Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0LQH6

Protein Details
Accession A0A4T0LQH6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29ETSSQPKKARFLHNDKDTQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-195SRKRIREAHKERLRKE
238-247KAREKVKKKG
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 1, cyto 1, pero 1, vacu 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSTSKRSLEETSSQPKKARFLHNDKDTQELDTTDDLEYKKERKGAIKNEGYESDSSNEGGESVVRSRTKKNDDDDDDMFGGDSDKPKEDSKSSTKPLELGDIEGQEFGGLGDRQAGEDSEGYSSGDAEDEEAEMGGQLSAFNMKEEMREGQFVDDGTYVENTRDPHAMHDAWMDNTDKASRKRIREAHKERLRKEKEEYEHAQALNAQGGRKEETMIALAEMTQRGETVLEALQRLGKAREKVKKKGGEELKEASKDVEKFTELVNIMVSLGVAEVYDWEHEQFVRNVKRSGYVKDDWVPSSYKKEDDSQNVQPDTSNDPLWEYKQTPTYIASLPAAERPVEVQIFGPFKQTDLLNWVKGGYLGPNGSYIKVRSVNGESRGDWKDFQATGLIASSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.58
3 0.6
4 0.62
5 0.64
6 0.64
7 0.67
8 0.73
9 0.78
10 0.81
11 0.75
12 0.72
13 0.62
14 0.55
15 0.46
16 0.37
17 0.3
18 0.24
19 0.24
20 0.18
21 0.21
22 0.18
23 0.2
24 0.24
25 0.25
26 0.28
27 0.31
28 0.35
29 0.4
30 0.49
31 0.55
32 0.61
33 0.65
34 0.64
35 0.64
36 0.62
37 0.56
38 0.47
39 0.4
40 0.32
41 0.25
42 0.21
43 0.17
44 0.14
45 0.12
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.16
51 0.19
52 0.22
53 0.28
54 0.37
55 0.44
56 0.49
57 0.54
58 0.58
59 0.6
60 0.64
61 0.59
62 0.55
63 0.47
64 0.4
65 0.33
66 0.23
67 0.18
68 0.14
69 0.16
70 0.13
71 0.15
72 0.18
73 0.2
74 0.24
75 0.25
76 0.31
77 0.36
78 0.43
79 0.47
80 0.48
81 0.47
82 0.45
83 0.43
84 0.41
85 0.33
86 0.28
87 0.25
88 0.21
89 0.21
90 0.19
91 0.17
92 0.11
93 0.11
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.12
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.09
149 0.11
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.16
165 0.17
166 0.27
167 0.31
168 0.34
169 0.42
170 0.5
171 0.56
172 0.63
173 0.69
174 0.71
175 0.73
176 0.77
177 0.72
178 0.75
179 0.71
180 0.63
181 0.6
182 0.56
183 0.51
184 0.51
185 0.51
186 0.45
187 0.44
188 0.4
189 0.35
190 0.28
191 0.24
192 0.19
193 0.17
194 0.12
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.15
225 0.19
226 0.27
227 0.35
228 0.41
229 0.48
230 0.56
231 0.61
232 0.58
233 0.63
234 0.64
235 0.61
236 0.58
237 0.55
238 0.52
239 0.45
240 0.43
241 0.35
242 0.31
243 0.26
244 0.23
245 0.2
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.2
250 0.16
251 0.15
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.1
270 0.12
271 0.2
272 0.26
273 0.29
274 0.31
275 0.31
276 0.38
277 0.39
278 0.41
279 0.39
280 0.34
281 0.36
282 0.39
283 0.42
284 0.36
285 0.35
286 0.34
287 0.29
288 0.34
289 0.32
290 0.29
291 0.28
292 0.33
293 0.38
294 0.42
295 0.47
296 0.48
297 0.53
298 0.51
299 0.49
300 0.44
301 0.39
302 0.37
303 0.32
304 0.25
305 0.18
306 0.2
307 0.22
308 0.24
309 0.26
310 0.23
311 0.24
312 0.29
313 0.3
314 0.28
315 0.28
316 0.29
317 0.26
318 0.26
319 0.23
320 0.19
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.16
325 0.15
326 0.14
327 0.17
328 0.16
329 0.16
330 0.14
331 0.18
332 0.21
333 0.21
334 0.25
335 0.2
336 0.21
337 0.23
338 0.22
339 0.19
340 0.23
341 0.27
342 0.23
343 0.24
344 0.23
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.16
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.24
356 0.22
357 0.25
358 0.29
359 0.29
360 0.3
361 0.36
362 0.41
363 0.44
364 0.47
365 0.41
366 0.43
367 0.47
368 0.44
369 0.38
370 0.34
371 0.35
372 0.31
373 0.3
374 0.27
375 0.23
376 0.21