FuNGI

A0A4T0HQC7

Protein Details

Accession

A0A4T0HQC7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
73-98	EDSDGDRPTKKKRKQNNPKNRFLDVE	Hydrophilic
339-358	ADGKKRKKGKSTATSRPPQK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
82-87	KKKRKQ
341-349	GKKRKKGKS

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR041975 KOW_Spt5_2 IPR041976 KOW_Spt5_3 IPR005100 NGN-domain IPR006645 NGN-like_dom IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0140673 P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1 cd06082 KOW_Spt5_2 cd06083 KOW_Spt5_3 cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MELNNLNSLDNSNSLHNSDNLKAEDIDQSLDHSSGDEKVLDDDEENPVEERIVEEDDDIRDEEEEEDADEEAEDSDGDRPTKKKRKQNNPKNRFLDVEAEVDDDDEEADDDDEVAGKDLEFIQENEEPEDVGRDIRGGHTTIDRRERELYDQDAEQIADSYKERFGRSRYQGEMNEVPQRLLMPSVEDPSLWGVRCKTGRENDIIISIMSKYAANEWGQNPLGIYSAFCPVSIQGWVYVEARSSAHVLEAVKGLVGVYSTASPDRKPFLVPVEEMADLLKIKKQVKEVKPSSWVRIKRGKYQGDLAQVMDITENGEVAGVKFIPRIDLNPKEDNTAVGADGKKRKKGKSTATSRPPQKLYNHADIIKAYGQTSSTKKGDKYVFQGDTFRDGLLEKDITIAGLQTEEVNPQIDEITKFTGQSGEGSGMDLGMMADAVKQSGAILQPGDVVEIFEGQLAGISGSITALRGDVVTIKANVEEFLDKEVEVLSRSVRKKFATGDHIKVINGKYTDETGLVLSINNSDNTVTFISDMSQEEVGDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.23
3	0.25
4	0.27
5	0.28
6	0.32
7	0.3
8	0.3
9	0.29
10	0.29
11	0.29
12	0.25
13	0.24
14	0.19
15	0.19
16	0.19
17	0.18
18	0.16
19	0.13
20	0.13
21	0.13
22	0.14
23	0.12
24	0.11
25	0.13
26	0.15
27	0.15
28	0.14
29	0.14
30	0.17
31	0.17
32	0.17
33	0.16
34	0.15
35	0.14
36	0.14
37	0.13
38	0.11
39	0.12
40	0.11
41	0.12
42	0.14
43	0.15
44	0.17
45	0.16
46	0.14
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.11
51	0.1
52	0.09
53	0.1
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.09
63	0.11
64	0.13
65	0.16
66	0.2
67	0.31
68	0.42
69	0.5
70	0.58
71	0.67
72	0.77
73	0.84
74	0.92
75	0.92
76	0.92
77	0.93
78	0.89
79	0.82
80	0.73
81	0.65
82	0.59
83	0.5
84	0.43
85	0.33
86	0.28
87	0.24
88	0.21
89	0.17
90	0.11
91	0.09
92	0.06
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.07
105	0.07
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.13
110	0.16
111	0.17
112	0.17
113	0.17
114	0.15
115	0.14
116	0.16
117	0.12
118	0.09
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.1
123	0.11
124	0.1
125	0.11
126	0.18
127	0.22
128	0.28
129	0.36
130	0.36
131	0.37
132	0.41
133	0.41
134	0.4
135	0.4
136	0.38
137	0.31
138	0.31
139	0.29
140	0.25
141	0.23
142	0.18
143	0.14
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.13
149	0.16
150	0.17
151	0.2
152	0.24
153	0.32
154	0.39
155	0.43
156	0.44
157	0.47
158	0.47
159	0.5
160	0.49
161	0.42
162	0.41
163	0.35
164	0.32
165	0.25
166	0.24
167	0.19
168	0.16
169	0.13
170	0.1
171	0.11
172	0.13
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.14
177	0.17
178	0.13
179	0.14
180	0.13
181	0.18
182	0.2
183	0.23
184	0.26
185	0.29
186	0.32
187	0.34
188	0.35
189	0.31
190	0.3
191	0.27
192	0.21
193	0.16
194	0.12
195	0.09
196	0.07
197	0.07
198	0.06
199	0.07
200	0.09
201	0.09
202	0.13
203	0.13
204	0.17
205	0.17
206	0.17
207	0.16
208	0.13
209	0.13
210	0.1
211	0.1
212	0.06
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.06
222	0.07
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.07
232	0.06
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.13
255	0.15
256	0.16
257	0.16
258	0.16
259	0.16
260	0.15
261	0.15
262	0.13
263	0.1
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.11
268	0.14
269	0.16
270	0.23
271	0.33
272	0.38
273	0.49
274	0.5
275	0.49
276	0.55
277	0.55
278	0.53
279	0.51
280	0.49
281	0.45
282	0.5
283	0.5
284	0.51
285	0.57
286	0.56
287	0.5
288	0.52
289	0.5
290	0.46
291	0.44
292	0.34
293	0.26
294	0.22
295	0.2
296	0.14
297	0.1
298	0.06
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.11
313	0.17
314	0.23
315	0.28
316	0.32
317	0.33
318	0.33
319	0.33
320	0.3
321	0.25
322	0.19
323	0.14
324	0.13
325	0.13
326	0.17
327	0.25
328	0.28
329	0.34
330	0.4
331	0.44
332	0.49
333	0.57
334	0.62
335	0.65
336	0.7
337	0.73
338	0.77
339	0.81
340	0.78
341	0.76
342	0.69
343	0.64
344	0.58
345	0.58
346	0.55
347	0.54
348	0.52
349	0.47
350	0.45
351	0.39
352	0.38
353	0.31
354	0.25
355	0.17
356	0.13
357	0.13
358	0.16
359	0.19
360	0.22
361	0.23
362	0.27
363	0.27
364	0.34
365	0.37
366	0.37
367	0.4
368	0.43
369	0.43
370	0.4
371	0.43
372	0.37
373	0.37
374	0.33
375	0.27
376	0.18
377	0.16
378	0.15
379	0.15
380	0.14
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.05
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.15
402	0.15
403	0.15
404	0.15
405	0.16
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.12
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.04
418	0.04
419	0.03
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.1
432	0.1
433	0.11
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.06
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.08
457	0.1
458	0.12
459	0.13
460	0.13
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.14
465	0.14
466	0.12
467	0.15
468	0.15
469	0.14
470	0.14
471	0.14
472	0.13
473	0.12
474	0.13
475	0.14
476	0.22
477	0.26
478	0.31
479	0.35
480	0.36
481	0.39
482	0.45
483	0.49
484	0.51
485	0.55
486	0.56
487	0.58
488	0.58
489	0.54
490	0.52
491	0.46
492	0.42
493	0.35
494	0.3
495	0.26
496	0.27
497	0.28
498	0.23
499	0.22
500	0.16
501	0.16
502	0.14
503	0.12
504	0.1
505	0.12
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.16
512	0.16
513	0.13
514	0.12
515	0.12
516	0.13
517	0.15
518	0.17
519	0.16
520	0.16

A0A4T0HQC7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer