Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0SWC5

Protein Details
Accession A0A4T0SWC5    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-179NFTHLFSNRGQKRRKINSNRKVIQPPHHydrophilic
404-431VEQRFAKVRSGKKKKDKEKRRAAKVDGGBasic
901-922INLMRRNQERRLQRKNQQLTSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-427KVRSGKKKKDKEKRRAAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MAGNPDESSAISSLGGLALNDLIGGELEGYDSSYLQSFGLAGSNKLSKEQIENDDLFGDDDDDEQIGANVGDDFEDDMDEDLPEEEETLKGAPSQSKARGEDDDYDEDYDAIDEQPYEPEEADMEEIADKEEEAKKIDVKEIFPAFDADKVLNFTHLFSNRGQKRRKINSNRKVIQPPHIHVHFQQAPSTKELFNRPLPPTVPKPTYIDHLVSRIWNPNVQRDSKWKKEEPSGEVKDTKEMTLVDLADWEDDIKWSAGPEVPLHIKNGIPMIATLPPNSSLMDDDWTKSIIFNEKQKPQQSFVKLTLDMNDPSLMFEELDESSQQPATNALTSTSADPFNLSNDHLYEQSVTAPKHRIRQTFSQIDVQHAYPALKLQLPFYKTRLSKNEARSFHRPILMFPLNVEQRFAKVRSGKKKKDKEKRRAAKVDGGAELLHTTKDLTLKDGTNYALWEYSEEYPSIMSNFGMGSVLVNYYRKKDQHDDHVPKSDFGEPFVLDVADESPFMKLGFVDSGQTIPTLYNNLIRAPLFRHQANPTDFLVIRSTSRHETSYFIREIKNVFLVGQTYPVSAVPGPHSRMITNTTKYRLQAIAYKLLKRTKGERLILDRLWKYFQDQNEMQMRQRLKEFMEYNRKGEHAGYWRLKATAKIPENEEILKLVSPEHVALCEAMQVGQRRLLDAGYGNVEDESQDTTAGDETKLSIEQQLAPWITTKNFVNATQSKAMLKLYGEGDPSGRGEAFSFIRVSMKDIFLRAGEDPEKIRAEVDNRPKHAHRYTVAEQQKVYKEEIARIWKAQFKALSNPIAPKLDRKDEEAFASHQRAQKEADEEKEKAKSQHGTKILKIRRLINGSWQTEMIEDSAVISAYVRKRQIIEDQSLDVDKIEPTGDEELDRRRAKMIEEKINLMRRNQERRLQRKNQQLTSAGGEPLQMKTTTKSDTTRKCGNCGQIGHMKTNRKCPLWAQFHGPNAQPSPNAAAQLPTPTVAATPGIVSGLPSTIDANNVAGFGTPQNQGPTPAGGSQPGTPAGANQSKIKLNVGGNKSSTQSPQPAGMQQLPPQFLQPQQILQAQQAQQFAQQMAQQQQQQQQFAQPFPFPFPLPNQDQQQSPPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.07
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.05
10 0.04
11 0.05
12 0.04
13 0.04
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.16
30 0.21
31 0.21
32 0.23
33 0.24
34 0.21
35 0.27
36 0.33
37 0.35
38 0.37
39 0.38
40 0.37
41 0.36
42 0.34
43 0.28
44 0.22
45 0.17
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.13
79 0.16
80 0.2
81 0.27
82 0.33
83 0.39
84 0.42
85 0.44
86 0.45
87 0.45
88 0.47
89 0.46
90 0.43
91 0.38
92 0.37
93 0.33
94 0.29
95 0.25
96 0.19
97 0.14
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.11
118 0.16
119 0.17
120 0.19
121 0.21
122 0.24
123 0.26
124 0.32
125 0.32
126 0.29
127 0.35
128 0.34
129 0.33
130 0.3
131 0.3
132 0.25
133 0.23
134 0.23
135 0.16
136 0.15
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.22
143 0.24
144 0.25
145 0.25
146 0.35
147 0.41
148 0.49
149 0.55
150 0.56
151 0.64
152 0.73
153 0.81
154 0.82
155 0.85
156 0.86
157 0.9
158 0.88
159 0.85
160 0.84
161 0.77
162 0.76
163 0.73
164 0.68
165 0.66
166 0.62
167 0.56
168 0.48
169 0.53
170 0.49
171 0.42
172 0.42
173 0.38
174 0.38
175 0.39
176 0.41
177 0.33
178 0.32
179 0.37
180 0.38
181 0.4
182 0.45
183 0.44
184 0.46
185 0.46
186 0.48
187 0.49
188 0.51
189 0.48
190 0.43
191 0.44
192 0.4
193 0.43
194 0.41
195 0.37
196 0.3
197 0.3
198 0.29
199 0.28
200 0.29
201 0.3
202 0.28
203 0.29
204 0.29
205 0.35
206 0.39
207 0.4
208 0.41
209 0.45
210 0.53
211 0.58
212 0.65
213 0.61
214 0.61
215 0.67
216 0.7
217 0.65
218 0.67
219 0.63
220 0.6
221 0.58
222 0.53
223 0.49
224 0.43
225 0.37
226 0.29
227 0.23
228 0.2
229 0.19
230 0.19
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.11
236 0.09
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.15
248 0.19
249 0.19
250 0.21
251 0.21
252 0.19
253 0.19
254 0.2
255 0.16
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.14
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.19
278 0.21
279 0.29
280 0.36
281 0.42
282 0.49
283 0.55
284 0.56
285 0.53
286 0.58
287 0.55
288 0.52
289 0.49
290 0.47
291 0.43
292 0.4
293 0.38
294 0.33
295 0.27
296 0.24
297 0.2
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.12
302 0.09
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.11
324 0.12
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.16
338 0.16
339 0.18
340 0.24
341 0.27
342 0.35
343 0.41
344 0.42
345 0.43
346 0.52
347 0.57
348 0.56
349 0.56
350 0.55
351 0.49
352 0.47
353 0.44
354 0.35
355 0.27
356 0.22
357 0.2
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.14
364 0.18
365 0.2
366 0.22
367 0.24
368 0.3
369 0.3
370 0.37
371 0.4
372 0.41
373 0.46
374 0.53
375 0.6
376 0.57
377 0.61
378 0.61
379 0.6
380 0.58
381 0.55
382 0.45
383 0.37
384 0.41
385 0.37
386 0.31
387 0.26
388 0.29
389 0.28
390 0.27
391 0.28
392 0.19
393 0.19
394 0.22
395 0.23
396 0.21
397 0.25
398 0.33
399 0.43
400 0.54
401 0.61
402 0.69
403 0.78
404 0.83
405 0.87
406 0.9
407 0.9
408 0.9
409 0.91
410 0.91
411 0.88
412 0.82
413 0.79
414 0.72
415 0.64
416 0.53
417 0.44
418 0.33
419 0.25
420 0.22
421 0.14
422 0.09
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.09
427 0.09
428 0.11
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.16
433 0.16
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.08
460 0.08
461 0.11
462 0.16
463 0.17
464 0.22
465 0.29
466 0.32
467 0.4
468 0.51
469 0.55
470 0.54
471 0.61
472 0.57
473 0.5
474 0.48
475 0.43
476 0.32
477 0.26
478 0.24
479 0.15
480 0.15
481 0.15
482 0.12
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.07
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.11
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.18
515 0.18
516 0.18
517 0.21
518 0.22
519 0.29
520 0.3
521 0.3
522 0.26
523 0.25
524 0.25
525 0.23
526 0.22
527 0.15
528 0.14
529 0.12
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.17
536 0.19
537 0.23
538 0.22
539 0.21
540 0.2
541 0.2
542 0.21
543 0.19
544 0.17
545 0.12
546 0.1
547 0.09
548 0.1
549 0.09
550 0.1
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.08
558 0.09
559 0.12
560 0.14
561 0.16
562 0.16
563 0.16
564 0.17
565 0.21
566 0.23
567 0.23
568 0.24
569 0.26
570 0.27
571 0.28
572 0.29
573 0.25
574 0.22
575 0.23
576 0.23
577 0.29
578 0.29
579 0.31
580 0.32
581 0.35
582 0.36
583 0.32
584 0.35
585 0.35
586 0.4
587 0.41
588 0.41
589 0.44
590 0.46
591 0.46
592 0.46
593 0.39
594 0.32
595 0.31
596 0.27
597 0.24
598 0.23
599 0.22
600 0.24
601 0.23
602 0.28
603 0.33
604 0.34
605 0.31
606 0.33
607 0.33
608 0.27
609 0.28
610 0.24
611 0.18
612 0.24
613 0.26
614 0.29
615 0.39
616 0.4
617 0.4
618 0.4
619 0.39
620 0.33
621 0.3
622 0.27
623 0.22
624 0.28
625 0.29
626 0.29
627 0.29
628 0.3
629 0.3
630 0.27
631 0.24
632 0.25
633 0.26
634 0.26
635 0.28
636 0.29
637 0.3
638 0.29
639 0.26
640 0.17
641 0.15
642 0.13
643 0.1
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.09
657 0.11
658 0.11
659 0.14
660 0.14
661 0.14
662 0.15
663 0.14
664 0.11
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.08
681 0.07
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.1
690 0.1
691 0.14
692 0.14
693 0.13
694 0.15
695 0.15
696 0.14
697 0.16
698 0.16
699 0.15
700 0.17
701 0.17
702 0.23
703 0.24
704 0.28
705 0.27
706 0.28
707 0.25
708 0.24
709 0.24
710 0.18
711 0.15
712 0.14
713 0.13
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.14
718 0.13
719 0.13
720 0.11
721 0.1
722 0.08
723 0.08
724 0.1
725 0.1
726 0.11
727 0.11
728 0.1
729 0.12
730 0.12
731 0.15
732 0.15
733 0.16
734 0.16
735 0.16
736 0.16
737 0.15
738 0.17
739 0.14
740 0.16
741 0.15
742 0.15
743 0.16
744 0.19
745 0.19
746 0.17
747 0.18
748 0.16
749 0.19
750 0.25
751 0.35
752 0.38
753 0.4
754 0.46
755 0.47
756 0.52
757 0.52
758 0.49
759 0.41
760 0.42
761 0.43
762 0.48
763 0.51
764 0.46
765 0.43
766 0.43
767 0.46
768 0.39
769 0.37
770 0.31
771 0.27
772 0.29
773 0.35
774 0.36
775 0.33
776 0.33
777 0.35
778 0.35
779 0.35
780 0.35
781 0.32
782 0.28
783 0.33
784 0.36
785 0.37
786 0.33
787 0.36
788 0.35
789 0.35
790 0.33
791 0.32
792 0.33
793 0.38
794 0.37
795 0.39
796 0.41
797 0.39
798 0.41
799 0.37
800 0.34
801 0.3
802 0.33
803 0.32
804 0.31
805 0.3
806 0.29
807 0.29
808 0.3
809 0.32
810 0.31
811 0.33
812 0.36
813 0.37
814 0.39
815 0.41
816 0.4
817 0.35
818 0.37
819 0.38
820 0.37
821 0.44
822 0.49
823 0.48
824 0.5
825 0.58
826 0.59
827 0.57
828 0.57
829 0.54
830 0.53
831 0.54
832 0.5
833 0.49
834 0.53
835 0.48
836 0.45
837 0.41
838 0.33
839 0.28
840 0.28
841 0.19
842 0.1
843 0.08
844 0.07
845 0.07
846 0.07
847 0.06
848 0.06
849 0.1
850 0.14
851 0.19
852 0.2
853 0.22
854 0.23
855 0.27
856 0.35
857 0.36
858 0.38
859 0.35
860 0.35
861 0.35
862 0.34
863 0.31
864 0.22
865 0.17
866 0.12
867 0.1
868 0.09
869 0.07
870 0.09
871 0.11
872 0.11
873 0.12
874 0.14
875 0.19
876 0.28
877 0.29
878 0.27
879 0.28
880 0.29
881 0.31
882 0.38
883 0.42
884 0.43
885 0.45
886 0.49
887 0.53
888 0.6
889 0.58
890 0.51
891 0.51
892 0.5
893 0.57
894 0.59
895 0.59
896 0.62
897 0.71
898 0.79
899 0.8
900 0.79
901 0.81
902 0.83
903 0.81
904 0.76
905 0.69
906 0.62
907 0.57
908 0.51
909 0.4
910 0.31
911 0.27
912 0.22
913 0.2
914 0.19
915 0.15
916 0.14
917 0.16
918 0.2
919 0.22
920 0.24
921 0.3
922 0.37
923 0.45
924 0.51
925 0.57
926 0.56
927 0.59
928 0.61
929 0.61
930 0.58
931 0.51
932 0.5
933 0.49
934 0.49
935 0.51
936 0.52
937 0.55
938 0.52
939 0.6
940 0.61
941 0.55
942 0.56
943 0.55
944 0.59
945 0.58
946 0.57
947 0.54
948 0.53
949 0.55
950 0.57
951 0.52
952 0.46
953 0.41
954 0.4
955 0.33
956 0.29
957 0.3
958 0.27
959 0.27
960 0.22
961 0.2
962 0.19
963 0.22
964 0.21
965 0.16
966 0.14
967 0.13
968 0.13
969 0.12
970 0.12
971 0.08
972 0.08
973 0.07
974 0.08
975 0.07
976 0.08
977 0.07
978 0.07
979 0.07
980 0.08
981 0.09
982 0.09
983 0.11
984 0.11
985 0.12
986 0.11
987 0.11
988 0.1
989 0.08
990 0.09
991 0.09
992 0.12
993 0.12
994 0.14
995 0.18
996 0.18
997 0.21
998 0.22
999 0.23
1000 0.22
1001 0.23
1002 0.22
1003 0.2
1004 0.22
1005 0.2
1006 0.21
1007 0.2
1008 0.19
1009 0.16
1010 0.17
1011 0.22
1012 0.26
1013 0.26
1014 0.28
1015 0.31
1016 0.34
1017 0.36
1018 0.37
1019 0.35
1020 0.35
1021 0.42
1022 0.43
1023 0.44
1024 0.42
1025 0.43
1026 0.43
1027 0.41
1028 0.39
1029 0.36
1030 0.37
1031 0.33
1032 0.35
1033 0.36
1034 0.37
1035 0.4
1036 0.42
1037 0.4
1038 0.4
1039 0.44
1040 0.41
1041 0.39
1042 0.38
1043 0.35
1044 0.32
1045 0.35
1046 0.32
1047 0.28
1048 0.31
1049 0.34
1050 0.33
1051 0.32
1052 0.38
1053 0.35
1054 0.37
1055 0.36
1056 0.32
1057 0.3
1058 0.32
1059 0.3
1060 0.24
1061 0.23
1062 0.25
1063 0.29
1064 0.34
1065 0.36
1066 0.39
1067 0.46
1068 0.5
1069 0.51
1070 0.46
1071 0.48
1072 0.47
1073 0.46
1074 0.43
1075 0.4
1076 0.36
1077 0.38
1078 0.4
1079 0.33
1080 0.33
1081 0.36
1082 0.39
1083 0.43
1084 0.47
1085 0.49
1086 0.49
1087 0.51