Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IJV1

Protein Details
Accession A0A4T0IJV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-114PSGWGQRKQKPESSKKGKKSSGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-110RKQKPESSKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, cyto 7.5, cyto_mito 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036241  NSFL1C_SEP_dom_sf  
IPR012989  SEP_domain  
IPR009060  UBA-like_sf  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR001012  UBX_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF08059  SEP  
PF14555  UBA_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51399  SEP  
PS50033  UBX  
CDD cd14348  UBA_p47  
Amino Acid Sequences MSSPCEHTFKPNTHLTTKTAIDQIIGITGTDQQTAEQLLEATNGDAQSALDLFYADDFSAAAQPQPMAESRDTQRQHSGPTTLGGAPAEPLPSGWGQRKQKPESSKKGKKSSGIATLKDVNNDDDSDDEEDPGKREKLYAGGERSGLSVQGPSKGGPRGPNDIVGDIMKKAADSNEEASETLTKSNKEQPNAFSGRGNRLGSEEEPVDSNQGNSFETDDDWEEVDDEEPVNRNLTFWRDGFSIDDGSLMRYDEHQETLDALNSGRAPLSLLNIRFGQRVNLGVSQRTDEDYVAPPKVFKPFEGASGQRLGAPVTASIRQPERASASAPTSIAEKVKVDESKPTTRVQVRLNDGSRTVVRLNTDHTIDNLRQEIER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.51
3 0.49
4 0.46
5 0.44
6 0.39
7 0.34
8 0.29
9 0.26
10 0.23
11 0.18
12 0.16
13 0.12
14 0.09
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.14
56 0.2
57 0.22
58 0.32
59 0.33
60 0.35
61 0.41
62 0.38
63 0.42
64 0.4
65 0.39
66 0.3
67 0.3
68 0.3
69 0.22
70 0.22
71 0.17
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.1
80 0.13
81 0.18
82 0.26
83 0.33
84 0.4
85 0.49
86 0.53
87 0.59
88 0.66
89 0.7
90 0.73
91 0.77
92 0.8
93 0.8
94 0.84
95 0.82
96 0.76
97 0.72
98 0.68
99 0.67
100 0.62
101 0.54
102 0.48
103 0.51
104 0.46
105 0.42
106 0.37
107 0.28
108 0.24
109 0.23
110 0.19
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.14
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.17
125 0.22
126 0.26
127 0.26
128 0.26
129 0.27
130 0.26
131 0.26
132 0.21
133 0.16
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.14
141 0.15
142 0.17
143 0.2
144 0.23
145 0.26
146 0.26
147 0.3
148 0.27
149 0.26
150 0.25
151 0.2
152 0.17
153 0.11
154 0.11
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.21
173 0.24
174 0.26
175 0.28
176 0.28
177 0.33
178 0.36
179 0.34
180 0.28
181 0.27
182 0.29
183 0.31
184 0.3
185 0.23
186 0.21
187 0.22
188 0.2
189 0.2
190 0.16
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.13
222 0.16
223 0.14
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.15
230 0.12
231 0.13
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.12
256 0.15
257 0.15
258 0.18
259 0.19
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.16
265 0.18
266 0.19
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.24
271 0.23
272 0.23
273 0.22
274 0.2
275 0.16
276 0.17
277 0.2
278 0.23
279 0.23
280 0.22
281 0.21
282 0.22
283 0.29
284 0.27
285 0.22
286 0.25
287 0.24
288 0.29
289 0.33
290 0.33
291 0.28
292 0.31
293 0.3
294 0.24
295 0.24
296 0.2
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.16
302 0.15
303 0.19
304 0.21
305 0.24
306 0.24
307 0.26
308 0.28
309 0.27
310 0.28
311 0.27
312 0.28
313 0.27
314 0.26
315 0.23
316 0.19
317 0.2
318 0.19
319 0.18
320 0.16
321 0.16
322 0.22
323 0.25
324 0.24
325 0.31
326 0.37
327 0.43
328 0.45
329 0.45
330 0.47
331 0.5
332 0.55
333 0.52
334 0.54
335 0.54
336 0.6
337 0.61
338 0.55
339 0.51
340 0.5
341 0.44
342 0.4
343 0.34
344 0.28
345 0.28
346 0.27
347 0.31
348 0.3
349 0.32
350 0.29
351 0.29
352 0.33
353 0.31
354 0.34
355 0.32