Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J7E0

Protein Details
Accession A0A4T0J7E0    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-341KLNRVFDKTTRPRRKNDDPDQKQFDDHydrophilic
422-442EDIPRRLRRSRPTRVNRSESAHydrophilic
816-847AIRQATGQDTQKKPRRKKRKAKEQSVKPENLTHydrophilic
850-869ASQVLKQRKVSKKINYGALEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-385KITAKGLNKKMKKAYEEKARR
827-838KKPRRKKRKAKE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51134  ZF_TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MPQQPCRDCGSTEIDYDSSSGCSFCAKCGIVFEESNIVSEIGFGESSSGQAHVQGTLVSHDVAGTSRQSRDKTISEGKRRVKQLAAALRISEAVSDSGERFYALAVQNEFIRGRKSVYVVAACLYAACRTLRDSHMLIDFSDLMQINVFALGTTYLRLVERLDLKLPKMDPSIYIQRFASLLEFGQETQRVASDATRLCKRFDEDFITHGRRPAGICGAALILAARMNNFRRSVEEIVQVVKIADVTVQKRLDEFGKSAAGDLTVENFRDDERAKNWKEPPRPPTYHNARKKEMMAKEIETDPQGELAKKQDRSKKLNRVFDKTTRPRRKNDDPDQKQFDDYYKTIVGVSADFFQEEDGKDATKKITAKGLNKKMKKAYEEKARRNRAIDSDDNYDQLESEDDEVGNSGKDGETPLFEDSDEDIPRRLRRSRPTRVNRSESAEEDQDGRHAIDQGTSNQPAKLRDAMGPGNESTNEEMQSNTVQGKDFQPPHRDKSATPGDASHPPNKSFNHTSNVIETPEENGPQSEDEVHANDEEKGNERENEEKIVQEDEKENEDEDVRMQVEEGGDKQSGNIGDSQQIQLEQEPGQLPSHSSPQERSDNVPVSPSQTRHSHEPNQSPQPVKEAHQSNESATHETQDASQYRASTELDTQEPREVPQPRAVEEPTTQQPPEEAAKNMDDKEDEKEDEKEDEKEDEKEDEKEDEKEDEEEVIVDETDEPTQVDQVKKQSGPEEKEITEEISHALGDPNIQSLTNRLDNVDDRRRAELERRNANVDELQGLDEEELDDMILGDNEVKVKERIWMEFNKDYLEKIAIRQATGQDTQKKPRRKKRKAKEQSVKPENLTEAASQVLKQRKVSKKINYGALEGLFHKDNREVNSLAPGEVDEKEDEKEDEEEEGDAEEHPAPEYGEEFSDNDMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.27
4 0.23
5 0.17
6 0.15
7 0.13
8 0.1
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.22
13 0.21
14 0.22
15 0.26
16 0.29
17 0.28
18 0.28
19 0.28
20 0.27
21 0.26
22 0.27
23 0.24
24 0.2
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.09
37 0.12
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.16
53 0.21
54 0.27
55 0.29
56 0.33
57 0.38
58 0.4
59 0.44
60 0.51
61 0.56
62 0.6
63 0.68
64 0.72
65 0.75
66 0.76
67 0.73
68 0.66
69 0.62
70 0.61
71 0.61
72 0.57
73 0.5
74 0.46
75 0.42
76 0.38
77 0.32
78 0.23
79 0.15
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.15
90 0.15
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.24
96 0.24
97 0.2
98 0.2
99 0.17
100 0.19
101 0.21
102 0.23
103 0.24
104 0.29
105 0.29
106 0.27
107 0.27
108 0.24
109 0.2
110 0.18
111 0.15
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.17
118 0.2
119 0.24
120 0.24
121 0.26
122 0.29
123 0.29
124 0.27
125 0.25
126 0.23
127 0.17
128 0.2
129 0.17
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.04
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.14
147 0.18
148 0.2
149 0.25
150 0.27
151 0.28
152 0.33
153 0.33
154 0.31
155 0.3
156 0.28
157 0.24
158 0.29
159 0.38
160 0.33
161 0.35
162 0.31
163 0.29
164 0.29
165 0.27
166 0.22
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.16
181 0.19
182 0.24
183 0.31
184 0.32
185 0.33
186 0.36
187 0.39
188 0.36
189 0.37
190 0.39
191 0.33
192 0.35
193 0.41
194 0.43
195 0.4
196 0.39
197 0.35
198 0.29
199 0.28
200 0.29
201 0.26
202 0.21
203 0.2
204 0.17
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.1
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.1
214 0.13
215 0.17
216 0.19
217 0.19
218 0.22
219 0.28
220 0.32
221 0.31
222 0.32
223 0.29
224 0.29
225 0.29
226 0.25
227 0.2
228 0.15
229 0.11
230 0.07
231 0.08
232 0.11
233 0.13
234 0.19
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.23
240 0.2
241 0.2
242 0.16
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.19
260 0.28
261 0.3
262 0.37
263 0.45
264 0.51
265 0.58
266 0.63
267 0.65
268 0.66
269 0.67
270 0.63
271 0.65
272 0.67
273 0.69
274 0.71
275 0.71
276 0.65
277 0.65
278 0.66
279 0.64
280 0.57
281 0.51
282 0.45
283 0.39
284 0.39
285 0.36
286 0.32
287 0.24
288 0.21
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.13
293 0.13
294 0.19
295 0.25
296 0.28
297 0.35
298 0.4
299 0.47
300 0.55
301 0.64
302 0.68
303 0.7
304 0.76
305 0.75
306 0.74
307 0.72
308 0.71
309 0.72
310 0.72
311 0.74
312 0.75
313 0.75
314 0.75
315 0.77
316 0.8
317 0.8
318 0.81
319 0.81
320 0.78
321 0.82
322 0.82
323 0.74
324 0.64
325 0.54
326 0.46
327 0.4
328 0.32
329 0.26
330 0.2
331 0.19
332 0.17
333 0.17
334 0.15
335 0.1
336 0.11
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.21
354 0.26
355 0.34
356 0.43
357 0.53
358 0.58
359 0.6
360 0.65
361 0.65
362 0.64
363 0.61
364 0.58
365 0.56
366 0.58
367 0.64
368 0.69
369 0.72
370 0.75
371 0.71
372 0.66
373 0.61
374 0.54
375 0.51
376 0.44
377 0.38
378 0.36
379 0.34
380 0.33
381 0.3
382 0.25
383 0.18
384 0.15
385 0.11
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.13
408 0.13
409 0.12
410 0.13
411 0.15
412 0.18
413 0.21
414 0.24
415 0.27
416 0.37
417 0.46
418 0.55
419 0.63
420 0.71
421 0.78
422 0.81
423 0.81
424 0.73
425 0.7
426 0.62
427 0.53
428 0.46
429 0.36
430 0.28
431 0.23
432 0.2
433 0.14
434 0.12
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.15
443 0.16
444 0.16
445 0.16
446 0.18
447 0.17
448 0.18
449 0.17
450 0.16
451 0.15
452 0.18
453 0.18
454 0.17
455 0.17
456 0.15
457 0.14
458 0.13
459 0.12
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.09
472 0.11
473 0.16
474 0.21
475 0.25
476 0.33
477 0.36
478 0.4
479 0.44
480 0.43
481 0.37
482 0.4
483 0.44
484 0.37
485 0.33
486 0.3
487 0.28
488 0.34
489 0.37
490 0.34
491 0.28
492 0.28
493 0.32
494 0.32
495 0.36
496 0.33
497 0.33
498 0.33
499 0.32
500 0.32
501 0.31
502 0.31
503 0.25
504 0.2
505 0.17
506 0.15
507 0.14
508 0.14
509 0.11
510 0.09
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.08
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.12
525 0.14
526 0.15
527 0.16
528 0.16
529 0.19
530 0.19
531 0.22
532 0.19
533 0.18
534 0.17
535 0.19
536 0.17
537 0.15
538 0.16
539 0.14
540 0.16
541 0.16
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.13
546 0.11
547 0.11
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.09
564 0.12
565 0.13
566 0.14
567 0.12
568 0.12
569 0.11
570 0.1
571 0.12
572 0.09
