Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IMN8

Protein Details
Accession A0A4T0IMN8    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-40KKEVKQTSTAPPKKEKKEKKSKSASKKEPTPPPKPVSSHydrophilic
50-79SDSDDDKKKSKKASPPKKSSKAAKKSSSSDHydrophilic
89-115DEKPVKNDSKKDSKKEAKKPAPAPAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-36APPKKEKKEKKSKSASKKEPTPPPK
56-74KKKSKKASPPKKSSKAAKK
97-115SKKDSKKEAKKPAPAPAKK
432-464RSAGPPRGGGPRGGGRGGRGGRGGAPRGGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKEVKQTSTAPPKKEKKEKKSKSASKKEPTPPPKPVSSSDSSSSSDSSDSDDDKKKSKKASPPKKSSKAAKKSSSSDDSDDSSDSEDEKPVKNDSKKDSKKEAKKPAPAPAKKDESSDSSDSSSSDDEPAQKSAPAESSKKDDSSSSDSSDSSDEDEKMADAKAPPKKAAKDDSSDSSDSDSSDDDKDAKVTEKPAPAKKDDSSSSSDSSSDEEEKAEPAPAPEATEAPSKKRKAEDMEVPETITVDNTPQIFVGQLSWNIDDEWLKSEFEQLGTVKSARVQLDRQNGRSRGFGYVEFESHDIALKAMEQFAGKEIDGRPIRVDLSVPRAPNPEKRAKSFGDQRSDPSNTLFVGNLSFNTNEDSVWEFFGEFGAIESVRVPTDRETGAPKGFGYVSFADVDTAKAAIDGAAGSELDGRVLRLDFSTPKDRSAGPPRGGGPRGGGRGGRGGRGGAPRGGGRGGFNANRSGAIAQPQGKKMTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.85
4 0.85
5 0.85
6 0.89
7 0.93
8 0.93
9 0.94
10 0.94
11 0.95
12 0.95
13 0.94
14 0.93
15 0.93
16 0.91
17 0.91
18 0.89
19 0.87
20 0.85
21 0.81
22 0.77
23 0.71
24 0.67
25 0.63
26 0.6
27 0.56
28 0.5
29 0.48
30 0.43
31 0.4
32 0.36
33 0.3
34 0.25
35 0.2
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.25
40 0.32
41 0.34
42 0.42
43 0.49
44 0.5
45 0.56
46 0.62
47 0.66
48 0.7
49 0.78
50 0.8
51 0.85
52 0.9
53 0.91
54 0.91
55 0.91
56 0.9
57 0.89
58 0.88
59 0.86
60 0.82
61 0.78
62 0.78
63 0.73
64 0.66
65 0.59
66 0.52
67 0.46
68 0.4
69 0.35
70 0.27
71 0.23
72 0.2
73 0.18
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.21
78 0.22
79 0.26
80 0.34
81 0.39
82 0.45
83 0.49
84 0.58
85 0.63
86 0.69
87 0.74
88 0.76
89 0.8
90 0.83
91 0.86
92 0.84
93 0.85
94 0.83
95 0.82
96 0.82
97 0.77
98 0.73
99 0.71
100 0.69
101 0.6
102 0.58
103 0.51
104 0.45
105 0.46
106 0.42
107 0.35
108 0.29
109 0.28
110 0.25
111 0.24
112 0.2
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.17
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.2
124 0.22
125 0.22
126 0.23
127 0.28
128 0.3
129 0.3
130 0.29
131 0.26
132 0.26
133 0.31
134 0.31
135 0.28
136 0.27
137 0.26
138 0.26
139 0.26
140 0.21
141 0.17
142 0.16
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.16
152 0.22
153 0.24
154 0.27
155 0.32
156 0.36
157 0.39
158 0.45
159 0.42
160 0.41
161 0.43
162 0.44
163 0.43
164 0.4
165 0.34
166 0.29
167 0.25
168 0.2
169 0.18
170 0.14
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.14
181 0.18
182 0.23
183 0.29
184 0.35
185 0.38
186 0.39
187 0.41
188 0.39
189 0.4
190 0.36
191 0.33
192 0.32
193 0.31
194 0.3
195 0.26
196 0.25
197 0.2
198 0.2
199 0.18
200 0.15
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.15
216 0.15
217 0.19
218 0.26
219 0.27
220 0.29
221 0.31
222 0.34
223 0.34
224 0.39
225 0.42
226 0.42
227 0.44
228 0.41
229 0.39
230 0.34
231 0.28
232 0.23
233 0.15
234 0.08
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.13
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.1
266 0.11
267 0.15
268 0.14
269 0.17
270 0.18
271 0.23
272 0.33
273 0.37
274 0.4
275 0.44
276 0.45
277 0.44
278 0.43
279 0.38
280 0.31
281 0.29
282 0.25
283 0.21
284 0.2
285 0.19
286 0.18
287 0.17
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.11
304 0.12
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.21
309 0.2
310 0.21
311 0.18
312 0.19
313 0.13
314 0.19
315 0.22
316 0.22
317 0.23
318 0.28
319 0.3
320 0.36
321 0.41
322 0.44
323 0.44
324 0.48
325 0.52
326 0.5
327 0.55
328 0.58
329 0.58
330 0.56
331 0.53
332 0.52
333 0.53
334 0.53
335 0.45
336 0.37
337 0.31
338 0.23
339 0.23
340 0.2
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.13
356 0.11
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.14
372 0.15
373 0.16
374 0.2
375 0.24
376 0.26
377 0.25
378 0.23
379 0.22
380 0.21
381 0.2
382 0.19
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.11
391 0.1
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.13
412 0.16
413 0.22
414 0.31
415 0.3
416 0.32
417 0.34
418 0.36
419 0.41
420 0.47
421 0.5
422 0.44
423 0.48
424 0.5
425 0.55
426 0.54
427 0.47
428 0.43
429 0.4
430 0.41
431 0.38
432 0.36
433 0.3
434 0.37
435 0.37
436 0.34
437 0.28
438 0.26
439 0.29
440 0.34
441 0.35
442 0.28
443 0.3
444 0.28
445 0.29
446 0.3
447 0.25
448 0.21
449 0.22
450 0.27
451 0.27
452 0.28
453 0.3
454 0.29
455 0.29
456 0.28
457 0.25
458 0.21
459 0.23
460 0.27
461 0.31
462 0.37
463 0.41
464 0.44