Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0S5V4

Protein Details
Accession A0A4T0S5V4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
543-568IEKRELEREKSTRRIRRDISKPGTGFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
550-576REKSTRRIRRDISKPGTGFGSRRRYGR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MDDNIDWPVIYQRIRTSFQDVLAEPIVNKLRKEQFNRASLYQLLKIAEHRNDDPTSLDYLHKWVKSESYDIIPPPKRGPGRPPKSAQLENDEEAVDIPYKHVWKTGDPVPLQNSHKPAEKVGGGQALYTTFPARIKQGITTLMQPVNNILNQQGVIEAKYGNPKETLAMQAMANSRRKGFVNYAERDPDEFEEEYDSDDDSGSRRRSSRRQTEGGSTGPSTPMPGGIRRGDQFSYVGSYLGDIPPGASIVSEFLDKDRMFKLQYASERELEGNAERTFLPVPIRIEIDHENWRLRDTFIWNANETVLRPATFAEGLCSDLKIPIRPYADQIANLMQQQIEEHQAVIEVDVSHRERLKELSNGGLVTSEPTMDVEDEDNYEDDLVYQREKPQQQQFKGTKQVEEVDGQPEDQDIAMNLETDLRVILNTIQLDIQFANFHLTDKVEWDLCSPMPPEVFAETLCLDLGLSGEAKAAIAHVIHEELIRHKKEAIESGLMGASTGQRSDLDHPLFNGKGPRKLEGVWRDWHEADEYIPRLEYYTAQDIEKRELEREKSTRRIRRDISKPGTGFGSRRRYGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.41
4 0.4
5 0.41
6 0.44
7 0.37
8 0.36
9 0.34
10 0.32
11 0.25
12 0.29
13 0.33
14 0.3
15 0.3
16 0.34
17 0.41
18 0.49
19 0.57
20 0.62
21 0.63
22 0.68
23 0.73
24 0.66
25 0.61
26 0.56
27 0.52
28 0.45
29 0.39
30 0.33
31 0.28
32 0.32
33 0.35
34 0.35
35 0.37
36 0.36
37 0.38
38 0.38
39 0.38
40 0.35
41 0.3
42 0.29
43 0.25
44 0.25
45 0.2
46 0.25
47 0.31
48 0.3
49 0.29
50 0.27
51 0.3
52 0.32
53 0.34
54 0.31
55 0.3
56 0.32
57 0.33
58 0.41
59 0.41
60 0.41
61 0.4
62 0.45
63 0.46
64 0.47
65 0.55
66 0.57
67 0.6
68 0.66
69 0.69
70 0.69
71 0.72
72 0.73
73 0.66
74 0.62
75 0.6
76 0.52
77 0.48
78 0.39
79 0.31
80 0.26
81 0.23
82 0.16
83 0.11
84 0.11
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.19
89 0.19
90 0.21
91 0.26
92 0.32
93 0.35
94 0.35
95 0.39
96 0.39
97 0.44
98 0.46
99 0.45
100 0.43
101 0.38
102 0.44
103 0.41
104 0.38
105 0.36
106 0.33
107 0.3
108 0.29
109 0.3
110 0.23
111 0.22
112 0.21
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.16
122 0.17
123 0.18
124 0.2
125 0.22
126 0.22
127 0.23
128 0.26
129 0.26
130 0.25
131 0.23
132 0.22
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.2
153 0.21
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.17
158 0.2
159 0.24
160 0.27
161 0.26
162 0.25
163 0.26
164 0.27
165 0.27
166 0.28
167 0.32
168 0.37
169 0.4
170 0.43
171 0.43
172 0.43
173 0.4
174 0.37
175 0.29
176 0.23
177 0.2
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.14
189 0.14
190 0.17
191 0.2
192 0.26
193 0.36
194 0.46
195 0.55
196 0.57
197 0.6
198 0.6
199 0.63
200 0.6
201 0.52
202 0.44
203 0.35
204 0.27
205 0.23
206 0.19
207 0.14
208 0.11
209 0.12
210 0.11
211 0.12
212 0.15
213 0.16
214 0.19
215 0.19
216 0.22
217 0.2
218 0.19
219 0.18
220 0.15
221 0.16
222 0.13
223 0.12
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.05
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.17
248 0.19
249 0.18
250 0.23
251 0.27
252 0.29
253 0.28
254 0.28
255 0.26
256 0.24
257 0.2
258 0.17
259 0.14
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.15
273 0.16
274 0.18
275 0.21
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.23
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.19
285 0.23
286 0.25
287 0.24
288 0.24
289 0.23
290 0.22
291 0.19
292 0.16
293 0.11
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.15
311 0.18
312 0.18
313 0.2
314 0.23
315 0.24
316 0.22
317 0.22
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.05
335 0.05
336 0.09
337 0.1
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.17
343 0.2
344 0.2
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.2
349 0.18
350 0.16
351 0.12
352 0.1
353 0.09
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.15
374 0.22
375 0.25
376 0.32
377 0.4
378 0.48
379 0.5
380 0.59
381 0.61
382 0.6
383 0.67
384 0.62
385 0.53
386 0.46
387 0.45
388 0.37
389 0.33
390 0.28
391 0.21
392 0.2
393 0.18
394 0.15
395 0.13
396 0.11
397 0.09
398 0.08
399 0.05
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.08
421 0.08
422 0.11
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.15
430 0.13
431 0.14
432 0.14
433 0.16
434 0.15
435 0.17
436 0.16
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.14
442 0.15
443 0.12
444 0.14
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.16
469 0.24
470 0.25
471 0.26
472 0.27
473 0.29
474 0.32
475 0.37
476 0.35
477 0.3
478 0.29
479 0.29
480 0.28
481 0.24
482 0.21
483 0.15
484 0.13
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.12
490 0.17
491 0.25
492 0.26
493 0.26
494 0.28
495 0.32
496 0.32
497 0.32
498 0.37
499 0.33
500 0.38
501 0.39
502 0.4
503 0.38
504 0.4
505 0.47
506 0.46
507 0.46
508 0.46
509 0.49
510 0.51
511 0.49
512 0.48
513 0.41
514 0.33
515 0.3
516 0.3
517 0.27
518 0.22
519 0.22
520 0.21
521 0.2
522 0.2
523 0.21
524 0.19
525 0.25
526 0.25
527 0.26
528 0.3
529 0.31
530 0.36
531 0.39
532 0.34
533 0.33
534 0.38
535 0.42
536 0.48
537 0.54
538 0.57
539 0.62
540 0.71
541 0.75
542 0.76
543 0.81
544 0.8
545 0.81
546 0.82
547 0.83
548 0.8
549 0.81
550 0.73
551 0.66
552 0.63
553 0.56
554 0.52
555 0.5
556 0.53