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.12
578 0.13
579 0.13
580 0.18
581 0.18
582 0.19
583 0.2
584 0.25
585 0.3
586 0.3
587 0.32
588 0.34
589 0.33
590 0.32
591 0.31
592 0.26
593 0.25
594 0.28
595 0.25
596 0.23
597 0.25
598 0.28
599 0.33
600 0.39
601 0.43
602 0.47
603 0.54
604 0.57
605 0.6
606 0.62
607 0.58
608 0.52
609 0.48
610 0.42
611 0.36
612 0.37
613 0.35
614 0.33
615 0.34
616 0.35
617 0.31
618 0.35
619 0.34
620 0.3
621 0.24
622 0.23
623 0.19
624 0.19
625 0.19
626 0.19
627 0.18
628 0.17
629 0.18
630 0.17
631 0.17
632 0.18
633 0.18
634 0.14
635 0.15
636 0.16
637 0.18
638 0.19
639 0.2
640 0.22
641 0.21
642 0.21
643 0.26
644 0.27
645 0.26
646 0.31
647 0.32
648 0.3
649 0.33
650 0.33
651 0.29
652 0.27
653 0.3
654 0.27
655 0.29
656 0.27
657 0.23
658 0.23
659 0.23
660 0.25
661 0.23
662 0.2
663 0.19
664 0.22
665 0.25
666 0.25
667 0.23
668 0.2
669 0.19
670 0.22
671 0.23
672 0.22
673 0.22
674 0.23
675 0.24
676 0.26
677 0.27
678 0.24
679 0.22
680 0.24
681 0.23
682 0.23
683 0.23
684 0.23
685 0.23
686 0.23
687 0.23
688 0.23
689 0.23
690 0.23
691 0.23
692 0.22
693 0.21
694 0.2
695 0.19
696 0.16
697 0.14
698 0.12
699 0.11
700 0.09
701 0.08
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.09
710 0.13
711 0.15
712 0.18
713 0.24
714 0.29
715 0.3
716 0.32
717 0.37
718 0.41
719 0.44
720 0.47
721 0.47
722 0.41
723 0.42
724 0.41
725 0.36
726 0.28
727 0.23
728 0.17
729 0.12
730 0.12
731 0.1
732 0.1
733 0.08
734 0.09
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.1
739 0.09
740 0.11
741 0.17
742 0.19
743 0.2
744 0.18
745 0.21
746 0.26
747 0.34
748 0.41
749 0.4
750 0.39
751 0.42
752 0.43
753 0.43
754 0.48
755 0.48
756 0.49
757 0.53
758 0.54
759 0.55
760 0.54
761 0.53
762 0.46
763 0.38
764 0.3
765 0.21
766 0.18
767 0.14
768 0.14
769 0.11
770 0.09
771 0.08
772 0.07
773 0.06
774 0.05
775 0.04
776 0.04
777 0.05
778 0.05
779 0.04
780 0.05
781 0.06
782 0.07
783 0.08
784 0.1
785 0.11
786 0.11
787 0.18
788 0.2
789 0.23
790 0.27
791 0.33
792 0.38
793 0.42
794 0.42
795 0.41
796 0.38
797 0.36
798 0.32
799 0.31
800 0.24
801 0.22
802 0.28
803 0.25
804 0.25
805 0.27
806 0.28
807 0.29
808 0.32
809 0.37
810 0.4
811 0.45
812 0.55
813 0.61
814 0.68
815 0.74
816 0.8
817 0.85
818 0.87
819 0.92
820 0.93
821 0.95
822 0.96
823 0.97
824 0.97
825 0.96
826 0.96
827 0.94
828 0.88
829 0.79
830 0.72
831 0.62
832 0.53
833 0.44
834 0.33
835 0.25
836 0.21
837 0.19
838 0.16
839 0.22
840 0.28
841 0.3
842 0.35
843 0.44
844 0.52
845 0.61
846 0.69
847 0.72
848 0.74
849 0.78
850 0.81
851 0.74
852 0.67
853 0.61
854 0.53
855 0.45
856 0.36
857 0.32
858 0.26
859 0.23
860 0.23
861 0.24
862 0.27
863 0.3
864 0.33
865 0.31
866 0.29
867 0.37
868 0.35
869 0.31
870 0.27
871 0.22
872 0.2
873 0.2
874 0.21
875 0.15
876 0.16
877 0.17
878 0.19
879 0.19
880 0.19
881 0.2
882 0.18
883 0.18
884 0.17
885 0.16
886 0.14
887 0.14
888 0.12
889 0.11
890 0.12
891 0.12
892 0.12
893 0.12
894 0.12
895 0.12
896 0.12
897 0.13
898 0.12
899 0.12
900 0.14
901 0.14