Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0EXC8

Protein Details
Accession A0A4T0EXC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-281NLSIPKRRNRRLKLSIRSGNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MSISLENEGYHGDKDLVDIPESGEPIYDEPLDGDTQFARTLHRIWQEKGDFSQVSSKSLLQDQLNELNDVDKQSEPEDDTRNDESLSVDDVLKLKHSVLTNLDDAKNELAVALDVVNLLLSNTPRHENTEIQLPIPKHSLGTAAINASELTPLQALKKSKIAITTKNESLQSAANIFDRASEQTEQTNAQNAQFWDDCLLLRDRNWTLIPSNAKSESTTDLEKAAKDLKVLYSVDEGTASNEIKHDSIASLDIKISQSNDFNLSIPKRRNRRLKLSIRSGNHIETSSAFRSNVEMRNTSDNVNERIDSLLRTLDYAQSSSFEEDLFASLLNEANQIPIVITSSAEMIVIELDTSSQLVLELVNGDDYIEEGEEISSKCDGLLLGVKLLQIRSYKNISAKNNQVLKPILDLLHYEAFTESIKGLLGRITDLLCYVEVKEASYHVQKTYTREVLDIFLNNNKPQTIGSQGRISFGKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.2
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.21
8 0.22
9 0.19
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.16
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.13
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.13
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.25
29 0.33
30 0.37
31 0.38
32 0.47
33 0.48
34 0.49
35 0.49
36 0.48
37 0.4
38 0.36
39 0.42
40 0.33
41 0.32
42 0.31
43 0.3
44 0.25
45 0.29
46 0.32
47 0.25
48 0.28
49 0.29
50 0.34
51 0.34
52 0.32
53 0.29
54 0.25
55 0.25
56 0.22
57 0.2
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.17
62 0.19
63 0.22
64 0.26
65 0.26
66 0.3
67 0.32
68 0.31
69 0.29
70 0.26
71 0.23
72 0.18
73 0.19
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.13
82 0.15
83 0.16
84 0.18
85 0.2
86 0.23
87 0.25
88 0.29
89 0.29
90 0.25
91 0.26
92 0.23
93 0.2
94 0.16
95 0.12
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.08
109 0.1
110 0.13
111 0.14
112 0.19
113 0.22
114 0.22
115 0.23
116 0.31
117 0.29
118 0.27
119 0.31
120 0.27
121 0.27
122 0.27
123 0.26
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.14
128 0.15
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.1
135 0.09
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.13
142 0.14
143 0.16
144 0.2
145 0.21
146 0.22
147 0.29
148 0.32
149 0.35
150 0.4
151 0.44
152 0.42
153 0.44
154 0.43
155 0.36
156 0.33
157 0.26
158 0.21
159 0.16
160 0.14
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.19
175 0.17
176 0.16
177 0.19
178 0.18
179 0.2
180 0.19
181 0.18
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.14
187 0.11
188 0.11
189 0.15
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.19
196 0.23
197 0.19
198 0.22
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.21
203 0.19
204 0.17
205 0.17
206 0.14
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.11
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.16
250 0.18
251 0.23
252 0.28
253 0.35
254 0.41
255 0.49
256 0.59
257 0.62
258 0.69
259 0.74
260 0.78
261 0.79
262 0.81
263 0.8
264 0.72
265 0.69
266 0.61
267 0.52
268 0.43
269 0.35
270 0.25
271 0.19
272 0.21
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.16
278 0.21
279 0.25
280 0.23
281 0.23
282 0.24
283 0.29
284 0.31
285 0.29
286 0.28
287 0.26
288 0.26
289 0.25
290 0.23
291 0.18
292 0.18
293 0.18
294 0.15
295 0.13
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.07
360 0.07
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.13
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.18
376 0.16
377 0.18
378 0.22
379 0.26
380 0.3
381 0.35
382 0.43
383 0.45
384 0.51
385 0.56
386 0.6
387 0.63
388 0.61
389 0.59
390 0.54
391 0.49
392 0.44
393 0.38
394 0.3
395 0.22
396 0.22
397 0.22
398 0.24
399 0.22
400 0.2
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.12
406 0.08
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.11
419 0.12
420 0.11
421 0.15
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.16
426 0.21
427 0.26
428 0.28
429 0.25
430 0.31
431 0.33
432 0.38
433 0.46
434 0.46
435 0.4
436 0.39
437 0.39
438 0.36
439 0.36
440 0.32
441 0.26
442 0.28
443 0.31
444 0.32
445 0.33
446 0.31
447 0.28
448 0.26
449 0.27
450 0.29
451 0.31
452 0.34
453 0.39
454 0.39
455 0.42