FuNGI

A0A4T0J6A3

Protein Details

Accession

A0A4T0J6A3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
285-311	VTPKISRTNKFKRPKPARKFVRSNSSY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
288-303	KISRTNKFKRPKPARK

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto_nucl 7.5, cyto 7, nucl 6, golg 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010920 LSM_dom_sf IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM
CDD	cd01717 Sm_B

Amino Acid Sequences

MPPPKPKNSRMLTLINYRLRVTLNDTRQIIGQMLAFDRHMNLVLVDSIEFRRLKGPSNQGDIPKEMKRALGLIVLRGETIISISVEGPPPVKDEEPISAGPGLGAPAGRGMPLGAGMGAAPPAFQARPMPYAGGPPPPGFPGPAPGFRPPPGFLGAPSMPGFPTPPPGKQDDIHNIVTDSVQGILTDDGIPASQLPDIISNLARDGHLSNFITKETLENVKHFASTDRLNATYVSLDGLLSLIDSLLVSSPKQDSLLDEEPLDEISFIQNMGDSPVTKDKAKDGVTPKISRTNKFKRPKPARKFVRSNSSYTDTSDYYSSDNDNDFALHSPTSSPPQTPNIDNKENLSGFDGLMLSNAPSNNALSNDALIHTQNQIKDLEKRNADLEKRLKEAERSYTQTTSQNEDYISIMEDQLKENDAKLEALVRDEKDLRAKDRQNMFTINKLEHDIATYQRQAESARIQASSLQSQLGDVNDEIDSLRDSLRDKDRDVREARSGADKYEHEMGKWENERKGYDDALQRIKTHLDVARKSERVLEVQKTENLGLKETIDRLRGDLSHQLAYNGSGSGGADETGGQLGSVSRNLGKELARQLTEDGEHDNQNPTNARTRHELGEGEIETIVTTRRRKVKPSVEVAVGVGSKEGGTAEHHGLEEAQADAEPAIESPPPYSQGQAGFEYVDDVRKVCSRGVQVSVNSRGVDTQTEVDSQAEINDGSKRADNEKETKGKTIWSKLYAIFKISSRKPNVIPIYSTIVFLCGMIGGAWILPSTTSSVESLRTVSGVDERAMFVAYNTFEGATWLLNTDNRLVHFIQSVVWSGVDTSQLFPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.63
3	0.59
4	0.53
5	0.49
6	0.42
7	0.38
8	0.38
9	0.38
10	0.39
11	0.45
12	0.45
13	0.44
14	0.43
15	0.43
16	0.35
17	0.27
18	0.22
19	0.17
20	0.17
21	0.18
22	0.17
23	0.16
24	0.16
25	0.16
26	0.15
27	0.13
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.11
33	0.12
34	0.12
35	0.18
36	0.18
37	0.17
38	0.22
39	0.23
40	0.29
41	0.35
42	0.44
43	0.45
44	0.53
45	0.57
46	0.57
47	0.6
48	0.58
49	0.55
50	0.5
51	0.46
52	0.4
53	0.36
54	0.31
55	0.29
56	0.26
57	0.26
58	0.22
59	0.22
60	0.23
61	0.22
62	0.2
63	0.18
64	0.17
65	0.11
66	0.11
67	0.09
68	0.06
69	0.07
70	0.08
71	0.11
72	0.12
73	0.13
74	0.14
75	0.13
76	0.15
77	0.18
78	0.18
79	0.17
80	0.18
81	0.21
82	0.24
83	0.23
84	0.23
85	0.2
86	0.19
87	0.17
88	0.15
89	0.12
90	0.09
91	0.08
92	0.06
93	0.07
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.05
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.04
108	0.05
109	0.07
110	0.07
111	0.08
112	0.12
113	0.15
114	0.18
115	0.19
116	0.21
117	0.19
118	0.25
119	0.26
120	0.28
121	0.27
122	0.26
123	0.26
124	0.27
125	0.27
126	0.23
127	0.21
128	0.23
129	0.25
130	0.29
131	0.32
132	0.34
133	0.37
134	0.38
135	0.41
136	0.34
137	0.32
138	0.31
139	0.27
140	0.23
141	0.27
142	0.24
143	0.24
144	0.23
145	0.21
146	0.18
147	0.18
148	0.19
149	0.12
150	0.21
151	0.21
152	0.24
153	0.27
154	0.31
155	0.34
