Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J6E0

Protein Details
Accession A0A4T0J6E0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-52VRTGDYLRYRKHCTRKINKLRRNLKLTNGKGKRHydrophilic
462-485LDKSQSKDTKPSKKEAQKPPTGHVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026258  SRP68  
IPR038253  SRP68_N_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0030942  F:endoplasmic reticulum signal peptide binding  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF16969  SRP68  
Amino Acid Sequences MSLVFQTLNLLNVERNSYGVRTGDYLRYRKHCTRKINKLRRNLKLTNGKGKRFNKCTAESILRQSDIRVLELLLLSADKYWAESQENKDATSKLRRSDQFANVLIEASSKFGLHSSDTVQLEIYHKFIQGSYNLSKNKFHDALNLLSISYVYLKNLINAAPNDKIRALGEGWLDELSPKIRYCSYQSGNKSTSHEIDRIANEHSSSHSFVQLEYSQEDKPTKVKNLTWRGKELRLTSVDVVEAIHKLQSVIDKKSGKSTQSLSNYDEILNTYTNAIEISPQGLLKQVLTYKMLALRLERDLKINNQLESNEPAKNRSKVKVIDGIIFTLEQLRNLHIVESDDSDLSGYVETKISYHQALKNYTLGLSHLMAHSYGPSIRLLESCKFYNRSGLELLMSLDESTLNHSEAFEPVVDIALIEDLNKMVDTALVNSKKAWFAQQFKRPLFFDIANTYVEPPLDYILDKSQSKDTKPSKKEAQKPPTGHVISSEDSKQTQDSAEKNANKTASSGWFGSLWKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.2
6 0.2
7 0.2
8 0.19
9 0.23
10 0.29
11 0.36
12 0.41
13 0.46
14 0.52
15 0.59
16 0.65
17 0.72
18 0.73
19 0.76
20 0.8
21 0.84
22 0.89
23 0.91
24 0.9
25 0.9
26 0.92
27 0.9
28 0.89
29 0.82
30 0.81
31 0.8
32 0.8
33 0.8
34 0.78
35 0.75
36 0.76
37 0.8
38 0.8
39 0.76
40 0.76
41 0.73
42 0.69
43 0.67
44 0.65
45 0.64
46 0.58
47 0.59
48 0.55
49 0.49
50 0.44
51 0.4
52 0.37
53 0.31
54 0.28
55 0.21
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.06
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.16
70 0.22
71 0.26
72 0.35
73 0.36
74 0.35
75 0.37
76 0.36
77 0.38
78 0.42
79 0.41
80 0.37
81 0.45
82 0.47
83 0.51
84 0.58
85 0.58
86 0.55
87 0.53
88 0.51
89 0.42
90 0.4
91 0.33
92 0.25
93 0.19
94 0.14
95 0.11
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.19
104 0.2
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.2
118 0.21
119 0.27
120 0.3
121 0.32
122 0.36
123 0.35
124 0.41
125 0.38
126 0.35
127 0.34
128 0.34
129 0.34
130 0.32
131 0.3
132 0.22
133 0.2
134 0.19
135 0.13
136 0.11
137 0.09
138 0.07
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.16
146 0.19
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.2
151 0.21
152 0.17
153 0.18
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.09
162 0.1
163 0.08
164 0.1
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.19
170 0.28
171 0.31
172 0.37
173 0.41
174 0.46
175 0.47
176 0.47
177 0.46
178 0.39
179 0.38
180 0.33
181 0.3
182 0.25
183 0.27
184 0.25
185 0.23
186 0.22
187 0.19
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.14
203 0.17
204 0.18
205 0.15
206 0.18
207 0.21
208 0.24
209 0.26
210 0.29
211 0.37
212 0.46
213 0.53
214 0.52
215 0.55
216 0.54
217 0.54
218 0.54
219 0.46
220 0.4
221 0.35
222 0.34
223 0.27
224 0.24
225 0.2
226 0.16
227 0.14
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.11
236 0.14
237 0.16
238 0.22
239 0.24
240 0.24
241 0.31
242 0.33
243 0.29
244 0.28
245 0.29
246 0.31
247 0.34
248 0.36
249 0.31
250 0.3
251 0.3
252 0.27
253 0.24
254 0.17
255 0.13
256 0.11
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.17
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.21
289 0.29
290 0.29
291 0.26
292 0.24
293 0.24
294 0.24
295 0.26
296 0.27
297 0.21
298 0.19
299 0.23
300 0.27
301 0.31
302 0.33
303 0.32
304 0.37
305 0.36
306 0.4
307 0.43
308 0.39
309 0.38
310 0.35
311 0.32
312 0.26
313 0.23
314 0.19
315 0.16
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.12
342 0.16
343 0.19
344 0.24
345 0.26
346 0.28
347 0.28
348 0.27
349 0.25
350 0.21
351 0.18
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.12
367 0.15
368 0.17
369 0.21
370 0.22
371 0.27
372 0.29
373 0.29
374 0.35
375 0.32
376 0.31
377 0.29
378 0.27
379 0.23
380 0.2
381 0.2
382 0.13
383 0.12
384 0.09
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.07
413 0.07
414 0.1
415 0.19
416 0.2
417 0.21
418 0.22
419 0.25
420 0.25
421 0.25
422 0.3
423 0.29
424 0.36
425 0.46
426 0.53
427 0.6
428 0.61
429 0.66
430 0.59
431 0.55
432 0.51
433 0.43
434 0.38
435 0.34
436 0.33
437 0.29
438 0.28
439 0.26
440 0.22
441 0.21
442 0.17
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.12
448 0.16
449 0.22
450 0.23
451 0.25
452 0.32
453 0.36
454 0.39
455 0.47
456 0.52
457 0.57
458 0.61
459 0.68
460 0.7
461 0.75
462 0.82
463 0.83
464 0.83
465 0.82
466 0.81
467 0.77
468 0.76
469 0.68
470 0.58
471 0.51
472 0.46
473 0.38
474 0.38
475 0.36
476 0.28
477 0.28
478 0.29
479 0.26
480 0.22
481 0.24
482 0.26
483 0.26
484 0.31
485 0.4
486 0.44
487 0.46
488 0.5
489 0.48
490 0.42
491 0.41
492 0.38
493 0.34
494 0.32
495 0.3
496 0.26
497 0.27