Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0TBG9

Protein Details
Accession A0A4T0TBG9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-325RRDARRAERRGSFRNRSRSPTARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-327RARRQDEREARRDARRAERRGSFRNRSRSPTARER
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGKIAEVQRKLLQQLMGAEAMGFKSVNLHFTDQQVCRNFLCGLCPHDLFSNTKMDLGPCPKSHSDKLKKEFLEDQLKNASKYAEFHREYENNIRNFLTECDRRIRTAHKRLEKTPEENNKTTALMREVGEIQAAMDQAMIDVEKLGESGLVEESMKELQKVEALKQEKINKEQELTDLTETSGASGHQKLRVCDICGAYLSILDSDRRLADHFGGKMHLGYFELRRIIAEISENRAIQRRKQQEEADQDREYKSQQPERDQQTDDINISSSLYEDKDAPSKLSPPPGEQIDPRARRQDEREARRDARRAERRGSFRNRSRSPTARERE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.25
4 0.21
5 0.19
6 0.15
7 0.14
8 0.12
9 0.09
10 0.06
11 0.11
12 0.12
13 0.15
14 0.17
15 0.22
16 0.23
17 0.27
18 0.35
19 0.32
20 0.39
21 0.4
22 0.4
23 0.36
24 0.37
25 0.34
26 0.27
27 0.29
28 0.25
29 0.25
30 0.27
31 0.27
32 0.26
33 0.27
34 0.29
35 0.28
36 0.27
37 0.29
38 0.25
39 0.26
40 0.25
41 0.23
42 0.27
43 0.3
44 0.33
45 0.28
46 0.34
47 0.37
48 0.43
49 0.49
50 0.53
51 0.58
52 0.62
53 0.67
54 0.7
55 0.66
56 0.64
57 0.63
58 0.6
59 0.6
60 0.5
61 0.48
62 0.48
63 0.49
64 0.45
65 0.4
66 0.34
67 0.24
68 0.27
69 0.29
70 0.3
71 0.3
72 0.31
73 0.38
74 0.38
75 0.41
76 0.48
77 0.49
78 0.4
79 0.4
80 0.38
81 0.31
82 0.31
83 0.29
84 0.27
85 0.23
86 0.24
87 0.3
88 0.31
89 0.32
90 0.33
91 0.4
92 0.43
93 0.5
94 0.57
95 0.59
96 0.63
97 0.66
98 0.73
99 0.69
100 0.63
101 0.63
102 0.64
103 0.62
104 0.58
105 0.55
106 0.47
107 0.42
108 0.39
109 0.31
110 0.22
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.11
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.16
150 0.19
151 0.2
152 0.25
153 0.31
154 0.31
155 0.35
156 0.38
157 0.32
158 0.31
159 0.3
160 0.26
161 0.23
162 0.21
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.1
173 0.11
174 0.15
175 0.17
176 0.17
177 0.23
178 0.25
179 0.25
180 0.26
181 0.25
182 0.22
183 0.2
184 0.2
185 0.14
186 0.12
187 0.1
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.12
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.15
217 0.14
218 0.18
219 0.21
220 0.21
221 0.21
222 0.28
223 0.29
224 0.31
225 0.39
226 0.43
227 0.46
228 0.53
229 0.56
230 0.57
231 0.66
232 0.68
233 0.64
234 0.56
235 0.53
236 0.48
237 0.45
238 0.38
239 0.35
240 0.35
241 0.36
242 0.4
243 0.46
244 0.53
245 0.59
246 0.63
247 0.58
248 0.53
249 0.5
250 0.47
251 0.4
252 0.32
253 0.25
254 0.2
255 0.18
256 0.15
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.17
264 0.18
265 0.2
266 0.21
267 0.24
268 0.27
269 0.35
270 0.35
271 0.33
272 0.38
273 0.4
274 0.41
275 0.39
276 0.44
277 0.46
278 0.49
279 0.5
280 0.54
281 0.52
282 0.55
283 0.59
284 0.62
285 0.62
286 0.67
287 0.69
288 0.69
289 0.72
290 0.75
291 0.76
292 0.72
293 0.72
294 0.73
295 0.72
296 0.72
297 0.74
298 0.74
299 0.77
300 0.8
301 0.8
302 0.79
303 0.83
304 0.81
305 0.8
306 0.81
307 0.79
308 0.78