Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JCA6

Protein Details
Accession A0A4T0JCA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-318STPQPKQPKGTRRSSRRSSRRIQYDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
301-309KGTRRSSRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MDDQLQYFEQLNSFQVANPRCHSCSKAFVNEGDLRAHLREECTETMPIAEIDYLRSASNDIAVSQNLWYGDQNSNANERQQNTFSVHAEPSHHLLNDVHDIKENGSEEDAAYDEDGVGDDSMSALPPAMRPTVAPIFQDQTLGFRMIESPDTQIKGENMMARRSNFPAYDESKYNTAEEAMAHALSQVPDQADPRPFKCPNPECSKTWKNRNGLKYHINHGNCNGVLKTLSRDEAAVSERPYACPVPGCNKRWKNANGFRYHMDHSGAHGRSARRLHEASGGFAGKSNLQSVSTPQPKQPKGTRRSSRRSSRRIQYDEDEEAADDDDVEEEDDYGDEEDDDDDDDDVEEEDDAYGYPDDNVPFDVPEPSTSALPHPNQDQIHFPPSMQHHGSEISNAKSFPTIDRGYANDNGDGKSFEVNPVNPLPSFEPTPDHGPVNQLPSFEQTSHQGSVIHDQSQLDSLDFSAVDEASIMNSKQPEESVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.23
3 0.26
4 0.3
5 0.34
6 0.38
7 0.39
8 0.42
9 0.45
10 0.42
11 0.47
12 0.49
13 0.52
14 0.5
15 0.48
16 0.52
17 0.52
18 0.49
19 0.41
20 0.35
21 0.29
22 0.27
23 0.27
24 0.22
25 0.19
26 0.21
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.19
35 0.15
36 0.13
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.15
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.16
58 0.2
59 0.22
60 0.22
61 0.27
62 0.27
63 0.32
64 0.33
65 0.33
66 0.34
67 0.34
68 0.34
69 0.33
70 0.35
71 0.31
72 0.3
73 0.28
74 0.25
75 0.27
76 0.26
77 0.26
78 0.25
79 0.23
80 0.21
81 0.21
82 0.22
83 0.27
84 0.27
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.23
89 0.27
90 0.25
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.05
113 0.06
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.15
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.22
125 0.24
126 0.18
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.14
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.17
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.18
144 0.2
145 0.19
146 0.22
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.28
151 0.29
152 0.24
153 0.24
154 0.26
155 0.27
156 0.29
157 0.28
158 0.27
159 0.27
160 0.27
161 0.26
162 0.2
163 0.16
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.12
179 0.17
180 0.19
181 0.21
182 0.27
183 0.28
184 0.3
185 0.4
186 0.41
187 0.44
188 0.5
189 0.53
190 0.48
191 0.56
192 0.62
193 0.6
194 0.65
195 0.64
196 0.63
197 0.66
198 0.7
199 0.66
200 0.62
201 0.62
202 0.55
203 0.53
204 0.52
205 0.47
206 0.4
207 0.38
208 0.35
209 0.27
210 0.25
211 0.2
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.17
229 0.15
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.19
234 0.26
235 0.3
236 0.38
237 0.42
238 0.44
239 0.51
240 0.55
241 0.56
242 0.57
243 0.62
244 0.56
245 0.55
246 0.54
247 0.5
248 0.46
249 0.37
250 0.31
251 0.23
252 0.21
253 0.26
254 0.24
255 0.22
256 0.24
257 0.23
258 0.26
259 0.28
260 0.27
261 0.25
262 0.25
263 0.25
264 0.28
265 0.28
266 0.24
267 0.24
268 0.23
269 0.18
270 0.18
271 0.17
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.21
280 0.26
281 0.27
282 0.3
283 0.39
284 0.4
285 0.47
286 0.52
287 0.53
288 0.54
289 0.64
290 0.69
291 0.7
292 0.78
293 0.81
294 0.83
295 0.83
296 0.84
297 0.83
298 0.82
299 0.82
300 0.77
301 0.72
302 0.66
303 0.61
304 0.55
305 0.47
306 0.37
307 0.27
308 0.23
309 0.19
310 0.14
311 0.08
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.16
359 0.21
360 0.22
361 0.24
362 0.24
363 0.29
364 0.29
365 0.3
366 0.33
367 0.31
368 0.33
369 0.31
370 0.28
371 0.28
372 0.31
373 0.36
374 0.32
375 0.28
376 0.26
377 0.28
378 0.28
379 0.28
380 0.27
381 0.23
382 0.24
383 0.23
384 0.22
385 0.22
386 0.22
387 0.19
388 0.23
389 0.21
390 0.21
391 0.23
392 0.25
393 0.28
394 0.32
395 0.31
396 0.28
397 0.29
398 0.28
399 0.26
400 0.25
401 0.21
402 0.19
403 0.18
404 0.18
405 0.21
406 0.21
407 0.24
408 0.27
409 0.28
410 0.25
411 0.27
412 0.26
413 0.25
414 0.27
415 0.24
416 0.25
417 0.26
418 0.32
419 0.31
420 0.3
421 0.27
422 0.31
423 0.33
424 0.35
425 0.33
426 0.28
427 0.27
428 0.29
429 0.32
430 0.27
431 0.26
432 0.24
433 0.28
434 0.28
435 0.28
436 0.25
437 0.24
438 0.31
439 0.32
440 0.29
441 0.26
442 0.25
443 0.25
444 0.26
445 0.25
446 0.18
447 0.15
448 0.14
449 0.13
450 0.12
451 0.12
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.11
459 0.11
460 0.13
461 0.15
462 0.16
463 0.18