FuNGI

A0A4T0R8H5

Protein Details

Accession

A0A4T0R8H5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-53	TGFPIPKIRSQFKKSRKKTEEPVAGTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, mito 3, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MLSDIVEKDVNSHAEAPAPAPPSAPVTGFPIPKIRSQFKKSRKKTEEPVAGTSAIANAASAVHDQSIDAENRNLIAKMSKEEILQEQEDIEEKLGAKMVEFLRKRAAKKETIDEQPIGDVYEQQMLERKQEDAGKEEFREGAAKVQRKSVRIQEKQPADDHQPDSTQRIIREKYFPDAKYNEDQHSWLTSLPPPSEESKGDTLRFDFHGNLMTGKKEAYLEGMHHHGLDQGSPGYTVDEFLMLSGSTNISQRILSLRSLSHILLKWYKREYTDETVQKLDYVQLGKAILSLRFAMSESNKSVVVAGLSGVASIVLEELHLDKHLNNGLTYAESASSTLKVYSGQLNLQPSEMKELLSTPLAFLTFRTDLADTLNDLLKGTAVIAGDNNEIKKVANIIFALSKHSIKTASECVNTPLFIERVVKTFIEKDWPSDEKPDSLAINALSAIAAASRSNASAIRSGKAVDVASRYLTIPPFKTSRKDAWFLAIESLILMRTMANYGIVQGVSAVELISGDCIRWLSNQKEELPSHSSAFIRALFETLEMWTICAIDPHHTSPHHIIVWTQVESFIDMALAALQGVRDELTIASVWSYLSIWLRGNKGVADKAKWLEEYINIEDTEKTFDHYSQTAINLLAQDDYENAASSLCIVNATTRLLSHIGPYNLPKELIDVLLNTVTETNTAAYNKLRPGLDALCRNILQSNLDNTENIHKALQLLTVLREGDESIVVAVLSHLLQNASPRVISTVTGFPEREAKASKETTVPLLIETAKLMLVDGIYSGISIHSNHLSQISTLTIPFDANTLLYENWALKITLDELSQSANSEALKNLPAHWNYSEVDLVMGGLTLQEMINKIMGTSCSKQLLQLMRIFLLELGVEGGEVFRNERVQIALERTLHKVLTGLENDKYTLEDAQEEARADIPFYQIYTDYVGLFESISLGDRNTAIMLFPPLLLAQEYRRLLWVDHAACVKSIKLTWTDFPKWFVNKLLFPLEHNVDVIRAYARAISTKSLVLDIQPLAYWIALHHSSLCLWHTQDEALRRDLIVALLSTHPETAKMVIQYDNDEHNLKLPGQAKASPEIIQRRLDCLKDNDETL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.21
4	0.22
5	0.23
6	0.21
7	0.2
8	0.21
9	0.21
10	0.23
11	0.22
12	0.18
13	0.22
14	0.28
15	0.28
16	0.3
17	0.34
18	0.34
19	0.39
20	0.46
21	0.49
22	0.52
23	0.6
24	0.68
25	0.71
26	0.8
27	0.84
28	0.87
29	0.87
30	0.87
31	0.88
32	0.88
33	0.88
34	0.82
35	0.77
36	0.69
37	0.61
38	0.51
39	0.41
40	0.31
41	0.21
42	0.15
43	0.1
44	0.06
45	0.06
46	0.07
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.08
52	0.1
53	0.15
54	0.16
55	0.18
56	0.18
57	0.18
58	0.19
59	0.21
60	0.19
61	0.15
62	0.18
63	0.18
64	0.2
65	0.23
66	0.24
67	0.23
68	0.26
69	0.29
70	0.3
71	0.29
72	0.26
73	0.22
74	0.21
75	0.23
76	0.2
77	0.16
78	0.13
79	0.12
80	0.13
81	0.15
82	0.14
83	0.12
84	0.18
85	0.21
86	0.28
87	0.29
88	0.31
89	0.38
90	0.44
91	0.47
92	0.49
93	0.53
94	0.52
95	0.56
96	0.63
97	0.61
98	0.63
99	0.65
100	0.57
101	0.51
102	0.44
103	0.38
104	0.31
105	0.23
106	0.16
107	0.13
108	0.17
109	0.16
110	0.15
111	0.22
112	0.22
113	0.26
114	0.26
115	0.25
116	0.24
117	0.28
118	0.3
119	0.27
120	0.32
121	0.32
122	0.32
123	0.33
124	0.29
125	0.25
126	0.26
127	0.22
128	0.25
129	0.28
130	0.33
131	0.33
132	0.41
133	0.45
134	0.45
135	0.51
136	0.52
137	0.56
138	0.56
139	0.63
140	0.64
141	0.67
142	0.68
143	0.65
144	0.6
145	0.56
146	0.56
147	0.5
148	0.43
149	0.4
150	0.38
151	0.39
152	0.39
153	0.36
154	0.32
155	0.38
156	0.39
157	0.4
158	0.45
159	0.44
160	0.47
161	0.51
162	0.49
163	0.48
164	0.47
165	0.48
166	0.49
167	0.51
168	0.47
169	0.4
170	0.4
171	0.34
172	0.34
173	0.3
174	0.22
175	0.2
176	0.2
177	0.23
178	0.23
179	0.22
180	0.22
181	0.25
182	0.28
183	0.26
184	0.27
185	0.3
186	0.33
187	0.33
188	0.32
189	0.3
190	0.3
191	0.3
192	0.27
193	0.21
194	0.18
195	0.21
196	0.2
197	0.21
198	0.2
199	0.19
200	0.17
201	0.17
202	0.17
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.16
209	0.19
210	0.18
211	0.17
212	0.17
213	0.17
214	0.15
215	0.14
216	0.13
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.1
224	0.08
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.13
240	0.14
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.17
245	0.19
246	0.19
247	0.2
248	0.2
249	0.23
250	0.29
251	0.31
252	0.34
253	0.36
254	0.38
255	0.36
256	0.4
257	0.41
258	0.41
259	0.48
260	0.48
261	0.47
262	0.46
263	0.43
264	0.38
265	0.32
266	0.26
267	0.2
268	0.16
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.15
274	0.15
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.12
282	0.13
283	0.17
284	0.17
285	0.18
286	0.18
287	0.18
288	0.18
289	0.15
290	0.12
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.02
302	0.02
303	0.03
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.1
310	0.13
311	0.14
312	0.13
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.11
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.08
327	0.09
328	0.12
329	0.13
330	0.14
331	0.17
332	0.19
333	0.19
334	0.2
335	0.19
336	0.16
337	0.2
338	0.18
339	0.16
340	0.13
341	0.14
342	0.15
343	0.15
344	0.15
345	0.09
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.09
350	0.13
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.14
357	0.15
358	0.1
359	0.11
360	0.12
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.09
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.14
385	0.14
386	0.18
387	0.17
388	0.17
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.14
393	0.17
394	0.19
395	0.21
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.24
400	0.23
401	0.21
402	0.17
403	0.12
404	0.12
405	0.14
406	0.12
407	0.14
408	0.16
409	0.15
410	0.14
411	0.16
412	0.15
413	0.2
414	0.19
415	0.2
416	0.23
417	0.26
418	0.26
419	0.29
420	0.29
421	0.22
422	0.23
423	0.23
424	0.18
425	0.15
426	0.15
427	0.11
428	0.1
429	0.09
430	0.07
431	0.05
432	0.05
433	0.04
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.06
442	0.07
443	0.12
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.14
449	0.15
450	0.14
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.13
459	0.14
460	0.13
461	0.16
462	0.19
463	0.21
464	0.24
465	0.27
466	0.33
467	0.35
468	0.37
469	0.34
470	0.35
471	0.34
472	0.31
473	0.27
474	0.2
475	0.15
476	0.12
477	0.11
478	0.07
479	0.05
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.06
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.02
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.04
504	0.04
505	0.07
506	0.12
507	0.13
508	0.18
509	0.21
510	0.23
511	0.27
512	0.28
513	0.29
514	0.28
515	0.28
516	0.24
517	0.23
518	0.21
519	0.17
520	0.18
521	0.15
522	0.11
523	0.1
524	0.1
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.07
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.05
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.1
539	0.11
540	0.15
541	0.15
542	0.17
543	0.18
544	0.21
545	0.19
546	0.17
547	0.15
548	0.16
549	0.18
550	0.16
551	0.14
552	0.11
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.07
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.07
582	0.09
583	0.11
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.13
588	0.14
589	0.17
590	0.18
591	0.17
592	0.18
593	0.19
594	0.2
595	0.19
596	0.18
597	0.14
598	0.15
599	0.17
600	0.16
601	0.16
602	0.15
603	0.16
604	0.15
605	0.15
606	0.16
607	0.12
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.12
615	0.12
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.09
620	0.09
621	0.08
622	0.07
623	0.06
624	0.05
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.06
638	0.08
639	0.07
640	0.06
641	0.08
642	0.09
643	0.09
644	0.11
645	0.15
646	0.15
647	0.16
648	0.18
649	0.18
650	0.17
651	0.17
652	0.15
653	0.12
654	0.12
655	0.11
656	0.1
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.07
662	0.07
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.07
668	0.08
669	0.09
670	0.1
671	0.13
672	0.14
673	0.17
674	0.17
675	0.15
676	0.18
677	0.21
678	0.25
679	0.26
680	0.27
681	0.26
682	0.26
683	0.26
684	0.24
685	0.21
686	0.18
687	0.16
688	0.18
689	0.17
690	0.18
691	0.17
692	0.17
693	0.23
694	0.21
695	0.19
696	0.16
697	0.13
698	0.14
699	0.14
700	0.14
701	0.1
702	0.09
703	0.09
704	0.11
705	0.11
706	0.1
707	0.09
708	0.09
709	0.08
710	0.07
711	0.06
712	0.04
713	0.05
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.05
723	0.07
724	0.09
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.1
729	0.11
730	0.11
731	0.12
732	0.14
733	0.15
734	0.18
735	0.18
736	0.17
737	0.22
738	0.22
739	0.22
740	0.22
741	0.22
742	0.25
743	0.27
744	0.28
745	0.24
746	0.24
747	0.24
748	0.23
749	0.21
750	0.15
751	0.16
752	0.14
753	0.12
754	0.11
755	0.09
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.05
760	0.05
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.05
769	0.06
770	0.08
771	0.09
772	0.1
773	0.1
774	0.12
775	0.12
776	0.11
777	0.11
778	0.11
779	0.1
780	0.09
781	0.1
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.07
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.09
793	0.09
794	0.09
795	0.1
796	0.09
797	0.08
798	0.09
799	0.1
800	0.11
801	0.1
802	0.1
803	0.09
804	0.11
805	0.11
806	0.11
807	0.09
808	0.09
809	0.09
810	0.1
811	0.1
812	0.1
813	0.13
814	0.13
815	0.15
816	0.21
817	0.21
818	0.23
819	0.24
820	0.25
821	0.23
822	0.25
823	0.23
824	0.16
825	0.15
826	0.11
827	0.1
828	0.07
829	0.06
830	0.04
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.03
835	0.04
836	0.05
837	0.06
838	0.08
839	0.08
840	0.08
841	0.09
842	0.11
843	0.15
844	0.17
845	0.2
846	0.22
847	0.22
848	0.24
849	0.28
850	0.32
851	0.31
852	0.32
853	0.3
854	0.27
855	0.27
856	0.27
857	0.2
858	0.15
859	0.1
860	0.07
861	0.05
862	0.05
863	0.04
864	0.04
865	0.04
866	0.05
867	0.05
868	0.06
869	0.07
870	0.09
871	0.09
872	0.1
873	0.11
874	0.13
875	0.16
876	0.19
877	0.23
878	0.25
879	0.27
880	0.29
881	0.3
882	0.27
883	0.24
884	0.21
885	0.18
886	0.22
887	0.23
888	0.23
889	0.23
890	0.24
891	0.25
892	0.24
893	0.23
894	0.17
895	0.15
896	0.12
897	0.11
898	0.12
899	0.13
900	0.16
901	0.15
902	0.15
903	0.16
904	0.15
905	0.15
906	0.15
907	0.14
908	0.12
909	0.12
910	0.13
911	0.11
912	0.12
913	0.14
914	0.14
915	0.12
916	0.12
917	0.12
918	0.1
919	0.1
920	0.09
921	0.06
922	0.05
923	0.07
924	0.07
925	0.07
926	0.08
927	0.08
928	0.09
929	0.09
930	0.09
931	0.07
932	0.08
933	0.1
934	0.1
935	0.09
936	0.09
937	0.09
938	0.1
939	0.1
940	0.11
941	0.12
942	0.19
943	0.21
944	0.2
945	0.23
946	0.23
947	0.23
948	0.27
949	0.33
950	0.26
951	0.29
952	0.31
953	0.29
954	0.29
955	0.3
956	0.25
957	0.19
958	0.19
959	0.18
960	0.19
961	0.23
962	0.28
963	0.35
964	0.4
965	0.4
966	0.43
967	0.47
968	0.46
969	0.45
970	0.45
971	0.42
972	0.39
973	0.42
974	0.45
975	0.38
976	0.36
977	0.41
978	0.38
979	0.33
980	0.31
981	0.27
982	0.2
983	0.19
984	0.18
985	0.13
986	0.09
987	0.09
988	0.11
989	0.12
990	0.15
991	0.16
992	0.18
993	0.19
994	0.21
995	0.21
996	0.2
997	0.2
998	0.17
999	0.2
1000	0.17
1001	0.16
1002	0.14
1003	0.14
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.08
1008	0.13
1009	0.13
1010	0.14
1011	0.14
1012	0.14
1013	0.15
1014	0.17
1015	0.18
1016	0.16
1017	0.16
1018	0.18
1019	0.18
1020	0.2
1021	0.24
1022	0.29
1023	0.32
1024	0.31
1025	0.3
1026	0.28
1027	0.28
1028	0.26
1029	0.22
1030	0.16
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.13
1034	0.15
1035	0.14
1036	0.15
1037	0.14
1038	0.14
1039	0.15
1040	0.15
1041	0.18
1042	0.18
1043	0.2
1044	0.22
1045	0.23
1046	0.27
1047	0.29
1048	0.31
1049	0.29
1050	0.29
1051	0.27
1052	0.27
1053	0.29
1054	0.25
1055	0.28
1056	0.29
1057	0.3
1058	0.32
1059	0.36
1060	0.35
1061	0.37
1062	0.39
1063	0.36
1064	0.39
1065	0.43
1066	0.43
1067	0.47
1068	0.45
1069	0.48
1070	0.51
1071	0.5
1072	0.49
1073	0.47
1074	0.49

A0A4T0R8H5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer