Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0HKU0

Protein Details
Accession A0A4T0HKU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-425VFHSAKKRTKMPPKKNQQPEQKIRLGHydrophilic
646-672RLVNLSKRDYCRKKNKWLGKVKQWVDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-415KKRTKMPPKKN
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.833, cyto 6.5, pero 6, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004396  ATPase_YchF/OLA1  
IPR012675  Beta-grasp_dom_sf  
IPR019417  DUF2415  
IPR031167  G_OBG  
IPR006073  GTP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR004095  TGS  
IPR012676  TGS-like  
IPR023192  TGS-like_dom_sf  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013029  YchF_C  
IPR041706  YchF_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10313  DUF2415  
PF01926  MMR_HSR1  
PF06071  YchF-GTPase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51710  G_OBG  
PS51880  TGS  
CDD cd04867  TGS_YchF_OLA1  
cd01900  YchF  
Amino Acid Sequences MTVAELVNPDPRYCFPARVSIKHPQLRDLIQTADNSSVYYPHNRSIIKHYLDAPGKPKVKSQLGYSPVTLSTGSGLLASAGSSGEITLQSLDQENRCVLSVKRLRVNAAINNHIAFAPESTSSVEPRLLVCNNDNLVRIFRVGIRTEQPELDLVTTLKFNTAVNQASISPNARICVAVGDTNEVHLFDCGNSGTFRRVKTLTSATDGGFSTAWSADGLKFAVSSQDGLCTVWDIRSIKFTSNAASKELMVFTESTNSIHVVDAMTFSPVSQQTLDLPSAASLSTPPFLSPRSESPLNDEESINSPEFFSTFFPSSNTNSRSLRQIFNNSYGATLNRLSPNHLPGEQRYCSEVQVAGIAFSMDGSRLYAASENGVMDYEINGANTKLFEGGEFISFSTTLVFHSAKKRTKMPPKKNQQPEQKIRLGRPGNNLKMGIVGLPNVGKSSLFNIMTSCDLGKAANFPYATIEPEESKVIVPDERFDWLADHYKPASRVPAFLSVIDIAGLTAGASTGAGLGNAFLSHVRAVDGIFQVVRCFDDADVIHVEGDVDPIRDMEIIQYELRLKDQEWLEKAVDYQKRTARSANHTTLSGKAEHDKLQTIIKALETVAGNEESGVEGMDIRKQIWSAKEVDVINGLNLLTAKPIIRLVNLSKRDYCRKKNKWLGKVKQWVDEKNPGDLIIPFSVALEEELMQLSDQDKEKELKSLEEEYKLPVTQCLGKITTAGYQSLELIRYFTCGEKEVRAWTIASGTKAPQAAGLIHSDFEKNFICGDIMTYDDIKEHKTENAVKGAGKMRQQGKPYVMKDGDIVYWKSNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.29
3 0.39
4 0.45
5 0.48
6 0.53
7 0.56
8 0.63
9 0.64
10 0.63
11 0.58
12 0.57
13 0.55
14 0.54
15 0.47
16 0.41
17 0.38
18 0.38
19 0.34
20 0.31
21 0.28
22 0.23
23 0.2
24 0.19
25 0.19
26 0.26
27 0.27
28 0.28
29 0.35
30 0.35
31 0.38
32 0.43
33 0.5
34 0.46
35 0.46
36 0.45
37 0.48
38 0.51
39 0.52
40 0.48
41 0.49
42 0.5
43 0.47
44 0.5
45 0.49
46 0.53
47 0.51
48 0.53
49 0.53
50 0.53
51 0.55
52 0.51
53 0.44
54 0.36
55 0.34
56 0.28
57 0.19
58 0.15
59 0.12
60 0.11
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.12
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.2
84 0.21
85 0.18
86 0.25
87 0.31
88 0.36
89 0.42
90 0.43
91 0.45
92 0.48
93 0.53
94 0.49
95 0.48
96 0.45
97 0.4
98 0.38
99 0.36
100 0.31
101 0.26
102 0.2
103 0.15
104 0.12
105 0.1
106 0.11
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.16
114 0.2
115 0.19
116 0.21
117 0.22
118 0.26
119 0.27
120 0.28
121 0.28
122 0.24
123 0.25
124 0.23
125 0.22
126 0.17
127 0.18
128 0.21
129 0.21
130 0.24
131 0.26
132 0.29
133 0.3
134 0.29
135 0.27
136 0.24
137 0.23
138 0.2
139 0.17
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.22
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.15
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.16
181 0.19
182 0.2
183 0.23
184 0.24
185 0.24
186 0.29
187 0.34
188 0.3
189 0.32
190 0.33
191 0.28
192 0.3
193 0.29
194 0.24
195 0.18
196 0.15
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.09
209 0.08
210 0.1
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.19
223 0.2
224 0.2
225 0.22
226 0.22
227 0.22
228 0.26
229 0.27
230 0.24
231 0.23
232 0.22
233 0.2
234 0.2
235 0.16
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.15
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.12
276 0.15
277 0.17
278 0.23
279 0.26
280 0.25
281 0.31
282 0.33
283 0.33
284 0.32
285 0.28
286 0.23
287 0.24
288 0.26
289 0.2
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.16
301 0.19
302 0.25
303 0.26
304 0.27
305 0.27
306 0.28
307 0.34
308 0.35
309 0.36
310 0.33
311 0.38
312 0.36
313 0.39
314 0.4
315 0.32
316 0.3
317 0.26
318 0.23
319 0.17
320 0.15
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.18
325 0.19
326 0.22
327 0.21
328 0.23
329 0.22
330 0.22
331 0.28
332 0.25
333 0.24
334 0.24
335 0.22
336 0.2
337 0.2
338 0.17
339 0.1
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.08
388 0.1
389 0.17
390 0.24
391 0.29
392 0.32
393 0.38
394 0.44
395 0.55
396 0.63
397 0.68
398 0.7
399 0.77
400 0.84
401 0.87
402 0.87
403 0.87
404 0.86
405 0.84
406 0.81
407 0.77
408 0.7
409 0.61
410 0.61
411 0.54
412 0.47
413 0.48
414 0.49
415 0.44
416 0.43
417 0.42
418 0.33
419 0.3
420 0.26
421 0.18
422 0.1
423 0.08
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.13
438 0.13
439 0.11
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.11
447 0.1
448 0.1
449 0.13
450 0.14
451 0.14
452 0.13
453 0.13
454 0.11
455 0.12
456 0.13
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.17
471 0.16
472 0.17
473 0.17
474 0.18
475 0.19
476 0.19
477 0.24
478 0.19
479 0.2
480 0.2
481 0.26
482 0.24
483 0.23
484 0.23
485 0.17
486 0.16
487 0.15
488 0.12
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.03
493 0.02
494 0.02
495 0.02
496 0.02
497 0.02
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.04
506 0.03
507 0.04
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.1
525 0.1
526 0.13
527 0.14
528 0.13
529 0.13
530 0.12
531 0.12
532 0.08
533 0.1
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.1
546 0.12
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.16
552 0.19
553 0.23
554 0.24
555 0.27
556 0.26
557 0.26
558 0.27
559 0.29
560 0.3
561 0.27
562 0.31
563 0.32
564 0.35
565 0.37
566 0.41
567 0.39
568 0.43
569 0.5
570 0.49
571 0.46
572 0.44
573 0.43
574 0.41
575 0.37
576 0.3
577 0.23
578 0.21
579 0.23
580 0.25
581 0.25
582 0.24
583 0.23
584 0.25
585 0.24
586 0.22
587 0.2
588 0.17
589 0.16
590 0.14
591 0.16
592 0.13
593 0.12
594 0.13
595 0.12
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.04
603 0.05
604 0.06
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.1
609 0.11
610 0.15
611 0.16
612 0.19
613 0.2
614 0.22
615 0.27
616 0.26
617 0.26
618 0.25
619 0.22
620 0.19
621 0.16
622 0.14
623 0.09
624 0.09
625 0.08
626 0.07
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.11
631 0.12
632 0.12
633 0.17
634 0.22
635 0.31
636 0.36
637 0.39
638 0.42
639 0.47
640 0.57
641 0.63
642 0.67
643 0.69
644 0.73
645 0.8
646 0.84
647 0.88
648 0.88
649 0.9
650 0.89
651 0.88
652 0.89
653 0.82
654 0.79
655 0.76
656 0.71
657 0.67
658 0.66
659 0.58
660 0.51
661 0.48
662 0.4
663 0.35
664 0.3
665 0.27
666 0.18
667 0.17
668 0.13
669 0.12
670 0.12
671 0.11
672 0.1
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.12
682 0.13
683 0.14
684 0.17
685 0.2
686 0.21
687 0.27
688 0.27
689 0.27
690 0.29
691 0.35
692 0.36
693 0.36
694 0.36
695 0.34
696 0.36
697 0.33
698 0.29
699 0.23
700 0.23
701 0.25
702 0.26
703 0.27
704 0.25
705 0.24
706 0.25
707 0.25
708 0.26
709 0.22
710 0.2
711 0.17
712 0.16
713 0.17
714 0.19
715 0.19
716 0.14
717 0.14
718 0.13
719 0.15
720 0.15
721 0.16
722 0.16
723 0.17
724 0.2
725 0.22
726 0.25
727 0.27
728 0.28
729 0.27
730 0.26
731 0.23
732 0.26
733 0.25
734 0.25
735 0.23
736 0.22
737 0.25
738 0.25
739 0.24
740 0.21
741 0.19
742 0.18
743 0.17
744 0.2
745 0.16
746 0.16
747 0.17
748 0.18
749 0.16
750 0.18
751 0.18
752 0.15
753 0.14
754 0.15
755 0.14
756 0.12
757 0.15
758 0.12
759 0.12
760 0.14
761 0.14
762 0.13
763 0.15
764 0.16
765 0.16
766 0.18
767 0.18
768 0.19
769 0.26
770 0.33
771 0.36
772 0.41
773 0.41
774 0.4
775 0.44
776 0.48
777 0.45
778 0.43
779 0.47
780 0.48
781 0.52
782 0.56
783 0.57
784 0.58
785 0.63
786 0.59
787 0.61
788 0.54
789 0.48
790 0.46
791 0.41
792 0.37
793 0.33
794 0.34