Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0LU31

Protein Details
Accession A0A4T0LU31    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-218LDIHRTKSKSKVEKRRKSDSDNAPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-210SKSKVEKRRK
268-275KKLKHKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MTDYYIDEDGWKIPTNGDNAPSSAYKIIETSLRLSIPPVFSNDPKSGATEMLDSLVMRYVPALGAVLLTHINTQFSQSAGLILDESPFSVTDVKFTALVWSPTNGQRMRGKVTLCSPDHISLLVHHTFNVTIPREYIDCDNFKYASDSSETGSGGRWVHKSSTQVLAEVDRELDFTVVERVTSNQMLTLTASLLDIHRTKSKSKVEKRRKSDSDNAPVDDTRVAKKAKIPIRTADSSDERTSDSSDSDSSSEDEEPPQQTSSSTVEAKKLKHKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.24
4 0.26
5 0.25
6 0.24
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.22
11 0.2
12 0.17
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.23
23 0.22
24 0.22
25 0.24
26 0.25
27 0.27
28 0.33
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.3
33 0.26
34 0.23
35 0.21
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.18
90 0.24
91 0.22
92 0.24
93 0.27
94 0.29
95 0.32
96 0.33
97 0.31
98 0.27
99 0.32
100 0.35
101 0.32
102 0.31
103 0.29
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.19
108 0.12
109 0.16
110 0.15
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.16
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.14
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.21
153 0.21
154 0.19
155 0.17
156 0.15
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.18
185 0.2
186 0.22
187 0.3
188 0.4
189 0.47
190 0.56
191 0.65
192 0.71
193 0.79
194 0.85
195 0.87
196 0.85
197 0.82
198 0.82
199 0.8
200 0.79
201 0.74
202 0.68
203 0.6
204 0.53
205 0.46
206 0.39
207 0.31
208 0.23
209 0.24
210 0.23
211 0.22
212 0.27
213 0.35
214 0.39
215 0.45
216 0.45
217 0.47
218 0.54
219 0.55
220 0.53
221 0.51
222 0.49
223 0.47
224 0.44
225 0.38
226 0.32
227 0.3
228 0.3
229 0.24
230 0.2
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.2
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.2
246 0.19
247 0.21
248 0.23
249 0.24
250 0.27
251 0.26
252 0.33
253 0.38
254 0.43
255 0.5