Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4MFF5

Protein Details
Accession A0A4V4MFF5    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31AETSHKSPSKSTKGSKKEAKDSVKRTADHydrophilic
79-100ELNFNKRATKPQKDPEAPKRPAHydrophilic
181-217DAPKKKEAAKKKAEPKENKDDKKEKKDDKKEETKPAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-23KGSKKEAK
183-243PKKKEAAKKKAEPKENKDDKKEKKDDKKEETKPAKGKAEKKEEKSSTSKSASKSKKEEKKP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR001912  Ribosomal_S4/S9_N  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00163  Ribosomal_S4  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS50889  S4  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MAIAETSHKSPSKSTKGSKKEAKDSVKRTADGSPKAESSPKREFTDLEHELFANLAVSARAMDAQLKIIKQLFADNNKELNFNKRATKPQKDPEAPKRPASAYLLFQNDLRTKKDPAQSQTEFMAHVGSEWQSLGKEEKEKYQKSYQKACEVFEKEREKYVKSGKEAAWQKQMQELGVPADAPKKKEAAKKKAEPKENKDDKKEKKDDKKEETKPAKGKAEKKEEKSSTSKSASKSKKEEKKPEPTPAAEESDESVSESSDSESDSDSGSSDSDSSESESEPEPLPEPPKKQAKKVLTVMRNLKHHEQKLLKKVDFLNWKQDASLREIKVMRRYHLQGRDDYNKYNRLCGSMRQMAHRLSLLSAQDPYRHQMETQLLAKGYEMGLLNIGSKLSDVEKITVASFCRRRLAVVCVRNKLCESVKTATQYIEQGHLRVGPDTITDPAFLVTRNMEDFVTWVDTSKIKRTVMNYNDELDDFDLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.67
3 0.73
4 0.82
5 0.85
6 0.84
7 0.83
8 0.84
9 0.84
10 0.84
11 0.81
12 0.81
13 0.79
14 0.7
15 0.63
16 0.61
17 0.6
18 0.56
19 0.53
20 0.47
21 0.42
22 0.43
23 0.48
24 0.44
25 0.43
26 0.46
27 0.5
28 0.49
29 0.49
30 0.48
31 0.47
32 0.53
33 0.49
34 0.42
35 0.37
36 0.33
37 0.31
38 0.3
39 0.23
40 0.13
41 0.09
42 0.07
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.09
50 0.09
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.2
55 0.22
56 0.22
57 0.2
58 0.27
59 0.29
60 0.33
61 0.39
62 0.39
63 0.41
64 0.41
65 0.44
66 0.38
67 0.39
68 0.37
69 0.35
70 0.39
71 0.4
72 0.5
73 0.56
74 0.65
75 0.66
76 0.7
77 0.78
78 0.78
79 0.82
80 0.83
81 0.84
82 0.78
83 0.74
84 0.69
85 0.6
86 0.56
87 0.51
88 0.44
89 0.37
90 0.39
91 0.37
92 0.33
93 0.32
94 0.34
95 0.33
96 0.33
97 0.33
98 0.3
99 0.31
100 0.38
101 0.44
102 0.45
103 0.45
104 0.52
105 0.49
106 0.49
107 0.48
108 0.41
109 0.34
110 0.27
111 0.23
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.09
121 0.11
122 0.13
123 0.18
124 0.19
125 0.28
126 0.37
127 0.39
128 0.44
129 0.51
130 0.55
131 0.57
132 0.66
133 0.62
134 0.62
135 0.62
136 0.58
137 0.56
138 0.55
139 0.5
140 0.49
141 0.5
142 0.42
143 0.47
144 0.47
145 0.4
146 0.41
147 0.46
148 0.44
149 0.41
150 0.47
151 0.41
152 0.48
153 0.52
154 0.5
155 0.51
156 0.46
157 0.43
158 0.4
159 0.39
160 0.3
161 0.25
162 0.21
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.08
167 0.15
168 0.17
169 0.18
170 0.18
171 0.2
172 0.26
173 0.33
174 0.43
175 0.46
176 0.54
177 0.61
178 0.7
179 0.75
180 0.8
181 0.81
182 0.78
183 0.79
184 0.8
185 0.77
186 0.75
187 0.77
188 0.76
189 0.78
190 0.8
191 0.78
192 0.79
193 0.84
194 0.84
195 0.84
196 0.85
197 0.81
198 0.83
199 0.8
200 0.77
201 0.72
202 0.68
203 0.67
204 0.63
205 0.64
206 0.63
207 0.67
208 0.66
209 0.66
210 0.7
211 0.64
212 0.62
213 0.6
214 0.55
215 0.5
216 0.48
217 0.46
218 0.39
219 0.47
220 0.49
221 0.5
222 0.54
223 0.57
224 0.62
225 0.67
226 0.75
227 0.73
228 0.77
229 0.75
230 0.75
231 0.69
232 0.61
233 0.55
234 0.47
235 0.42
236 0.32
237 0.27
238 0.2
239 0.17
240 0.16
241 0.12
242 0.1
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.16
273 0.19
274 0.22
275 0.27
276 0.37
277 0.39
278 0.44
279 0.52
280 0.53
281 0.57
282 0.62
283 0.63
284 0.58
285 0.63
286 0.64
287 0.6
288 0.58
289 0.55
290 0.54
291 0.53
292 0.5
293 0.51
294 0.52
295 0.54
296 0.6
297 0.64
298 0.57
299 0.53
300 0.53
301 0.52
302 0.54
303 0.48
304 0.48
305 0.42
306 0.42
307 0.38
308 0.39
309 0.34
310 0.32
311 0.37
312 0.28
313 0.31
314 0.34
315 0.37
316 0.42
317 0.43
318 0.38
319 0.37
320 0.41
321 0.44
322 0.49
323 0.49
324 0.46
325 0.51
326 0.56
327 0.53
328 0.54
329 0.51
330 0.5
331 0.48
332 0.47
333 0.4
334 0.37
335 0.36
336 0.35
337 0.38
338 0.37
339 0.38
340 0.38
341 0.42
342 0.38
343 0.38
344 0.35
345 0.27
346 0.21
347 0.23
348 0.19
349 0.16
350 0.18
351 0.17
352 0.2
353 0.2
354 0.23
355 0.21
356 0.21
357 0.19
358 0.23
359 0.26
360 0.28
361 0.29
362 0.28
363 0.26
364 0.26
365 0.26
366 0.21
367 0.17
368 0.14
369 0.12
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.12
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.17
386 0.18
387 0.19
388 0.24
389 0.28
390 0.29
391 0.33
392 0.32
393 0.34
394 0.35
395 0.42
396 0.43
397 0.47
398 0.52
399 0.56
400 0.57
401 0.57
402 0.55
403 0.51
404 0.46
405 0.41
406 0.4
407 0.36
408 0.39
409 0.41
410 0.41
411 0.37
412 0.35
413 0.34
414 0.29
415 0.32
416 0.28
417 0.24
418 0.24
419 0.25
420 0.24
421 0.21
422 0.2
423 0.14
424 0.14
425 0.15
426 0.16
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.14
431 0.14
432 0.12
433 0.13
434 0.12
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.15
439 0.14
440 0.15
441 0.16
442 0.18
443 0.16
444 0.15
445 0.16
446 0.2
447 0.24
448 0.31
449 0.34
450 0.32
451 0.37
452 0.41
453 0.49
454 0.52
455 0.57
456 0.51
457 0.48
458 0.48
459 0.44
460 0.41