FuNGI

A0A4T0M678

Protein Details

Accession

A0A4T0M678

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
799-819	YTPDKRYQRADWRKRPLTNKM	Hydrophilic
1158-1205	DDIATIGKQPEKKRKRKDKGEKKEKANAKDKSDKKDKKGKLEVPEFNY	Basic
1216-1242	LDDLSQSTKKPKKQRIKANLEGQFRRP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1166-1197	QPEKKRKRKDKGEKKEKANAKDKSDKKDKKGK
1224-1232	KKPKKQRIK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 3, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR012588 Exosome-assoc_fac_Rrp6_N IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR008949 Isoprenoid_synthase_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like IPR002060 Squ/phyt_synthse IPR006449 Squal_synth-like IPR019845 Squalene/phytoene_synthase_CS IPR033904 Trans_IPPS_HH
Gene Ontology	GO:0000176 C:nuclear exosome (RNase complex) GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0004310 F:farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0051996 F:squalene synthase activity GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0008610 P:lipid biosynthetic process
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF00570 HRDC PF08066 PMC2NT PF00494 SQS_PSY
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC PS01044 SQUALEN_PHYTOEN_SYN_1 PS01045 SQUALEN_PHYTOEN_SYN_2
CDD	cd06147 Rrp6p_like_exo cd00683 Trans_IPPS_HH

Amino Acid Sequences

MSATDLVKLALTHPLEFRTLLQYKIWYEPKRDITSPEEHATTGFDRESMRTCWDFLDKTSRSFAPVIKELDSVLARVICIFYLVLRGLDTVEDDMTIPLDVKEPILRSFHQKLYEPGWNFTESGPEEKDRHLLVKFHAVIDEFLLLDDECKKVIADITKKMGNGMADYCAAAERGQSGVEDIKDFDLYCHFVAGLVGEGLSGLFAATKLEKPFIADQLELSNSMGLFLQKTNILRDYREDVDLGREFWPMSLVKQQGFNSRADLKEPGNEEKALWVISSMVLDALRHAPDVLDYLALLKNQSVFNFAAIPQVHAIATLEACFMNPDILHKNVKIRKAAAVKILMTIRNPRDVAEKFVFYSRKIHEKLSPADPNFIKLSVALSRIEQWTERRFPSLLQFVAGHIDIKKSDKRYITFAEQEKLVSERNDAEKAARIAKDGSFDPDSTASADQVPWSLTKGFNLLDNDQDQEKRMSTEEDKIDLKIKNLQKSAINLTKISKNLLKSDDLSFQKSIDSGFSGRCEEIEDGVVDNINQLIGFINNKSRHLDADDLTGDSKAVGELVDQLLEDSSINIDKHTNNYNKPTLAKELEPSIFNDKSIQRKPQLKWSSSIDNSDSPWKPLLTHKPNAKADLTWTTVDDRLSHPYQIEIESIKYPAQQLKTQTPIKQGDFNQTPFKWIDNEESLNYLLDRLSTATEIAIDLEHHDFRSYRGFVCLMQISIRGEDFIIDTLELRDQLIKLNDTFTNPAIVKVFHGADSDIVWLQRDFGVYIVNMFDTYHATKVLGFSQHSLASLLIKFCGYTPDKRYQRADWRKRPLTNKMLEYARSDTHYLLYIYDMLRNTLIEKSSKKNDMLKDVLQRSEQVSLKTHHRDPYDYDTGKGFGGWYNLATKWNKVVEPPLLEVFRRLHQWRDQIARKEDESVHVIFSNHQLYDLALKQPKTPQEITNVFQKKVPQFVRIHLKDVAQCINSGVEFAKNNSDKLPARVVPKSLLQPNNVHLPFKTGLDFDLWNINQSNSANSASQTSLSTSTRSKLFGEDSTKQAPQASTSKLFGDVTTTVLPKKSKTMDSISSSFKLISLIPHSTSNTEYDLDAFDEYKRPITQKAPPMPARVDEVLKEDKQKMEQEKKENEDSSMAEVPYKSKAERMADNIPIDAGITADDIATIGKQPEKKRKRKDKGEKKEKANAKDKSDKKDKKGKLEVPEFNYDNEESVLDRPLDDLSQSTKKPKKQRIKANLEGQFRRPGSSKTMQSSGNRSHTFKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.24
4	0.25
5	0.27
6	0.28
7	0.27
8	0.28
9	0.31
10	0.32
11	0.4
12	0.48
13	0.43
14	0.47
15	0.54
16	0.6
17	0.62
18	0.61
19	0.57
20	0.54
21	0.56
22	0.57
23	0.52
24	0.44
25	0.37
26	0.35
27	0.34
28	0.3
29	0.26
30	0.2
31	0.17
32	0.18
33	0.2
34	0.24
35	0.23
36	0.28
37	0.26
38	0.27
39	0.29
40	0.33
41	0.32
42	0.31
43	0.39
44	0.35
45	0.36
46	0.41
47	0.38
48	0.36
49	0.37
50	0.37
51	0.34
52	0.38
53	0.38
54	0.35
55	0.35
56	0.31
57	0.33
58	0.3
59	0.23
60	0.19
61	0.17
62	0.14
63	0.15
64	0.15
65	0.1
66	0.1
67	0.09
68	0.07
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.11
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.1
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.08
85	0.07
86	0.09
87	0.09
88	0.1
89	0.14
90	0.15
91	0.18
92	0.22
93	0.24
94	0.3
95	0.36
96	0.4
97	0.42
98	0.42
99	0.44
100	0.46
101	0.53
102	0.47
103	0.44
104	0.42
105	0.38
106	0.36
107	0.32
108	0.33
109	0.26
110	0.28
111	0.28
112	0.29
113	0.3
114	0.31
115	0.35
116	0.29
117	0.31
118	0.3
119	0.3
120	0.28
121	0.36
122	0.36
123	0.32
124	0.32
125	0.29
126	0.27
127	0.25
128	0.22
129	0.12
130	0.11
131	0.11
132	0.09
133	0.1
134	0.11
135	0.1
136	0.09
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.14
141	0.22
142	0.26
143	0.32
144	0.37
145	0.39
146	0.39
147	0.39
148	0.37
149	0.29
150	0.26
151	0.21
152	0.18
153	0.15
154	0.15
155	0.15
156	0.13
157	0.12
158	0.1
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.09
165	0.12
166	0.13
167	0.14
168	0.13
169	0.14
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.13
174	0.15
175	0.14
176	0.14
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.11
181	0.09
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.02
190	0.03
191	0.03
192	0.05
193	0.07
194	0.11
195	0.13
196	0.15
197	0.15
198	0.19
199	0.22
200	0.25
201	0.26
202	0.22
203	0.22
204	0.23
205	0.24
206	0.21
207	0.18
208	0.14
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.1
216	0.12
217	0.14
218	0.17
219	0.22
220	0.23
221	0.23
222	0.27
223	0.31
224	0.31
225	0.3
226	0.27
227	0.22
228	0.27
229	0.27
230	0.24
231	0.19
232	0.18
233	0.16
234	0.16
235	0.18
236	0.12
237	0.13
238	0.19
239	0.2
240	0.21
241	0.27
242	0.29
243	0.35
244	0.36
245	0.35
246	0.33
247	0.35
248	0.34
249	0.31
250	0.32
251	0.25
252	0.28
253	0.31
254	0.31
255	0.29
256	0.29
257	0.27
258	0.25
259	0.25
260	0.2
261	0.15
262	0.11
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.08
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.11
278	0.1
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.11
287	0.13
288	0.13
289	0.15
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.15
294	0.18
295	0.17
296	0.18
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.13
301	0.13
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.1
313	0.13
314	0.16
315	0.19
316	0.2
317	0.29
318	0.33
319	0.38
320	0.38
321	0.36
322	0.41
323	0.44
324	0.46
325	0.42
326	0.41
327	0.36
328	0.36
329	0.37
330	0.31
331	0.27
332	0.31
333	0.28
334	0.3
335	0.29
336	0.26
337	0.31
338	0.31
339	0.36
340	0.31
341	0.31
342	0.27
343	0.32
344	0.33
345	0.27
346	0.32
347	0.29
348	0.35
349	0.35
350	0.37
351	0.37
352	0.42
353	0.46
354	0.48
355	0.52
356	0.44
357	0.49
358	0.46
359	0.43
360	0.38
361	0.33
362	0.25
363	0.17
364	0.18
365	0.14
366	0.15
367	0.13
368	0.12
369	0.15
370	0.16
371	0.17
372	0.16
373	0.19
374	0.24
375	0.29
376	0.29
377	0.29
378	0.28
379	0.28
380	0.33
381	0.34
382	0.27
383	0.24
384	0.23
385	0.2
386	0.22
387	0.21
388	0.16
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.15
393	0.19
394	0.21
395	0.26
396	0.3
397	0.32
398	0.36
399	0.4
400	0.41
401	0.44
402	0.43
403	0.4
404	0.35
405	0.33
406	0.29
407	0.26
408	0.22
409	0.15
410	0.14
411	0.15
412	0.18
413	0.19
414	0.19
415	0.18
416	0.21
417	0.22
418	0.25
419	0.22
420	0.2
421	0.2
422	0.21
423	0.22
424	0.18
425	0.21
426	0.18
427	0.18
428	0.18
429	0.17
430	0.16
431	0.16
432	0.15
433	0.11
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.07
440	0.09
441	0.1
442	0.09
443	0.1
444	0.12
445	0.11
446	0.14
447	0.17
448	0.16
449	0.17
450	0.18
451	0.19
452	0.19
453	0.19
454	0.16
455	0.15
456	0.15
457	0.13
458	0.13
459	0.16
460	0.16
461	0.22
462	0.23
463	0.24
464	0.24
465	0.24
466	0.29
467	0.25
468	0.25
469	0.26
470	0.29
471	0.32
472	0.33
473	0.34
474	0.31
475	0.34
476	0.4
477	0.37
478	0.34
479	0.29
480	0.3
481	0.32
482	0.3
483	0.3
484	0.26
485	0.22
486	0.25
487	0.26
488	0.25
489	0.23
490	0.26
491	0.3
492	0.28
493	0.3
494	0.26
495	0.24
496	0.22
497	0.2
498	0.18
499	0.11
500	0.11
501	0.09
502	0.09
503	0.1
504	0.12
505	0.11
506	0.11
507	0.13
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.1
512	0.08
513	0.09
514	0.08
515	0.06
516	0.06
517	0.05
518	0.04
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.13
526	0.14
527	0.16
528	0.18
529	0.18
530	0.18
531	0.2
532	0.22
533	0.15
534	0.18
535	0.17
536	0.16
537	0.15
538	0.14
539	0.12
540	0.09
541	0.08
542	0.04
543	0.04
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.03
555	0.04
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.08
560	0.09
561	0.12
562	0.19
563	0.23
564	0.24
565	0.29
566	0.32
567	0.31
568	0.33
569	0.32
570	0.29
571	0.27
572	0.25
573	0.21
574	0.22
575	0.21
576	0.2
577	0.2
578	0.21
579	0.19
580	0.18
581	0.21
582	0.2
583	0.27
584	0.3
585	0.33
586	0.34
587	0.42
588	0.44
589	0.51
590	0.55
591	0.49
592	0.48
593	0.47
594	0.48
595	0.41
596	0.42
597	0.33
598	0.27
599	0.27
600	0.3
601	0.26
602	0.2
603	0.2
604	0.18
605	0.17
606	0.22
607	0.32
608	0.31
609	0.37
610	0.4
611	0.48
612	0.49
613	0.5
614	0.45
615	0.35
616	0.31
617	0.29
618	0.26
619	0.18
620	0.17
621	0.16
622	0.17
623	0.17
624	0.15
625	0.13
626	0.15
627	0.16
628	0.16
629	0.14
630	0.14
631	0.14
632	0.14
633	0.14
634	0.09
635	0.09
636	0.1
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.1
641	0.13
642	0.15
643	0.16
644	0.19
645	0.23
646	0.29
647	0.33
648	0.34
649	0.37
650	0.39
651	0.37
652	0.39
653	0.36
654	0.38
655	0.37
656	0.37
657	0.37
658	0.32
659	0.33
660	0.28
661	0.28
662	0.21
663	0.19
664	0.2
665	0.17
666	0.19
667	0.17
668	0.18
669	0.17
670	0.15
671	0.14
672	0.1
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.04
685	0.04
686	0.05
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.09
693	0.15
694	0.14
695	0.13
696	0.15
697	0.15
698	0.15
699	0.17
700	0.17
701	0.12
702	0.11
703	0.12
704	0.11
705	0.11
706	0.1
707	0.08
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.06
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.09
722	0.11
723	0.11
724	0.11
725	0.14
726	0.14
727	0.15
728	0.16
729	0.14
730	0.16
731	0.15
732	0.16
733	0.14
734	0.13
735	0.12
736	0.13
737	0.13
738	0.1
739	0.1
740	0.09
741	0.09
742	0.09
743	0.1
744	0.08
745	0.07
746	0.08
747	0.07
748	0.07
749	0.08
750	0.08
751	0.07
752	0.06
753	0.08
754	0.07
755	0.07
756	0.07
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.08
762	0.09
763	0.09
764	0.09
765	0.09
766	0.09
767	0.11
768	0.13
769	0.13
770	0.12
771	0.13
772	0.15
773	0.15
774	0.15
775	0.15
776	0.12
777	0.11
778	0.12
779	0.11
780	0.09
781	0.08
782	0.08
783	0.08
784	0.14
785	0.15
786	0.19
787	0.24
788	0.34
789	0.39
790	0.43
791	0.47
792	0.48
793	0.57
794	0.63
795	0.69
796	0.68
797	0.75
798	0.77
799	0.8
800	0.8
801	0.78
802	0.76
803	0.71
804	0.64
805	0.59
806	0.54
807	0.48
808	0.45
809	0.39
810	0.31
811	0.27
812	0.25
813	0.2
814	0.19
815	0.19
816	0.15
817	0.12
818	0.12
819	0.12
820	0.11
821	0.14
822	0.13
823	0.12
824	0.12
825	0.12
826	0.12
827	0.12
828	0.13
829	0.14
830	0.17
831	0.22
832	0.29
833	0.33
834	0.35
835	0.39
836	0.41
837	0.44
838	0.46
839	0.45
840	0.47
841	0.46
842	0.45
843	0.39
844	0.36
845	0.31
846	0.33
847	0.3
848	0.23
849	0.24
850	0.25
851	0.31
852	0.36
853	0.39
854	0.38
855	0.38
856	0.38
857	0.4
858	0.45
859	0.47
860	0.42
861	0.39
862	0.35
863	0.33
864	0.31
865	0.26
866	0.18
867	0.1
868	0.11
869	0.1
870	0.1
871	0.12
872	0.12
873	0.18
874	0.18
875	0.18
876	0.21
877	0.23
878	0.22
879	0.21
880	0.25
881	0.24
882	0.26
883	0.27
884	0.26
885	0.25
886	0.25
887	0.26
888	0.24
889	0.22
890	0.26
891	0.25
892	0.27
893	0.31
894	0.39
895	0.42
896	0.49
897	0.55
898	0.56
899	0.6
900	0.59
901	0.54
902	0.51
903	0.45
904	0.4
905	0.35
906	0.28
907	0.23
908	0.21
909	0.2
910	0.17
911	0.2
912	0.19
913	0.16
914	0.15
915	0.14
916	0.13
917	0.17
918	0.18
919	0.2
920	0.22
921	0.22
922	0.25
923	0.3
924	0.34
925	0.36
926	0.37
927	0.33
928	0.38
929	0.42
930	0.41
931	0.46
932	0.46
933	0.4
934	0.39
935	0.43
936	0.37
937	0.42
938	0.43
939	0.4
940	0.38
941	0.45
942	0.54
943	0.5
944	0.51
945	0.44
946	0.45
947	0.39
948	0.41
949	0.38
950	0.27
951	0.25
952	0.22
953	0.21
954	0.18
955	0.16
956	0.13
957	0.11
958	0.12
959	0.13
960	0.21
961	0.21
962	0.22
963	0.23
964	0.28
965	0.27
966	0.3
967	0.35
968	0.3
969	0.35
970	0.37
971	0.38
972	0.34
973	0.37
974	0.4
975	0.41
976	0.41
977	0.4
978	0.4
979	0.41
980	0.48
981	0.44
982	0.39
983	0.31
984	0.32
985	0.29
986	0.28
987	0.26
988	0.16
989	0.16
990	0.18
991	0.18
992	0.14
993	0.21
994	0.2
995	0.2
996	0.21
997	0.2
998	0.21
999	0.21
1000	0.21
1001	0.16
1002	0.18
1003	0.16
1004	0.15
1005	0.18
1006	0.15
1007	0.16
1008	0.15
1009	0.14
1010	0.16
1011	0.17
1012	0.19
1013	0.19
1014	0.21
1015	0.22
1016	0.23
1017	0.22
1018	0.22
1019	0.24
1020	0.28
1021	0.33
1022	0.34
1023	0.37
1024	0.39
1025	0.39
1026	0.36
1027	0.36
1028	0.3
1029	0.27
1030	0.29
1031	0.3
1032	0.28
1033	0.29
1034	0.3
1035	0.29
1036	0.29
1037	0.24
1038	0.22
1039	0.17
1040	0.17
1041	0.19
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.22
1045	0.24
1046	0.21
1047	0.28
1048	0.3
1049	0.31
1050	0.35
1051	0.41
1052	0.44
1053	0.49
1054	0.51
1055	0.49
1056	0.45
1057	0.42
1058	0.37
1059	0.3
1060	0.24
1061	0.18
1062	0.18
1063	0.18
1064	0.2
1065	0.21
1066	0.24
1067	0.25
1068	0.25
1069	0.26
1070	0.24
1071	0.22
1072	0.19
1073	0.18
1074	0.16
1075	0.16
1076	0.15
1077	0.14
1078	0.13
1079	0.12
1080	0.16
1081	0.17
1082	0.2
1083	0.21
1084	0.22
1085	0.26
1086	0.31
1087	0.39
1088	0.44
1089	0.52
1090	0.58
1091	0.59
1092	0.63
1093	0.6
1094	0.56
1095	0.54
1096	0.47
1097	0.4
1098	0.32
1099	0.33
1100	0.34
1101	0.34
1102	0.37
1103	0.35
1104	0.35
1105	0.38
1106	0.44
1107	0.49
1108	0.53
1109	0.59
1110	0.63
1111	0.69
1112	0.71
1113	0.74
1114	0.68
1115	0.59
1116	0.52
1117	0.45
1118	0.41
1119	0.36
1120	0.3
1121	0.25
1122	0.24
1123	0.24
1124	0.26
1125	0.27
1126	0.22
1127	0.22
1128	0.28
1129	0.31
1130	0.36
1131	0.41
1132	0.43
1133	0.46
1134	0.46
1135	0.43
1136	0.36
1137	0.31
1138	0.25
1139	0.19
1140	0.12
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.05
1148	0.06
1149	0.07
1150	0.09
1151	0.14
1152	0.2
1153	0.3
1154	0.41
1155	0.52
1156	0.62
1157	0.72
1158	0.81
1159	0.87
1160	0.93
1161	0.95
1162	0.95
1163	0.96
1164	0.97
1165	0.96
1166	0.93
1167	0.92
1168	0.89
1169	0.87
1170	0.86
1171	0.82
1172	0.8
1173	0.8
1174	0.79
1175	0.79
1176	0.81
1177	0.81
1178	0.8
1179	0.83
1180	0.82
1181	0.82
1182	0.86
1183	0.83
1184	0.83
1185	0.84
1186	0.82
1187	0.78
1188	0.78
1189	0.69
1190	0.59
1191	0.55
1192	0.45
1193	0.36
1194	0.29
1195	0.23
1196	0.16
1197	0.17
1198	0.19
1199	0.15
1200	0.15
1201	0.14
1202	0.15
1203	0.15
1204	0.14
1205	0.14
1206	0.18
1207	0.25
1208	0.28
1209	0.38
1210	0.44
1211	0.52
1212	0.63
1213	0.71
1214	0.76
1215	0.79
1216	0.87
1217	0.88
1218	0.9
1219	0.91
1220	0.91
1221	0.88
1222	0.87
1223	0.81
1224	0.74
1225	0.73
1226	0.63
1227	0.58
1228	0.51
1229	0.46
1230	0.45
1231	0.49
1232	0.52
1233	0.48
1234	0.53
1235	0.54
1236	0.57
1237	0.61
1238	0.62
1239	0.63
1240	0.6

A0A4T0M678

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer