
838 0.11
839 0.12
840 0.15
841 0.15
842 0.17
843 0.2
844 0.26
845 0.28
846 0.29
847 0.28
848 0.25