156	0.34
157	0.41
158	0.41
159	0.43
160	0.41
161	0.38
162	0.34
163	0.31
164	0.29
165	0.22
166	0.14
167	0.09
168	0.07
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.08
184	0.08
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.11
194	0.15
195	0.16
196	0.17
197	0.17
198	0.18
199	0.17
200	0.15
201	0.15
202	0.14
203	0.2
204	0.2
205	0.2
206	0.23
207	0.23
208	0.23
209	0.22
210	0.21
211	0.18
212	0.18
213	0.21
214	0.21
215	0.21
216	0.21
217	0.21
218	0.2
219	0.16
220	0.14
221	0.11
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.05
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.17
243	0.2
244	0.2
245	0.19
246	0.19
247	0.18
248	0.18
249	0.16
250	0.09
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.1
262	0.16
263	0.18
264	0.19
265	0.2
266	0.21
267	0.27
268	0.29
269	0.33
270	0.32
271	0.39
272	0.44
273	0.46
274	0.45
275	0.48
276	0.5
277	0.48
278	0.53
279	0.54
280	0.58
281	0.66
282	0.7
283	0.72
284	0.79
285	0.85
286	0.85
287	0.86
288	0.86
289	0.87
290	0.89
291	0.84
292	0.84
293	0.75
294	0.69
295	0.63
296	0.58
297	0.49
298	0.41
299	0.37
300	0.27
301	0.25
302	0.23
303	0.18
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.11
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.14
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.21
324	0.23
325	0.25
326	0.32
327	0.35
328	0.37
329	0.36
330	0.35
331	0.35
332	0.32
333	0.3
334	0.24
335	0.18
336	0.14
337	0.15
338	0.13
339	0.08
340	0.08
341	0.07
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.09
359	0.11
360	0.11
361	0.12
362	0.13
363	0.14
364	0.21
365	0.26
366	0.3
367	0.28
368	0.29
369	0.31
370	0.35
371	0.34
372	0.34
373	0.35
374	0.32
375	0.34
376	0.34
377	0.32
378	0.3
379	0.32
380	0.31
381	0.29
382	0.3
383	0.31
384	0.31
385	0.32
386	0.33
387	0.32
388	0.3
389	0.26
390	0.23
391	0.2
392	0.2
393	0.18
394	0.13
395	0.12
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.09
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.14
417	0.18
418	0.19
419	0.21
420	0.27
421	0.3
422	0.36
423	0.42
424	0.44
425	0.41
426	0.45
427	0.42
428	0.4
429	0.39
430	0.32
431	0.25
432	0.24
433	0.22
434	0.17
435	0.17
436	0.12
437	0.12
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.16
451	0.18
452	0.16
453	0.15
454	0.12
455	0.1
456	0.11
457	0.11
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.08
471	0.13
472	0.21
473	0.23
474	0.24
475	0.32
476	0.35
477	0.41
478	0.43
479	0.41
480	0.38
481	0.37
482	0.36
483	0.34
484	0.32
485	0.25
486	0.26
487	0.23
488	0.22
489	0.27
490	0.26
491	0.19
492	0.22
493	0.21
494	0.24
495	0.3
496	0.31
497	0.27
498	0.3
499	0.31
500	0.31
501	0.33
502	0.27
503	0.27
504	0.28
505	0.3
506	0.34
507	0.34
508	0.32
509	0.3
510	0.3
511	0.25
512	0.24
513	0.24
514	0.24
515	0.25
516	0.31
517	0.37
518	0.37
519	0.37
520	0.37
521	0.34
522	0.32
523	0.34
524	0.32
525	0.28
526	0.3
527	0.31
528	0.29
529	0.28
530	0.27
531	0.23
532	0.2
533	0.17
534	0.16
535	0.16
536	0.17
537	0.19
538	0.17
539	0.17
540	0.16
541	0.17
542	0.17
543	0.18
544	0.2
545	0.2
546	0.2
547	0.2
548	0.2
549	0.18
550	0.18
551	0.17
552	0.11
553	0.09
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.08
571	0.09
572	0.1
573	0.13
574	0.13
575	0.17
576	0.23
577	0.26
578	0.25
579	0.25
580	0.25
581	0.24
582	0.24
583	0.2
584	0.18
585	0.16
586	0.17
587	0.18
588	0.2
589	0.19
590	0.21
591	0.23
592	0.21
593	0.28
594	0.28
595	0.29
596	0.32
597	0.35
598	0.34
599	0.35
600	0.33
601	0.26
602	0.3
603	0.28
604	0.23
605	0.19
606	0.17
607	0.14
608	0.13
609	0.14
610	0.13
611	0.15
612	0.21
613	0.31
614	0.35
615	0.41
616	0.51
617	0.59
618	0.63
619	0.67
620	0.66
621	0.58
622	0.55
623	0.49
624	0.41
625	0.31
626	0.22
627	0.14
628	0.1
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.05
633	0.07
634	0.11
635	0.12
636	0.14
637	0.14
638	0.14
639	0.14
640	0.13
641	0.12
642	0.09
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.06
651	0.07
652	0.07
653	0.08
654	0.1
655	0.13
656	0.14
657	0.15
658	0.16
659	0.19
660	0.22
661	0.22
662	0.21
663	0.18
664	0.17
665	0.18
666	0.16
667	0.16
668	0.13
669	0.12
670	0.13
671	0.16
672	0.18
673	0.17
674	0.22
675	0.23
676	0.27
677	0.31
678	0.34
679	0.34
680	0.4
681	0.44
682	0.42
683	0.37
684	0.33
685	0.3
686	0.26
687	0.24
688	0.19
689	0.16
690	0.15
691	0.16
692	0.17
693	0.16
694	0.15
695	0.13
696	0.11
697	0.1
698	0.09
699	0.09
700	0.12
701	0.13
702	0.14
703	0.17
704	0.19
705	0.23
706	0.29
707	0.34
708	0.38
709	0.45
710	0.52
711	0.52
712	0.54
713	0.5
714	0.51
715	0.52
716	0.54
717	0.52
718	0.47
719	0.48
720	0.48
721	0.55
722	0.5
723	0.46
724	0.39
725	0.37
726	0.43
727	0.46
728	0.5
729	0.48
730	0.52
731	0.51
732	0.58
733	0.61
734	0.56
735	0.52
736	0.46
737	0.48
738	0.43
739	0.41
740	0.31
741	0.25
742	0.21
743	0.19
744	0.15
745	0.07
746	0.07
747	0.06
748	0.06
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.05
756	0.07
757	0.08
758	0.1
759	0.11
760	0.13
761	0.15
762	0.16
763	0.17
764	0.15
765	0.14
766	0.13
767	0.13
768	0.16
769	0.16
770	0.16
771	0.16
772	0.16
773	0.17
774	0.17
775	0.15
776	0.11
777	0.14
778	0.13
779	0.13
780	0.13
781	0.13
782	0.12
783	0.13
784	0.14
785	0.11
786	0.1
787	0.1
788	0.11
789	0.13
790	0.15
791	0.18
792	0.2
793	0.2
794	0.24
795	0.24
796	0.24
797	0.24
798	0.23
799	0.21
800	0.2
801	0.21
802	0.18
803	0.17
804	0.15
805	0.14
806	0.15
807	0.16
808	0.15

A0A4T0J6A3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer