Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0M9W4

Protein Details
Accession A0A4T0M9W4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-153MSSPIKKKSKQSQQPVAHTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.166, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR003029  S1_domain  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PF04003  Utp12  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd04462  S1_RNAPII_Rpb7  
Amino Acid Sequences MDFINNKLYADVEDPGSGTVLPGVGTAEFVVKYTAIVYKPFKGEVVDGQVASVNKMGFFADVGPLQVFVSSHLIPQDIKFDPSSNPACFSSEDQVIEKGSKVRLKIVGTRVDATEIYIVVDRQDKFAFSKKTSMSSPIKKKSKQSQQPVAHTSIYKSQSDQNVDEHAQLPTDNLAELSLGQRLKASSKKAEELDGEEDTETPALPVNSLATLLTQSLNSNDTNLLESCLGQTDASIIRNTVDRLPSQLAIPLLHQCTTRLAKPGKAGPQRAKGLLEWSRAVLTIHTAYLLSMPNVTEKLLGLHSALSQRISSHEKLMGLSGRLDVVLSQIALQRSIQEERRSKEQNKKSNNAVTYIEGDSDEEDNVEYDNDDAEAIEDVELGNGEDESDSESGEEVEDDDEIDNSLDGDDSDRNAMVEDEAIEEDDDSDDDDEEDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.13
5 0.1
6 0.09
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.09
15 0.08
16 0.09
17 0.1
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.14
22 0.13
23 0.19
24 0.23
25 0.28
26 0.3
27 0.31
28 0.3
29 0.28
30 0.29
31 0.28
32 0.32
33 0.29
34 0.26
35 0.25
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.22
40 0.14
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.2
64 0.17
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.27
70 0.31
71 0.26
72 0.28
73 0.27
74 0.28
75 0.28
76 0.29
77 0.27
78 0.25
79 0.25
80 0.23
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.2
85 0.19
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.26
90 0.29
91 0.32
92 0.38
93 0.41
94 0.43
95 0.43
96 0.43
97 0.39
98 0.36
99 0.32
100 0.26
101 0.2
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.15
108 0.14
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.18
113 0.27
114 0.31
115 0.27
116 0.34
117 0.33
118 0.36
119 0.37
120 0.42
121 0.42
122 0.47
123 0.55
124 0.58
125 0.65
126 0.66
127 0.73
128 0.76
129 0.78
130 0.78
131 0.78
132 0.79
133 0.78
134 0.81
135 0.77
136 0.7
137 0.6
138 0.51
139 0.43
140 0.39
141 0.34
142 0.27
143 0.24
144 0.26
145 0.29
146 0.32
147 0.32
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.28
152 0.24
153 0.19
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.13
171 0.17
172 0.2
173 0.23
174 0.26
175 0.3
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.28
180 0.27
181 0.21
182 0.19
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.08
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.14
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.15
235 0.14
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.23
247 0.24
248 0.26
249 0.29
250 0.34
251 0.39
252 0.43
253 0.48
254 0.47
255 0.54
256 0.53
257 0.51
258 0.47
259 0.38
260 0.39
261 0.37
262 0.33
263 0.26
264 0.24
265 0.22
266 0.21
267 0.21
268 0.14
269 0.11
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.15
297 0.2
298 0.19
299 0.2
300 0.22
301 0.22
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.15
322 0.2
323 0.24
324 0.3
325 0.37
326 0.4
327 0.48
328 0.55
329 0.59
330 0.65
331 0.69
332 0.7
333 0.73
334 0.75
335 0.74
336 0.74
337 0.69
338 0.62
339 0.54
340 0.46
341 0.4
342 0.35
343 0.27
344 0.19
345 0.18
346 0.16
347 0.15
348 0.12
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09